New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1520999 | 65 (1.080) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 6.3% | coding (256/1353 nt) | murD | UDP‑N‑acetylmuramoylalanine‑‑D‑glutamate ligase |
? | NC_002947 | = 1521021 | 58 (1.020) | coding (278/1353 nt) | murD | UDP‑N‑acetylmuramoylalanine‑‑D‑glutamate ligase |
TCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAATGGCCGCC > NC_002947/1520853‑1521145 | tCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑g > 8:198203/1‑149 (MQ=255) cGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑gg < 1:325178/149‑1 (MQ=255) gCCGATACCCGCGAGCAGCCGCTGAAAGTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGGGCTGAGGTGAACTGGACGTGGACTACCTG‑‑TGCCGCGCCAACGCGCTGTACGTGAGCCCCGGCAAGGCGTTGGCCACGCC‑GGc > 7:58051/1‑149 (MQ=255) gCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCgcgg > 1:94661‑M1/1‑145 (MQ=255) gCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGc > 6:295620/1‑149 (MQ=255) gCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGc < 4:309298/149‑1 (MQ=255) cGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCt > 4:299777/1‑149 (MQ=255) gATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCtt < 6:89332/149‑1 (MQ=255) cccGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTgcag < 6:74953/149‑1 (MQ=255) cgcgAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTgcag > 6:147236/1‑147 (MQ=255) cgcgAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTgcag > 2:119586/1‑147 (MQ=255) gccgGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCgc > 2:243121‑M2/1‑147 (MQ=255) aaCTGGAAACCGTGCGCCGTGATTACCCTCAGGTGGAAGTGCGCTGTTGTGAACTGGAGGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGACAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCgcggcagcctgctgcaagtccggcgtg < 3:89504‑M1/147‑28 (MQ=255) aaCTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGTCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTg > 1:324249/1‑138 (MQ=255) aaCTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGTCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTg < 2:324249/138‑1 (MQ=255) aaCTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCt > 7:286446/1‑137 (MQ=255) aaCTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCt < 8:286446/137‑1 (MQ=255) tGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCgcggcagcctgctgcaaggccggcgtggcc > 5:351349‑M1/1‑117 (MQ=255) ggAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCgcgtggcgtg > 2:33337/1‑148 (MQ=255) gcaaCCCTGCGCCGTTAGTAACCGCAGGTGGAATGGCGCTGTGGTGAACTGGACGGTGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGa < 8:351586/146‑1 (MQ=255) gAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCgcggcagcctgctgcaaggccggcgtggccaagg < 2:94661‑M1/149‑35 (MQ=255) gAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCgcggcagcctgctgcaaggccggcgtggccaa < 6:351349‑M1/147‑33 (MQ=255) aaaCCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGaa < 1:322464/148‑1 (MQ=255) tcgcTGCGCCGTGATTACGCGCAGGGGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCGG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCGGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGTCTGCCGCGCGTTGCGTGAAGCt < 8:343017/146‑1 (MQ=255) ccTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGCGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCt > 7:343017/1‑147 (MQ=255) ccTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGt < 3:299777/149‑1 (MQ=255) cTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGGATGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTg > 1:107209/1‑149 (MQ=255) gcCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGaa < 2:310667/139‑1 (MQ=255) gcCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGaa > 1:310667/1‑139 (MQ=255) cGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGa < 7:71458/149‑1 (MQ=255) gCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTCGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGt < 1:33337/149‑1 (MQ=255) tGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGCCCACGCC‑GGCCTTGCAGAAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGATTGCt > 4:311965/1‑149 (MQ=255) ggAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTc > 7:223658/1‑149 (MQ=255) gcgcTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATg > 3:98592/1‑149 (MQ=255) cgcTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATg < 1:119586/148‑1 (MQ=255) tggtgAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCaa < 1:278340/147‑1 (MQ=255) gtgAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGgcg > 5:355703/1‑149 (MQ=255) gtgAACTGGACGTGGACCTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGATCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGCCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGgc < 8:58051/148‑1 (MQ=255) tgAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGgcgc < 8:223658/149‑1 (MQ=255) tGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATc > 7:125593/1‑149 (MQ=255) gTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGAGATAGAGCTGt < 5:20921/118‑1 (MQ=255) gTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGt > 6:20921/1‑118 (MQ=255) gTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGc > 8:181107/1‑149 (MQ=255) gTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGc < 8:125593/149‑1 (MQ=255) gTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGc > 7:164758/1‑149 (MQ=255) ggACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCa > 2:243970/1‑149 (MQ=255) ggACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCa > 5:43802/1‑149 (MQ=255) gACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCAt < 7:198203/149‑1 (MQ=255) cTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCAt > 8:129109/1‑147 (MQ=255) ttCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAg > 3:130128/1‑149 (MQ=255) cTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTg < 5:256773/148‑1 (MQ=255) cgcgCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCaa < 1:358904/149‑1 (MQ=255) gcgcCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCaa > 1:86761/1‑149 (MQ=255) aaCGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCaa < 7:181107/149‑1 (MQ=255) aaCGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCaa < 2:107209/149‑1 (MQ=255) aCGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGcc > 3:146689/1‑146 (MQ=255) cGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAaga < 7:129109/149‑1 (MQ=255) gAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAagag < 6:43802/149‑1 (MQ=255) cGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCa > 4:201651/1‑149 (MQ=255) ccccGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGc > 3:351539/1‑149 (MQ=255) cccGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCt > 6:269714/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTg > 8:201662/1‑149 (MQ=255) gcgtggccaAGGCCAGGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTc > 1:246549/4‑149 (MQ=255) cctggcctTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCg > 4:365755/1‑149 (MQ=255) ctggcctTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCgg > 4:330156/1‑149 (MQ=255) tggcctTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGt > 3:157998/1‑149 (MQ=255) gcctTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTc < 4:255822/132‑1 (MQ=255) gcctTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTc > 3:255822/1‑132 (MQ=255) gcctTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGt < 4:98592/147‑1 (MQ=255) cctTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCgcgtggccaaggccaggccggggctcacgtacagctcgttggcgcggcacaggaagtccacgtccagttcaccacagcgcacttccacctgcgggtaatcacggcgcagggtttc < 2:94661‑M2/149‑116 (MQ=255) ctTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGaaa > 4:276128/1‑149 (MQ=255) ctTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGaaa > 5:193816/1‑149 (MQ=255) ttGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCgcgtggccaaggccaggccggggctcacgtacagctcgttggcgcggcacaggaagtccacgtccagttcaccacagcgcacttccacctgcgggtaatcacggcgcagggtttc < 6:351349‑M2/147‑116 (MQ=255) ttGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGc > 1:95489/1‑116 (MQ=255) ttGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGc < 2:95489/116‑1 (MQ=255) ggCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCgcgtggccaaggccaggccggggctcacgtacagctcgttggcgcggcacaggaagtccacgtccagttcaccacagcgcacttccacctgcgggtaatcacggcgcagggtttcca > 5:351349‑M2/1‑30 (MQ=255) ggCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAATg < 3:276128/148‑1 (MQ=255) gCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGc > 2:293485/1‑113 (MQ=255) ccACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAATGgcc > 5:29696/1‑149 (MQ=255) cACGCC‑GGACTTGCAGCAGGCTGCCGCgcgtggccaaggccaggccggggctcacgtacagctcgttgtcgcggcacaggaagtccacctccagttcacaacagcgcacttccacctgagggtaatcacggcgcacggtttccagtt < 3:89504‑M2/147‑121 (MQ=255) aCGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAATGgccgc > 1:154284/1‑149 (MQ=255) gcgcggcagcctgctgcaaggccggcgtggccaaggccaggccggggctcacgtacagctcgttggcgcggcacaggaagtccacgtccagttcaccacagcgcacttccacctgcgggtaatcacggcgcagggtttccagttccggc > 2:243121‑M1/1‑2 (MQ=255) | TCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTG‑‑TGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCC‑GGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAATGGCCGCC > NC_002947/1520853‑1521145 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |