New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1346979 = | 60 (1.000) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 6.4% | intergenic (‑87/+317) | udh/galP‑I | uronate dehydrogenase/porin‑like protein |
? | NC_002947 | 1347037 = | 59 (1.020) | intergenic (‑145/+259) | udh/galP‑I | uronate dehydrogenase/porin‑like protein |
CCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGT > NC_002947/1346832‑1347126 | ggcctgcgcccaacctccgatgtgtgtccaccattgatcaggtgtaggagcgggtttacccgcgaatacggtggcggcggcaacggtgaacggcgggtggaaattggccagcaggcctggccctttcgcgggtaaacccgctcctacgg > 8:97139‑M1/148‑149 (MQ=255) ggcctgcgcccaacctccgatgtgtgtccaccattgatcaggtgtaggagcgggtttacccgcgaatacggtggcggcggcaacggtgaacggcgggtggaaattggccagcaggcctggccctttcgcgggtaaacccgctcctacgg > 6:115790‑M1/148‑149 (MQ=255) cctgcgcccaacctccgatgtgtgtccaccattgatcaggtgtaggagcgggtttacccgcgaatacggtggcggcggcaacggtgaacggcgggtggaaattggccagcaggcctggccctttcgcgggtaaacccgctcctacGggc < 2:52580‑M1/4‑1 (MQ=255) cgccTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGcc > 7:192898/1‑149 (MQ=255) gccTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCg < 5:103409/149‑1 (MQ=255) cTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑c > 3:57656/1‑149 (MQ=255) cTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTcg < 4:181523/149‑1 (MQ=255) tCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGGTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTcgc > 4:161740/1‑149 (MQ=255) ccGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTcgcg > 3:38611/1‑149 (MQ=255) cGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTcgc < 8:176953/147‑1 (MQ=255) caccattgatcaggtgtaggagcgggtttacccgcgaatacggtggcggcggcaacggtgaacggcgggtggaaattggccagcaggcctggccctttcgcgggtaaacacgctcctacGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGt < 3:297974‑M1/28‑1 (MQ=255) agcagcAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAg < 2:233743/149‑1 (MQ=255) cagcagGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGa > 4:352995/1‑148 (MQ=255) gcagGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGTCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAAt < 8:230320/149‑1 (MQ=255) ccggCGATTGACGGGGGTAGTGGTCATTGCCGGCTCTTGTTGTTAGGTGTTGTAGGTAGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGCGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATg < 7:339144/147‑1 (MQ=255) cagGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATg > 6:279348/1‑149 (MQ=255) ggCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGa > 5:64820/1‑143 (MQ=255) ggCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGa < 6:64820/143‑1 (MQ=255) gCGATGGAAGGGGGTAGTGGTCATCGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGa < 6:266319/149‑1 (MQ=255) gATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGa > 4:99864/1‑147 (MQ=255) ggtgtaggagcgggtttacccgcgaatacggtggcggcggcaacggtgaacggcgggtggaaattggccagcaggcctggccctttcgcgggtaaacccgctcctacGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAg > 4:297974‑M1/108‑149 (MQ=255) ggggTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTgcg > 8:179256/1‑149 (MQ=255) gTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCgg < 5:279348/149‑1 (MQ=255) gTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑c < 8:98209/111‑1 (MQ=255) gTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑c > 7:98209/1‑111 (MQ=255) tGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGTCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCTAAAGGCCTGCGCGGTCGc < 4:38611/149‑1 (MQ=255) tGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGc < 7:179256/149‑1 (MQ=255) gTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGccc > 3:315528/1‑149 (MQ=255) gTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGccc > 8:76363/1‑149 (MQ=255) ccgcgaatacggtggcggcggcaacggtgaacggcgggtggaaattggccagcaggcctggccctttcgcgggtaaacccgctcctacGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAAt < 4:203893‑M1/35‑1 (MQ=255) ccgcgaatacggtggcggcggcaacggtgaacggcgggtggaaattggccagcaggcctggccctttcgcgggtaaacccgctcctacGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAAt > 3:203893‑M1/89‑123 (MQ=255) tGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAg > 6:257761/1‑149 (MQ=255) ccGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAg > 3:273155/1‑149 (MQ=255) ctctTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCggg > 5:315662/1‑149 (MQ=255) tctTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGcgcg > 6:246353/1‑130 (MQ=255) tctTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGcgcg < 5:246353/130‑1 (MQ=255) ttgttgTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGt < 4:57656/147‑1 (MQ=255) tgttgtTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCgg > 6:160962/1‑144 (MQ=255) tgttgtTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCgg < 5:160962/144‑1 (MQ=255) gttgttAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTAc > 4:239800/1‑149 (MQ=255) ttgttAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTAcc > 5:338736/1‑149 (MQ=255) aGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCcgcg > 6:157060/1‑148 (MQ=255) aGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTCGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCcgcg > 4:252898/1‑148 (MQ=255) gttgttGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa < 1:52188/148‑1 (MQ=255) gttgtAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgg > 3:348800/1‑149 (MQ=255) gtAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGc > 3:67303/1‑148 (MQ=255) tAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGc > 8:251929/1‑147 (MQ=255) gTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGc > 8:245064/1‑149 (MQ=255) ttGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAgcag > 2:192439/1‑146 (MQ=255) tCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAgcaggc < 5:159570/148‑6 (MQ=255) tCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTCTGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGAGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCctgc > 6:191814/1‑149 (MQ=255) ttGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGAGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAAtt > 7:130939/1‑149 (MQ=255) tGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAAttt > 6:117731/1‑149 (MQ=255) ttGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACccgcc < 3:352995/148‑1 (MQ=255) ttCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTg < 5:257761/149‑1 (MQ=255) tgtgtgTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGAAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTgccg > 8:322828/1‑149 (MQ=255) gtgtgtTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTgccgc > 3:100637/1‑149 (MQ=255) gtgtgtTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTgccgc > 2:136225/1‑149 (MQ=255) tgtgtTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGACAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTgccgcc > 7:267713/1‑149 (MQ=255) tgttgtCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTgccgccgc > 1:52580/1‑149 (MQ=255) tgttgtCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTgccgccgc > 1:98869/1‑149 (MQ=255) tCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGTCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCAcc > 1:22631/1‑149 (MQ=255) tCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCGTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCAcc < 1:136225/148‑1 (MQ=255) aaTGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTa > 3:74430/1‑149 (MQ=255) aTGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTAt > 5:359299/1‑149 (MQ=255) aTGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGATTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTAt > 1:1982/1‑149 (MQ=255) tGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTAtt < 6:315662/149‑1 (MQ=255) ggCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTcgc < 3:161740/149‑1 (MQ=255) ggCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTcgc < 4:315528/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCAc < 7:353897/112‑1 (MQ=255) cTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCAc > 8:353897/1‑112 (MQ=255) cTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCgg < 7:76363/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCgg < 4:67303/149‑1 (MQ=255) GGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGt < 2:311257‑M1/148‑1 (MQ=255) GGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGt > 7:251929‑M1/1‑148 (MQ=255) | CCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGG‑CCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGT > NC_002947/1346832‑1347126 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |