New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1419549 = | 33 (0.550) | 4 (0.090) | 4/208 | NT | 17.1% | intergenic (‑38/+98) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1419637 = | 13 (0.280) | intergenic (‑126/+10) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
CTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGG‑CTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATG > NC_002947/1419401‑1419679 | cTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGGGCAACAGCGGGGGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGggc‑tgg‑c < 1:16565/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTTGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTGGCCTGggc‑tgg‑c < 3:236714/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGggc‑tgg‑c < 3:84236/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGggc‑tgg‑c < 2:335586/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGggc‑tgg‑c > 5:295330/1‑149 (MQ=255) gATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTcgcg > 7:40660/1‑149 (MQ=255) gcccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCgg > 5:341584‑M1/140‑149 (MQ=255) gcccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCgg > 3:361810‑M1/140‑149 (MQ=255) gggTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACg > 4:185904/1‑149 (MQ=255) ttCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGccc < 8:40660/149‑1 (MQ=255) ctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCGGGCACGccc > 1:219403‑M1/132‑149 (MQ=255) aTGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTc > 7:88570/1‑149 (MQ=255) cGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca < 3:185904/149‑1 (MQ=255) tgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCGGGCACGccc < 1:267346‑M1/18‑1 (MQ=255) tgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCGGGCACGccc > 2:267346‑M1/124‑141 (MQ=255) gatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca < 5:50405‑M1/25‑1 (MQ=255) aaCAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg < 3:90134/149‑1 (MQ=255) aCAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 1:127696/1‑149 (MQ=255) aCAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑CGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 3:39199/1‑149 (MQ=255) gcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCgg > 2:137311‑M1/120‑129 (MQ=255) gcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCgg < 1:137311‑M1/10‑1 (MQ=255) aGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGt > 8:310322/1‑148 (MQ=255) aGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTa < 3:161869/149‑1 (MQ=255) cGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACt < 2:127696/149‑1 (MQ=255) cGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑CGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACt < 4:39199/149‑1 (MQ=255) aggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 5:220145‑M1/29‑1 (MQ=255) aggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 6:220145‑M1/118‑146 (MQ=255) aggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagccaaacaccttgcattagcaggtcaggcCACTTCCAGGGCACGCCCGCACCCACAGGTAc < 8:235419‑M1/32‑1 (MQ=255) gTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACtgtg < 6:295330/149‑1 (MQ=255) gTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGAATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACtgtg < 5:333041/149‑1 (MQ=255) aGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGTTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCa < 2:285672/148‑1 (MQ=255) gttTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGt < 4:307875/148‑1 (MQ=255) cTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTTGGCTTGC‑CTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCtgt < 6:279020/149‑1 (MQ=255) gTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACt > 7:318608/1‑125 (MQ=255) gTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACt < 4:1567/125‑1 (MQ=255) gTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACt > 3:1567/1‑125 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCtg > 8:125242/1‑149 (MQ=255) aGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGTCCCtgtg > 4:252977/1‑149 (MQ=255) aGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCtgtg < 7:310322/149‑1 (MQ=255) ggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAg > 7:235419‑M1/81‑149 (MQ=255) ccGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCgg < 7:125242/148‑1 (MQ=255) agtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcataagcaggtcaggcCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGc > 7:254750‑M1/76‑149 (MQ=255) tgttgtgttgTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGGAGTGCGTGTCGGCGTTGGTGACCCAGTGGGACCCGGCGTGCCCGCGAAGAGGc > 7:185295/1‑149 (MQ=38) tgtgttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGGAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCt > 1:49599/1‑148 (MQ=255) gtgttggCGGGGGGCATTGTTTGGTTGCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCCGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGa < 8:88570/149‑1 (MQ=37) ccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCtg < 6:345524‑M1/63‑1 (MQ=255) ccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaggcCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCtg > 5:345524‑M1/37‑99 (MQ=255) cccTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAgg > 5:103124/1‑137 (MQ=255) cccTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCtg > 5:193745/1‑149 (MQ=255) cccTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAgg < 6:103124/137‑1 (MQ=255) cTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGGAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTTATGCAAGGTGTGAGGCTCtgtg > 1:214357/1‑149 (MQ=255) caTTCGGGGTGGCCTGGGC‑TGGCCGCTTCGCGGCCACGCCCGCCCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGGGACGGCGGTGGTCCCCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGt < 2:214357/148‑1 (MQ=37) tGGGTTGCCTGGGC‑TGGCCTCTTCGCGGGCACCCCCGCACCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGGCCTTCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATg > 2:11386/1‑149 (MQ=38) | CTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGC‑TGG‑CTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATG > NC_002947/1419401‑1419679 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |