New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4930594 = | 75 (1.250) | 9 (0.160) | 6/248 | NT | 12.0% | coding (379/789 nt) | cheZ | protein phosphatase CheZ |
? | NC_002947 | 4930639 = | 62 (1.110) | coding (334/789 nt) | cheZ | protein phosphatase CheZ |
ACCGGTGCTCAATGAGCTGGCCAACGAGGCCAAGGCCCTGAGCACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4930640‑4930594 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgagcaccgGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATGGTGGGGTCGATCTGGAAACTGACGATGG > NC_002947/4930639‑4930785 ACCGGTGCTCAATGAGCTGGCCAACGAGGCCAAGGCCCTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCT > 8:256899/1‑149 CGGTGCTCAATGAGCTGGCCAACGAGGCCAAGGCCCTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGCCCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCT > 6:3499/1‑149 CGGTGCTCAATGAGCTGGCCAACGAGGCCAAGGCCCTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCT > 3:48192/1‑149 CGGTGCTCAATGAGCTGGCCAACGAGGCCAACGCCCTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCT > 5:311656/1‑149 GCTCAATGAGCTGGCCAACGAGGCCAAGGCCCTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTG > 1:360254/1‑149 GCCAACGAGGCCAAGGCCCTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATG < 4:48192/147‑1 GCCAACGAGGCCAAGGCCCTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATG < 7:256899/147‑1 CCAAGGCCCTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATGGTGGGGTCGATC < 5:3499/149‑1 CAAGGCCCTGAGCACCGGGGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATGGTGGGGTCGATCT < 2:360254/149‑1 GGCCCTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATGGTGGGGTCGATCTGGA < 6:311656/149‑1 TGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCTCATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATGGTGGG < 1:299071/133‑1 TGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATGGTGGG > 2:299071/1‑133 GAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCTGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATGGTGGGGTCGATCTGGAAACTG < 2:356806/148‑1 CGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATGGTGGGGTCGATCTGGAAACTGACGATGG < 6:249051/149‑1 CGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATGGTGGGGTCGATCTGGAAACTGACGATGG < 7:115582/149‑1 ACCGGTGCTCAATGAGCTGGCCAACGAGGCCAAGGCCCTGAGCACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4930640‑4930594 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgagcaccgGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATGGTGGGGTCGATCTGGAAACTGACGATGG > NC_002947/4930639‑4930785 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |