New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2098428 | 58 (0.960) | 4 (0.070) | 4/238 | NT | 6.5% | coding (1462/2358 nt) | PP_1875 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | = 2098449 | 63 (1.170) | coding (1441/2358 nt) | PP_1875 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
AAGGGCGCTGGCGGGATGGCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCC > NC_002947/2098280‑2098575 | aaGGGCGCTGGCGGGATGGCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCC < 5:255817‑M1/149‑1 (MQ=255) aaGGGCGCTGGCGGGATGGCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCC > 4:10063‑M1/1‑149 (MQ=255) gCGGGATGGCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGTCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTgg < 5:155777/149‑1 (MQ=255) gCGGGATGGCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTgg > 3:92766/1‑149 (MQ=255) tGGCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTg < 2:331048/149‑1 (MQ=255) ttCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGc > 3:78873/1‑149 (MQ=255) ggTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCg > 3:27338‑M2/1‑147 (MQ=255) ggTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCCGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCg > 5:366666‑M2/1‑147 (MQ=255) tgtgCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCggca < 1:192838‑M2/149‑5 (MQ=255) ggTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccggcct < 2:240153‑M1/149‑33 (MQ=255) cGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTg > 2:240988/1‑148 (MQ=255) ggCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTg > 1:3446/1‑147 (MQ=255) gCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGACCCAGGCCGGTGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccggcctgggcctgg < 7:92923‑M1/149‑41 (MQ=255) tCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTg > 4:118481/1‑149 (MQ=255) gcggTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGaa < 2:313561/149‑1 (MQ=255) ggTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGCCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTgg > 1:246889/1‑145 (MQ=255) gCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTggg > 1:185617/1‑149 (MQ=255) ccAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTgg > 5:313832/1‑147 (MQ=255) ccAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTgg < 6:313832/147‑1 (MQ=255) ccAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGc > 5:89335/1‑149 (MQ=255) cccGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTc > 4:47616/1‑149 (MQ=255) ccGGCTCGCAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGATACGCGTCAA‑ATCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCg < 8:334162/149‑1 (MQ=255) cGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCgg < 1:240988/149‑1 (MQ=255) ggCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCggg < 2:192838/149‑1 (MQ=255) ggCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCggg < 3:10063/149‑1 (MQ=255) cTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGga > 8:261172/1‑149 (MQ=255) ggAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgc > 3:145864/1‑149 (MQ=255) aGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgcc > 6:367716/1‑148 (MQ=255) gCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgccga < 7:261172/149‑1 (MQ=255) gAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAAGAGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgccgat > 1:270010/1‑149 (MQ=255) gAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGGAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgccgatg > 1:207739/1‑149 (MQ=255) gAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGgatgccgat < 2:185617/148‑1 (MQ=255) gCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccgg < 7:170423‑M1/90‑30 (MQ=255) gCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccgg > 8:170423‑M1/1‑61 (MQ=255) gCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTa > 5:295840/1‑149 (MQ=255) cAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTa < 6:89335/148‑1 (MQ=255) ggTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATcc < 5:367716/149‑1 (MQ=255) gTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATccc < 7:162394/149‑1 (MQ=255) gTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATccc > 4:199513/1‑149 (MQ=255) ccTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTACGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTAcc > 3:168773/1‑149 (MQ=255) ccTGCAT‑GCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCt > 4:191557/1‑149 (MQ=255) cTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGG‑TGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTc > 6:214539/1‑149 (MQ=255) tGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTc > 8:310306/1‑149 (MQ=255) aTGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTc > 5:46626/1‑146 (MQ=255) ccTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGc > 1:64541/1‑149 (MQ=255) gCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGcaca < 3:118481/148‑1 (MQ=255) acaGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCAcacca > 2:352064/1‑149 (MQ=255) gTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGa < 2:270010/149‑1 (MQ=255) gcgTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATg < 7:255253/149‑1 (MQ=255) gcgTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTACGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATg < 4:168773/149‑1 (MQ=255) gTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGgc > 8:332688/1‑149 (MQ=255) tCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGgcc > 2:338009/1‑149 (MQ=255) tCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGgcc > 2:343442/1‑149 (MQ=255) aa‑aGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGgccgc > 4:181127/1‑149 (MQ=255) gCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGgccgcc > 7:112092/1‑147 (MQ=255) ccaggcccaggcCGGTGCCACCGTACTGGTGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATggacaacgg > 7:94062/1‑141 (MQ=255) ccaggcccaggcCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCggcaccggcctgggtctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcagctgttttaccgccgaattgc < 7:92923‑M2/149‑110 (MQ=255) ccaggcccaggcCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAg > 4:340450/1‑149 (MQ=255) ccaggcccaggcCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAg < 1:273763/149‑1 (MQ=255) aggcccaggccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAgcg > 1:297484/1‑149 (MQ=255) ccaggccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACg > 3:312325/1‑149 (MQ=255) ccaggccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACg > 1:149670/1‑149 (MQ=255) caggccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGt < 1:343442/149‑1 (MQ=255) caggccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGt < 1:338009/149‑1 (MQ=255) aggccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcagctgttttaccgccgaattgccgctgacc < 2:240153‑M2/149‑118 (MQ=255) aggccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTc < 6:46626/149‑1 (MQ=255) gccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGa > 3:139230/1‑149 (MQ=255) ccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgc < 7:170423‑M2/90‑62 (MQ=255) ccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgc > 8:170423‑M2/1‑29 (MQ=255) ccGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGAc < 3:191557/149‑1 (MQ=255) cGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGAcg > 6:241001/1‑149 (MQ=255) tGCCggcatcacccgccagtacggtggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcagctgttttaccgccgaattgccgctgaccgtgcaca < 1:192838‑M1/149‑146 (MQ=255) gCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGc > 8:65353/1‑149 (MQ=255) cggcatcacccgccagtacggtggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcggctgttttaccgccgaattgccgctgaccgtgcacacc > 5:366666‑M1/1‑1 (MQ=255) cggcatcacccgccagtacggtggcaccggcctgggcctggctttgacgcgtaacctgtgcaaggccatgcagggccacctgcacattcgctccgagccgggctttggcagctgttttaccgccgaattgccgctgaccgtgcacacc > 3:27338‑M1/1‑1 (MQ=255) | AAGGGCGCTGGCGGGATGGCTTCGGTGTGCACGGTCAGCGGCAATTCGGCGGTAAAACAGCTGCCAAAGCCCGGCTCGGAGCGAATGTGCAGGTGGCCCTGCATGGCCTTGCACAGGTTACGCGTCAA‑AGCCAGGCCCAGGCCGGTGCCACCGTACTGGCGGGTGATGCCGGCACCGGCCTGGGTGAAGGGCTGGAAGATGCGCGCCTGGGCGTCTTCGGGGATGCCGATGCCGGTATCCCGTACCTCCAGACGCACACCACCGACAATGGCCGCCAAGCGCACGTCGACGCGGCC > NC_002947/2098280‑2098575 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |