| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 11719 | 63 (1.050) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 6.2% | coding (617/1104 nt) | dnaN | DNA polymerase III subunit beta |
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CATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGT‑CAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAG > NC_002947/11573‑11867 | cATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGcc > 4:344271/1‑149 (MQ=255) tgctTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctgc < 2:312890/147‑1 (MQ=255) tgctTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGATCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctgc > 1:312890/1‑147 (MQ=255) gctTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGa > 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ttCCCTCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTAGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATACt > 2:273736/1‑148 (MQ=255) ccGCACCACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGaa < 8:128601/148‑1 (MQ=255) ccGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAg > 4:165625/1‑149 (MQ=255) cGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAgg > 3:298204/1‑149 (MQ=255) gCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctgc > 2:64530/1‑132 (MQ=255) acacGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATg < 3:165625/149‑1 (MQ=255) acacGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATg > 7:49041/1‑149 (MQ=255) cGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGT‑c < 6:322029/149‑1 (MQ=255) cGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGT‑c < 2:104372/149‑1 (MQ=255) ttGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGgcgcgc < 6:175698/120‑1 (MQ=255) ttGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGgcgcgc > 5:175698/1‑120 (MQ=255) 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gAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGT‑CAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctcctgctcgatcggcgcgctcatcgagcaaag < 1:57105‑M2/149‑84 (MQ=255) gAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGT‑CAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAg < 3:183627/148‑1 (MQ=255) gTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGT‑CAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctcctgctcgatcggcgcgctcatcgagcaaagcg < 8:303336‑M2/149‑86 (MQ=255) gTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGT‑CAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCg > 3:237297/1‑149 (MQ=255) gcgcgcCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGT‑CAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctcctgctcgatcggcgcgctcatcgagcaaagcgccag > 2:57105‑M2/1‑60 (MQ=255) gcgcGgatgtgatgctggcccagcacgaagctgaccataccttcaggaacggtcagcaggcgcgccaactacaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctcctgctcgatcggcgcgctcatcgagcaaagcgccag > 1:273736‑M1/1‑5 (MQ=255) gcggatgtgatgctggcccagcacgatgctgaccataccttcaggatcggtcagcaggcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctcctgctcgatcggcgcgctcatcgagcaaagcgccaggc > 8:49041‑M1/1‑3 (MQ=255) gcggatgtgatgctggcccagcacgatgctgaccataccttcaggatcggtcagcaggcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctc < 5:39898‑M1/111‑109 (MQ=255) gcggatgtgatgctggcccagcacgatgctgaccataccttcaggatcggtcagcaggcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctc > 6:39898‑M1/1‑3 (MQ=255) gcggatgtgatgctggcccagcacgatgctgaccataccttcaggatcggt > 8:340503‑M1/1‑3 (MQ=255) gcggatgtgatgctggcccagcacgatgctgaccataccttcaggatcggt < 7:340503‑M1/51‑49 (MQ=255) cggattggatgctggcccagcacgatgctgaccataccttcaggatcggtcagcaggcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctcctgctcgatcggcgcgctcatcgagcaaagcgccaggcg < 7:57267‑M1/149‑148 (MQ=255) ggatgtgatgctggcccagcacgatgctgaccataccttcaggatcggtcagcaggcgcgccaactccaggatacctttacgcggcacgatgacctggtgtcgatcctcctgctcgatcggcgcgctcatcgagcaaagcgccaggcgg < 7:183863‑M1/149‑149 (MQ=255) gcCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGT‑CAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAg > 4:237196/1‑149 (MQ=255) | CATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGT‑CAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAG > NC_002947/11573‑11867 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |