New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 862151 = | 40 (0.660) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 7.3% | coding (204/906 nt) | yfcH | NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 862192 = | 38 (0.670) | coding (245/906 nt) | yfcH | NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain‑containing protein |
CGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTGGTACGGAGACGGTGGCGAACGCGAACTGACCGAGGC > NC_002947/862044‑862333 | cGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGGCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCaa > 8:68170/1‑149 (MQ=255) tCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACg > 3:241193/1‑149 (MQ=255) tGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑c > 1:49898/1‑149 (MQ=255) gAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑Ct > 8:88297/1‑149 (MQ=255) gAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑Ct > 2:323654/1‑149 (MQ=255) aaCAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑c < 2:365766/147‑1 (MQ=255) ccgcagagccggagatcaacacctccgggcgctgctcacgggtgcccaaccaagccagcaattgctcggtaagggtgacacggctggcccacagcacgtTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑Ct > 4:26237‑M1/100‑147 (MQ=255) aGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTGCGACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑Ctgtg < 1:206696/149‑1 (MQ=255) ggCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCa < 1:197046/149‑1 (MQ=255) gAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGcc > 8:250879/1‑149 (MQ=255) ggagatcaacacctccgggcgctgctcacgggtgcccaaccaagccagcaattgctcggtaagggtgacacggctggcccacagcacgtTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACg < 1:210280‑M1/44‑1 (MQ=255) ggagatcaacacctccgggcgctgctcacgggtgcccaaccaagccagcaattgctcggtaagggtgacacggctggcccacagcacgtTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACg > 2:210280‑M1/90‑133 (MQ=255) aaaTCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCgt < 8:319918/149‑1 (MQ=255) aaaTCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCgt < 4:241193/149‑1 (MQ=255) gTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCt > 2:350573/1‑148 (MQ=255) gggTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAg > 2:160131/1‑149 (MQ=255) gTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCt < 7:68170/148‑1 (MQ=255) tCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCt > 7:178639/1‑149 (MQ=255) gcCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCttggttg < 1:323654/149‑1 (MQ=255) aggtAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGt < 2:223424/146‑1 (MQ=255) aGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCTGTGGTCAACCTTGCAGGTGCGGCTATTGCCGAAAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGTGGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGGCGTGTCACCCTTACGGAGCAATTGCTTGCTTGGTTGGGCACCCGt < 7:317859/149‑1 (MQ=255) gTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTg < 8:178639/149‑1 (MQ=255) ttAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCAccc > 1:286106/1‑145 (MQ=255) ttAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCAccc < 2:286106/145‑1 (MQ=255) tAGTGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACCGCCGCCCGGCGCAACGTGCCTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTg < 1:289597/148‑1 (MQ=255) gagGCCGACGATAATCTTGATGCGGTGGGCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGagc < 4:194143/148‑1 (MQ=255) gCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAgcg > 1:362700/1‑149 (MQ=255) gCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAgcg > 6:311169/1‑149 (MQ=255) cgacgaTCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCAc > 8:322684/1‑135 (MQ=255) cgacgaTCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCAc < 7:322684/135‑1 (MQ=255) gATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGAGAGCAGCGCCCGGAGgtgt < 2:49898/145‑1 (MQ=255) gtggtCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCgg < 1:301357/149‑1 (MQ=255) gtggtCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCgg < 1:350573/149‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCgg > 3:113511/1‑147 (MQ=255) agcacgttgcgccgggcggccgtccagggcctgtcggcaatcggcgcaACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCgg > 4:26237‑M2/49‑147 (MQ=255) tacGGTGATCCGATTTCCGACAGGAACAT‑TACCTCCGCCCGCCGCAACGTT‑CTGTGTGCCATCCGTGTCACCATTACCGAGCAATTGATGGCTTGGTTGTTCAACCTTGATCAGCGACCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAgg > 4:162404/3‑149 (MQ=255) ggTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCAGCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTg > 7:290787/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTg < 7:250879/149‑1 (MQ=255) cgttgcgccgggcggccgtccagggcctgtcggcaatcggcgcaACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTcc < 1:210280‑M2/89‑1 (MQ=255) cgttgcgccgggcggccgtccagggcctgtcggcaatcggcgcaACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTcc > 2:210280‑M2/45‑133 (MQ=255) GCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTGGTACg < 3:87680‑M1/149‑1 (MQ=255) CGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTTGTACGga > 7:88297‑M1/1‑149 (MQ=255) ccGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTGGTACGGAGACGGt > 7:317167/1‑149 (MQ=255) gACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTGGTACGGAGACGGTgg > 8:143496/1‑149 (MQ=255) ggCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGGCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCATCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTGGTACGGAGACGGTGgcgaa < 3:162404/149‑1 (MQ=255) ccTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTGGTACGGAGACGGTGgcgaacgc > 7:69948/1‑149 (MQ=255) ccTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTGGTACGGAGACGGTGgcgaacgc > 3:205896/1‑149 (MQ=255) gACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTGGTACGGAGACGGTGgcgaacgcgaa < 2:362700/148‑1 (MQ=255) cgccCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTGGTACGGAGACGGTGGCGAACGCGAACTGAcc > 2:376237/1‑148 (MQ=255) ccGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTGGTACGGAGACGGTGGCGAACGCGAACTGACCGAgg > 5:374124/1‑149 (MQ=255) cggcgcaACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTGGTACGGAGACGGTGGCGAACGCGAACTGACCGAGGc < 5:311169‑M2/142‑1 (MQ=255) | CGTCCTGAACAGGTGGCGAAAATCTGTGGTAGCGGGGTGCGTGGTATCGCGCGCCTGGAGCAGTTAGAGGCCGACGATCATCTTGATGCGGTGGTCAACCTTGCCGGTGCGCCGATTGCCGACAGGCCCTG‑GACGGCCGCCCGGCGCAACGTG‑CTGTGGGCCAGCCGTGTCACCCTTACCGAGCAATTGCTGGCTTGGTTGGGCACCCGTGAGCAGCGCCCGGAGGTGTTGATCTCCGGCTCTGCGGTAGGTTGGTACGGAGACGGTGGCGAACGCGAACTGACCGAGGC > NC_002947/862044‑862333 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |