| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 4930594 = | 75 (1.250) | 9 (0.160) | 6/248 | NT | 12.0% | coding (379/789 nt) | cheZ | protein phosphatase CheZ |
| ? | NC_002947 | 4930639 = | 62 (1.110) | coding (334/789 nt) | cheZ | protein phosphatase CheZ | |||||
GATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACC > NC_002947/4930447‑4930739 | gATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑GTGCCAGTCg > 7:69424/1‑149 (MQ=255)gATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCg > 1:166814/1‑149 (MQ=255) ccatcgtcagtttccagatcgaccccaccatgccgcaggcagaagaggtgtcgcagattaccgacgccaccgagcgcctgtcgtatgtggtcaagctcaccgagggcgcggccaaccgcaccatggacctggtcgaggaaagcacacCg < 7:115582‑M1/2‑1 (MQ=255) ccatcgtcagtttccagatcgaccccaccatgccgcaggcagaagaggtgtcgcagattaccgacgccaccgagcgcctgtcgtatgtggtcaagctcaccgagggcgcggccaaccgcaccatggacctggtcgaggaaagcacacCg < 6:249051‑M1/2‑1 (MQ=255) aTAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCgg < 4:92272/149‑1 (MQ=255) aTAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCg < 3:353081/148‑1 (MQ=255) aTAGTCCTGGGCCAGAAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTc < 8:254062/147‑1 (MQ=255) tCCTGGGCCACCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACAAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATTAAGCG‑CTGCCAGTCTGTGc > 8:131097/1‑148 (MQ=255) ccTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCt > 3:6163/1‑148 (MQ=255) cTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTc < 3:316772/148‑1 (MQ=255) cagtttccagatcgaccccaccatgccgcaggcagaagaggtgtcgcagattaccgacgccaccgagcgcctgtcgtatgtggtcaagctcaccgagggcgcggccaaccgcaccatggaccaggtcgaggaaagcacacCGGTGCTc < 2:356806‑M1/8‑1 (MQ=255) tccagatcgaccccaccatgccgcaggcagaagaggtgtcgcagattaccgacgccaccgagcgcctgtcgtatgtggtcaagctcaccgagggcgcggccaaccgcaccatggacctggtcgaggaaagcacacCGGTGCTCAGGGcc < 6:311656‑M1/14‑1 (MQ=255) gCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTg > 5:384175/1‑149 (MQ=255) 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cGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGAc < 1:286697/149‑1 (MQ=255) cGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGAc < 3:113404/149‑1 (MQ=255) cGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGAc < 6:385297/149‑1 (MQ=255) ttCCGGCGCAGCCACTTGGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACAt < 7:131097/149‑1 (MQ=255) cGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACg < 4:6163/149‑1 (MQ=255) ggCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGa > 7:187328/1‑149 (MQ=255) gcAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAg < 5:224045/149‑1 (MQ=255) gcAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAg < 6:39127/149‑1 (MQ=255) gcAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAg < 2:138753/149‑1 (MQ=255) aGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCgg < 7:350881/125‑1 (MQ=255) aGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCgg > 8:350881/1‑125 (MQ=255) aGCAACTTCGCTGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTAAGTGCCTTGGCGTCGTTGGCCAGCTCATTGAGAACGGGTGTGCTTTCCTCTACGAGGGCAATGGTGCGGTTTGCCGCGCCCTCGGTGTGCTTGACCACATACGTCatgg < 4:23507/149‑4 (MQ=255) ccACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCCCATACGACAGgcg > 1:356806/1‑148 (MQ=255) ttCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCgg > 5:359204/1‑149 (MQ=255) cgcgGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGCCCAGGTGCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGGTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTg > 5:201310/1‑149 (MQ=255) cgcgGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGt < 6:86503/148‑1 (MQ=255) gcggcgCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTg < 7:284469/148‑1 (MQ=255) gcgcTTGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGt > 8:93011/1‑149 (MQ=255) gcATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCg < 8:42085/149‑1 (MQ=255) cATGAAGCG‑CGGCCAGTCGGCGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCAAGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCgg < 8:69424/149‑1 (MQ=255) g‑cTGCCAGTCGGAGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGc < 8:179560/149‑1 (MQ=255) aGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACAcc > 5:249051/1‑149 (MQ=255) | GATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCG‑CTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACC > NC_002947/4930447‑4930739 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |