New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1878480 = | 59 (0.980) | 3 (0.050) | 3/256 | NT | 5.4% | coding (602/1221 nt) | PP_1684 | transporter |
? | NC_002947 | 1878549 = | 48 (0.830) | coding (671/1221 nt) | PP_1684 | transporter |
TCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACCTGCTGGCCTACCTGGTTGACCAGCATCTGGCT > NC_002947/1878336‑1878628 | tCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGcc > 2:40878/1‑149 (MQ=255) cggtgaaggtaccgacgatgttgaacaggccgaccagcgccagcactgtcgtaccggtggccgcagccagatgctggtcaaccaggtaggccagcaggtgaacgccaatgaatacgacctggaagccacagacaaaaaagcccaGTGcc > 8:179793‑M1/145‑149 (MQ=255) gtcAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGGACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAg < 2:344476/147‑1 (MQ=255) gCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAg < 7:329350/149‑1 (MQ=255) ccAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAg > 7:59743/1‑148 (MQ=255) gCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGGCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCt > 6:10801/1‑149 (MQ=255) ccATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTg > 2:258289/1‑149 (MQ=255) ccATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTg > 7:115674/1‑149 (MQ=255) gCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAgg > 5:53761/1‑149 (MQ=255) gCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAg < 3:360428/148‑1 (MQ=255) gaacaggccgaccagcgccagcactgtcgtaccggtggccgcagccagatgctggtcaaccaggtaggccagcaggtgaacgccaatgaatacgacctggaagccacagacaaaaaagcccaGTg < 1:115688‑M1/3‑1 (MQ=255) gaacaggccgaccagcgccagcactgtcgtaccggtggccgcagccagatgctggtcaaccaggtaggccagcaggtgaacgccaatgaatacgacctggaagccacagacaaaaaagcccaGTg > 2:115688‑M1/123‑125 (MQ=255) ggCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCt > 3:190710/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTgcgc > 2:279095/1‑148 (MQ=255) ccAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTgcgc > 7:3438/1‑148 (MQ=255) cAAGGCCTGATTCAGGGGCTGGGCTGGGCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGa < 1:176428/149‑1 (MQ=255) aaGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAg > 4:156986/1‑149 (MQ=255) aaGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAg < 4:86248/149‑1 (MQ=255) gaccagcgccagcactgtcgtaccggtggccgcagccagatgctggtcaaccaggtaggccagcaggtgaacgccaatgaatacgacctggaagccacagacaaaaaagcccaGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAgg < 4:131643‑M1/36‑1 (MQ=255) aGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAgg < 4:190710/149‑1 (MQ=255) aGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTGCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAgg < 4:255357/149‑1 (MQ=255) ccTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGt > 7:300901/1‑149 (MQ=255) tGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTg > 8:138743/1‑148 (MQ=255) aTTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTgc < 3:124452/147‑1 (MQ=255) gTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGc > 6:344706/1‑138 (MQ=255) gTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGc < 5:344706/138‑1 (MQ=255) gTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACAGAGTCACGGTGCCGAGGAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGCCGTGCACGCACt > 1:219916/1‑149 (MQ=255) gctggTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTc < 8:3438/149‑1 (MQ=255) ctggTGGGCAGCGTTGGTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCGTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGTGCAGTCCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGGACTCCGGCTTCt < 2:329797/149‑1 (MQ=255) gTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTgg < 1:40878/148‑1 (MQ=255) gTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTgg < 5:384009/148‑1 (MQ=255) ggCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGATGCGCGCGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGc > 2:237140/1‑149 (MQ=255) gCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTATGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGACGAGCAGACCCTGG‑GCAAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCt > 4:326455/1‑149 (MQ=255) aGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGGCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTgg < 5:191553/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTg > 1:54542/1‑142 (MQ=255) gTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTg < 2:54542/142‑1 (MQ=255) cagatgctggtcaaccaggtaggccagcaggtgaacgccaatgaatacgacctggaagccacagacaaaaaagcccaGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTgg > 3:131643‑M1/78‑149 (MQ=255) ctggtcaaccaggtaggccagcaggtgaacgccaatgaatacgacctggaagccacagacaaaaaagcccaGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCtttt > 3:347804‑M1/72‑149 (MQ=255) aCTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCtttt > 8:243881/1‑149 (MQ=255) cTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCttttt > 7:129527/1‑149 (MQ=255) gggCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTg > 3:258965/1‑149 (MQ=255) gggcTTTTGGTGGCGTTCATCGTGGCTTTCGGCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTTCCCAGTCACGGTGGCGAGCATTCCCTGGCGCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCtttt < 1:107834/143‑1 (MQ=255) ggCCTTTTGGTTGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACACTGG‑GCAAGGCGCTTCGAGAGGCGTGCACGCACTCCTGCTTCTGGTTGCTGGCACTTGGCTTTTTTg > 1:151032/1‑148 (MQ=255) ggCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCGGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCtttttt < 7:125561/147‑1 (MQ=255) ggCCCTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCtttttt < 5:266619/147‑1 (MQ=255) gCCTTTTGGTGTCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTTCCGAGTCAGGGTGCCGAGCAGAGCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTc < 1:258289/149‑1 (MQ=255) ttGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTgg > 2:119817/1‑149 (MQ=255) gTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCACGAGGCGAGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACAGGGCtt > 2:181061/1‑129 (MQ=255) aTCGTGCCTTTCCTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGCCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGt < 8:115674/149‑1 (MQ=255) ccTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTc > 1:176571/1‑135 (MQ=255) ccTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTc < 2:176571/135‑1 (MQ=255) ttCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTgg > 1:210016/1‑149 (MQ=255) cGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGc < 7:138743/148‑1 (MQ=255) tctgCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCAcc > 8:91839/1‑149 (MQ=255) ctgcGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACctgct < 6:53761/149‑1 (MQ=255) ctgcGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACctgct > 5:177380/1‑149 (MQ=255) tgcGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACctgctg > 5:6621/1‑149 (MQ=255) cgcgATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACctgctg < 7:42901/147‑1 (MQ=255) aCCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACCTGCTGGCCTACCTGGTTGAc < 8:300901/148‑1 (MQ=255) cccAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACCTGCTGGCCTACCTGGTTGACCa < 1:279095/149‑1 (MQ=255) ccAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACCTGCTGGCCTACCTGGTTGACCAg > 5:104720/1‑149 (MQ=255) ccAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACCTGCTGGCCTACCTGGTTGACCAg > 4:186056/1‑149 (MQ=255) cAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACCTGCTGGCCTACCTGGTTGACCAGc < 5:61042/149‑1 (MQ=255) aGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTAtt < 4:282366/110‑1 (MQ=255) aGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTAtt > 3:282366/1‑110 (MQ=255) gTCACGGGGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACCTGCTGGTCAACCAGGTAGGCCAGCag < 8:59743/149‑2 (MQ=255) cACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTAGTATTCATTGTCTTTCACATGATGGCCTACCTGGTTTACCAGCATc < 2:151032/148‑1 (MQ=255) aCGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACCTGCTGGCCTACCTGGTTGACCAGcgccag > 6:169036/1‑144 (MQ=255) ggTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACCTGCTGGCCTACCTGGTTGACCAGCATCTGGc > 7:218294/1‑149 (MQ=255) ggTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACCTGCTGGCCTACCTGGTTGACCAGCATCTGGc > 2:331015/1‑149 (MQ=255) GTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACCTGCTGGCCTACCTGGTTGACCAGCATCTGGCt > 1:237140‑M1/1‑149 (MQ=255) | TCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGG‑GCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTTGCTGGCACTGGGCTTTTTTGTCTGTGGCTTCCAGGTCGTATTCATTGGCGTTCACCTGCTGGCCTACCTGGTTGACCAGCATCTGGCT > NC_002947/1878336‑1878628 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |