New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 862151 = | 40 (0.660) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 7.3% | coding (204/906 nt) | yfcH | NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 862192 = | 38 (0.670) | coding (245/906 nt) | yfcH | NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain‑containing protein |
CTGGCTGGGCCAAGGGCATCGGCTTACGGTTTGGAGCAGGCGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTG > NC_002947/862004‑862297 | ctggctggGCCAAGGGCATCGGCTTACGGTTTGGAGCAGGCGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTg < 6:129804/149‑1 (MQ=255) ctggctggGCCAAGGGCATCGGCTTACGGTTTGGAGCAGGCGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGCCAACCTTGCCGGt < 4:71670/148‑1 (MQ=255) gctggGCCAAGTGCATCGGCTTACGGTTTGGAGGAGGCTTCCTGAACTGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTTCTTGGTTTCGCGCGCCTGGACTCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGt < 1:275328/146‑1 (MQ=255) gctggGCCAAGGGCATCGGCTTACGGTTTGGAGCAGGCGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTAAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGt > 2:275328/1‑145 (MQ=255) ggCCAAGGGCATCGGCTTACGGTTTGGAGCAGGCGTGCTGAACAGGTGGCGAATATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGGGCGCCTGGA‑GCAGTTAGAAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCg < 1:82398/148‑1 (MQ=255) gcctcggtcagttcgcgttcgccaccgtctccgtaccaacctaccgcagagccggagatcaacacctccgggcgctgctcacgggtgcccaaccaagccagcaattgctcggtaagggtgacacggctggcccacagcacgtTGCGCCg < 5:311169‑M1/7‑1 (MQ=255) cAAGGGCATCGGCTTACGGTTTGGAGCAGGCGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTTGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGc > 5:186173/1‑149 (MQ=255) cAAGGGCATCGGCTTACGGTTTGGAGCAGGCGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGc < 5:228378/149‑1 (MQ=255) cATCGGCTTACGGTTTGGAGCAGGCGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAg < 6:311844/149‑1 (MQ=255) gCTTACGGTTTGGAGCAGGCGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCt < 3:350226/149‑1 (MQ=255) tACGGTTTGGAGCAGGCGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑Ga > 7:319918/1‑149 (MQ=255) ggTTTGGAGCAGGCGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACgg < 6:359809/149‑1 (MQ=255) tGGAGCAGGCGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTTGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGgccg < 6:186173/148‑1 (MQ=255) cGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGGCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCaa > 8:68170/1‑149 (MQ=255) tCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACg > 3:241193/1‑149 (MQ=255) tGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑c > 1:49898/1‑149 (MQ=255) gAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑Ct > 2:323654/1‑149 (MQ=255) gAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑Ct > 8:88297/1‑149 (MQ=255) aaCAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑c < 2:365766/147‑1 (MQ=255) ccgcagagccggagatcaacacctccgggcgctgctcacgggtgcccaaccaagccagcaattgctcggtaagggtgacacggctggcccacagcacgtTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑Ct > 4:26237‑M1/100‑147 (MQ=255) aGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTGCGACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑Ctgtg < 1:206696/149‑1 (MQ=255) ggCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCa < 1:197046/149‑1 (MQ=255) gAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGcc > 8:250879/1‑149 (MQ=255) gAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GAAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCAGACAGGCCCTG‑GACgg > 7:142785/1‑119 (MQ=255) aaaTCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCgt < 8:319918/149‑1 (MQ=255) aaaTCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCgt < 4:241193/149‑1 (MQ=255) ggagatcaacacctccgggcgctgctcacgggtgcccaaccaagccagcaattgctcggtaagggtgacacggctggcccacagcacgtTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACg < 1:210280‑M1/44‑1 (MQ=255) ggagatcaacacctccgggcgctgctcacgggtgcccaaccaagccagcaattgctcggtaagggtgacacggctggcccacagcacgtTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACg > 2:210280‑M1/90‑133 (MQ=255) gTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCt > 2:350573/1‑148 (MQ=255) gggTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAg > 2:160131/1‑149 (MQ=255) gTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCt < 7:68170/148‑1 (MQ=255) tCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCt > 7:178639/1‑149 (MQ=255) gcCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCttggttg < 1:323654/149‑1 (MQ=255) aggtAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGt < 2:223424/146‑1 (MQ=255) aGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCTGTGGTCAACCTTGCAGGTGCGGCTATTGCCGAAAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGTGGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGGCGTGTCACCCTTACGGAGCAATTGCTTGCTTGGTTGGGCACCCGt < 7:317859/149‑1 (MQ=255) gTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTg < 8:178639/149‑1 (MQ=255) ttAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCAccc > 1:286106/1‑145 (MQ=255) ttAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCAccc < 2:286106/145‑1 (MQ=255) tAG‑TGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACCGCCGCCCGGCGCAACGTGCCTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTg < 1:289597/148‑1 (MQ=255) g‑agGCCGACGATAATCTTGATGCGGTGGGCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGagc < 4:194143/148‑1 (MQ=255) gCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAgcg > 6:311169/1‑149 (MQ=255) gCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAgcg > 1:362700/1‑149 (MQ=255) cgacgaTCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCAc < 7:322684/135‑1 (MQ=255) cgacgaTCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCAc > 8:322684/1‑135 (MQ=255) gATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGAGAGCAGCGCCCGGAGgtgt < 2:49898/145‑1 (MQ=255) gtggtCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCgg < 1:301357/149‑1 (MQ=255) gtggtCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCgg < 1:350573/149‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCgg > 3:113511/1‑147 (MQ=255) tacGGTGATCCGATTTCCGACAGGAACAT‑TACCTCCGCCCGCCGCAACGTT‑CTGTGTGCCATCCGTGTCACCATTACCGAGCAATTGATGGCTTGGTTGTTCAACCTTGATCAGCGACCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAgg > 4:162404/3‑149 (MQ=255) ggTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCAGCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTg > 7:290787/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTg < 7:250879/149‑1 (MQ=255) | CTGGCTGGGCCAAGGGCATCGGCTTACGGTTTGGAGCAGGCGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGA‑GCAGTTAG‑AGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTG > NC_002947/862004‑862297 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |