New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 83475 | 59 (0.980) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.2% | coding (215/912 nt) | hemF | coproporphyrinogen‑III oxidase |
? | NC_002947 | = 83505 | 55 (0.980) | coding (245/912 nt) | hemF | coproporphyrinogen‑III oxidase |
TCGAAACAGAAGACGGCGGTGCCCGCTTCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAG > NC_002947/83328‑83623 | tCGAAACAGAAGACGGCGGTGCCCGCTTCGTCGAGGACGCTTGGGTGCGCGGAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCC > 1:279555‑M1/1‑149 (MQ=255) gAAACAGAAGACGGCGGTGCCCGCTTCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTgccg < 8:217311/147‑1 (MQ=255) cagcagACGGCGGTTCCCGCTTCGTCGAGGACGCCTGGTGGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCTCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTTGTAGCGGCCTGCCGCCGTCg < 7:6573/149‑1 (MQ=255) cAGAAGACGGCGGTGCCCGCTTCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCg > 8:228241/1‑149 (MQ=255) agaagaCGGCGGTGCCCGCTTCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGCTCAAATTCTACCATGTGTTTTGTAGCGGCCTGCCGCAGTCgg > 6:174624/1‑149 (MQ=255) cggcggTGCCCGCTTCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTg < 2:19073/149‑1 (MQ=255) gcggTGCCCGCTTCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGcc < 5:264123/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCGCTTCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCa < 6:253498/149‑1 (MQ=255) gTGCCCGCTTCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCAc < 2:70074/149‑1 (MQ=255) tGCCCGCTTCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCAcc > 6:328765/1‑149 (MQ=255) cGCTTCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑cc < 8:243793/149‑1 (MQ=255) cGCTTCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑cc > 4:239561/1‑149 (MQ=255) ttCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCg > 3:106525/1‑148 (MQ=255) tCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTg < 4:194752‑M2/149‑2 (MQ=255) gAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTgg > 7:291150‑M2/1‑146 (MQ=255) ggACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTggcag > 4:106525‑M2/1‑144 (MQ=255) gACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTggcagg < 3:107971‑M2/149‑7 (MQ=255) cGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTGGCGGCCTGCCagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggcc < 1:349554‑M1/149‑39 (MQ=255) cTGGGTGCGC‑GAAGCCTGTGGCGGTGGCCGCAGGCGGGTTATCGGTGAGGTCAACGTTATGGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTg < 6:267628/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTg > 4:102659/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTAGCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCCCCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTg > 7:206895/1‑149 (MQ=255) gggTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGACCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGc > 2:135823/1‑149 (MQ=255) ggTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTgg < 2:10269/147‑1 (MQ=255) ggTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGc < 6:46156/148‑1 (MQ=255) ggTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCt > 6:124214/1‑149 (MQ=255) gTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCtt < 7:228241/149‑1 (MQ=255) tGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTc > 1:325366/1‑149 (MQ=255) c‑gAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAg < 1:47805/149‑1 (MQ=255) aaGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGcc < 5:328765/149‑1 (MQ=255) aaGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGcc < 6:383592/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCACATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCtt < 7:307116/149‑1 (MQ=255) gggggCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGTCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTGGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTggg < 4:14174/146‑1 (MQ=255) gTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGgt < 2:325366/149‑1 (MQ=255) gTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGgt < 5:22227/149‑1 (MQ=255) gCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggccgc > 2:233386‑M1/1‑88 (MQ=255) gCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggccgc < 1:233386‑M1/128‑41 (MQ=255) gCCTCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGGCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTg < 5:174624/149‑1 (MQ=255) ccGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTgg < 1:342476/149‑1 (MQ=255) cACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGa > 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ccATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCa > 4:263636/1‑149 (MQ=255) ccATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCa > 5:43608/1‑149 (MQ=255) aTGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTGCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCAt > 1:77067/1‑149 (MQ=255) aTGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATc < 4:38948/149‑1 (MQ=255) gTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAaag > 2:262762/1‑149 (MQ=255) 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ccTGCCagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggccgctaccaaacacatgggagaagttgaccccgcctttttcgatcacgttgccctcaccgataacccgcgtgcggcccccgccaccggcttcgcgcacccaggcgtc < 3:107971‑M1/149‑144 (MQ=255) cTGCCagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggccgctaccaaacacatgggagaagttgaccccgcctttttcgatcacgttgccctcaccgataacccgcgtgcggcccccgccaccggcttcgcgcacccaggcgtcc > 4:106525‑M1/1‑5 (MQ=255) cTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTg > 6:250564/1‑148 (MQ=255) tGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTg > 5:2877/1‑147 (MQ=255) ccgccgTCGGCCAGTGCCCACCGT‑GCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGaa > 4:274284/1‑147 (MQ=255) ccagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggccgctaccaaacacatgggagaagttgaccccgcctttttcgatcacgttgccctcaccgataacccgcgtgcggcccccgccaccggcttcgcgcacccaggcgtcctc > 7:291150‑M1/1‑2 (MQ=255) cgccgTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGACCTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGGGATACACCCGCACAACCCGCATGGGCCCACGACCCCCGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAagag > 1:365021/1‑149 (MQ=255) cgccgTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAagag > 4:116753/1‑149 (MQ=255) cagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggccgctaccaaacacatgggagaagttgaccccgcctttttcgatcacgttgccctcaccgataacccgcgtgcggcccccgccaccggcttcgcgcacccaggcgtcctcga < 4:194752‑M1/149‑149 (MQ=255) | TCGAAACAGAAGACGGCGGTGCCCGCTTCGTCGAGGACGCCTGGGTGCGC‑GAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGT‑CCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAG > NC_002947/83328‑83623 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |