New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 468712 | 64 (1.060) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 6.2% | coding (2245/3744 nt) | PP_0386 | sensory box protein |
? | NC_002947 | = 468784 | 61 (1.100) | coding (2173/3744 nt) | PP_0386 | sensory box protein |
CTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAAT > NC_002947/468566‑468859 | cTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTcggcg < 6:188476/148‑1 (MQ=255) gATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGt > 3:263537/1‑147 (MQ=255) gCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCt > 7:274761/1‑149 (MQ=255) ggAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGt > 1:369419/1‑149 (MQ=255) ggAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGt > 8:349431/1‑149 (MQ=255) gagaTGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTg > 4:368098/1‑149 (MQ=255) agaTGTCTGCAAAACCCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGc < 8:338570/149‑1 (MQ=255) aTGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCca < 5:20246/149‑1 (MQ=255) cAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATgg < 5:177688/147‑1 (MQ=255) cAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATg < 8:143002/146‑1 (MQ=255) aaaaCCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAg > 4:87125/1‑149 (MQ=255) aaaCCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAgg < 2:369419/149‑1 (MQ=255) aaaCCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAgg > 3:99519/1‑149 (MQ=255) cGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGa < 8:257898/149‑1 (MQ=255) ccACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGaaa < 4:263537/149‑1 (MQ=255) cACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagca > 8:49457‑M1/1‑117 (MQ=255) aCGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAgc > 2:12833/1‑149 (MQ=255) gTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCCCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTg < 5:334724/149‑1 (MQ=255) aTCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGTGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCt < 7:159005/148‑1 (MQ=255) aTCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttc > 8:185168‑M1/1‑104 (MQ=255) ctcGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAgcg < 5:273665/136‑1 (MQ=255) ctcGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAgcg > 6:273665/1‑136 (MQ=255) tcGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGc > 1:337093/1‑148 (MQ=255) cgcgGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGc > 5:375671/1‑147 (MQ=255) gcgGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCGCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTg < 7:306207/144‑1 (MQ=255) gcgGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGc > 5:375330/1‑146 (MQ=255) gTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGcctctgg > 4:186060/1‑144 (MQ=255) gTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAgg > 2:276274/1‑149 (MQ=255) tCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGcctctggc < 3:186060/149‑7 (MQ=255) gCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGa < 7:349431/149‑1 (MQ=255) ttGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGc < 3:87125/147‑1 (MQ=255) cGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCggg < 1:12833/149‑1 (MQ=255) gcTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCgg < 7:63641/144‑1 (MQ=255) gcTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCgg > 8:63641/1‑144 (MQ=255) cTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTg < 4:220068/86‑1 (MQ=255) cTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTg > 3:220068/1‑86 (MQ=255) tCAGCCTGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTGTTTCGCTGGGTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGGCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGTGCAGGCGCGGGGGCTGtccgagt > 6:361811‑M2/1‑142 (MQ=255) tCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagg < 6:64890‑M2/149‑8 (MQ=255) cagccagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgaggg < 7:49457‑M1/149‑81 (MQ=255) agccagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgagggc < 7:185168‑M1/149‑82 (MQ=255) cagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAg > 5:224441/1‑122 (MQ=255) cagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAg < 6:224441/122‑1 (MQ=255) agcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTc > 5:252618/1‑148 (MQ=255) agcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTc > 6:168415/1‑148 (MQ=255) ggTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCg > 8:118967/1‑149 (MQ=255) ggTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCg < 8:274761/149‑1 (MQ=255) ggTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCg < 5:64890/149‑1 (MQ=255) gTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGACGGCGCGGGGTCTGGACGAGGGCCTCGATCTCGc > 4:236880/1‑149 (MQ=255) tAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCt < 1:110728/149‑1 (MQ=255) aaGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTg > 8:70390/1‑148 (MQ=255) aaGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTg < 4:178384/148‑1 (MQ=255) aaGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGt < 7:70390/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGACAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGCCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCACGATCTCGCTGTAGc > 5:350537/1‑149 (MQ=255) gCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCgg > 6:4755/1‑149 (MQ=255) ccGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGt < 1:276274/149‑1 (MQ=255) ttCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGACGTGCTGGACAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGAt > 8:311529/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGAttt > 5:286467/1‑149 (MQ=255) ttGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTc > 2:22023/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGTTGTAGATTTCGCTCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCg < 7:34295/148‑1 (MQ=255) gttgtAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAg < 2:337093/148‑1 (MQ=255) tAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGcgcg > 2:314382/1‑149 (MQ=255) ttCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCt > 6:345454/1‑135 (MQ=255) ttCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCt < 5:345454/135‑1 (MQ=255) tCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGa < 6:375671/148‑1 (MQ=255) gCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACg < 6:252618/148‑1 (MQ=255) cTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCAc > 2:241945/1‑149 (MQ=255) tGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACt > 3:247533/1‑149 (MQ=255) cAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGCCGGCACTGAt > 4:281819/1‑149 (MQ=255) cAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGAt > 8:214782/1‑149 (MQ=255) aGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATg > 6:47366/1‑149 (MQ=255) gCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggct < 7:185168‑M2/149‑69 (MQ=255) gCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATgcgc < 5:168415/148‑1 (MQ=255) gCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCt < 4:99519/149‑1 (MQ=255) cccTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggctg < 7:49457‑M2/149‑70 (MQ=255) ccTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggctga < 6:64890‑M1/149‑143 (MQ=255) actCGGAcagcccccgcgcctgcacgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgaggcccactggcagggcgaaatctacacccagcgaaacaacggcgaactttacccaagcaggctga > 6:361811‑M1/2‑7 (MQ=255) tCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGAt < 6:94894/110‑1 (MQ=255) tCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGAt > 5:94894/1‑110 (MQ=255) gcggTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGAAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGCTCTCGCTGGAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAAt > 6:97096/1‑149 (MQ=255) | CTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAAT > NC_002947/468566‑468859 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |