New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2303706 = | 39 (0.650) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 6.5% | coding (1136/1632 nt) | PP_2027 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2303772 = | 49 (0.850) | coding (1070/1632 nt) | PP_2027 | hypothetical protein |
CCACCACAGGGCAAAGCCCAGCACGGTGGTCAGGGCAAACACCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATGCCCCGTTCGCTGATTTCG > NC_002947/2303558‑2303852 | tgccgccgctgccggctacggagatcatcggcctgcgccgttaccctgaccagccgctgctgcgcaacgaaatcagcgaacggggcatgaccgccgaccgcgaagagcgcgaggccctggtgccgacccacagcggcacgctggcgttg < 6:22380‑M1/1‑1 (MQ=255) caccacAGGGCAAAGCCCAGCACGGTGGTCAGGGCAAACACCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTgcgcgc > 6:9636/1‑149 (MQ=255) ccgccgctgccggctacggagatcatcggcctgcgccgttaccctgaccagccgctgctgcgcaacgaaatcagcgaacggggcatgaccgccaaccgcgaagagcgcgaggccctggtgccgacccacagcggcacgctggcgttg > 6:195890‑M1/147‑147 (MQ=255) ccgccgctgccggctacggagatcatcggcctgcgccgttaccctgaccagccgctgctgcgcaacgaaatcagcgaacggggcatgaccgccaaccgcgaagagcgcgaggccctggtgccgacccacagcggcacgctggcgttg > 4:356958‑M1/147‑147 (MQ=255) gccgctgccggctacggagatcatcggcctgcgccgttaccctgaccagccgctgctgcgcaacgaaatcagcgaacggggcatgaccgccaaccgcgaagagcgcgaggccctggtgccgacccacagcggcacgctggcgttGCCgg > 3:296788‑M1/145‑149 (MQ=255) acaGGGCAAAGCCCAGCACGGTGGTCAGGGCAAACACCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCgg > 2:292615/1‑148 (MQ=255) acaGGGCAAAGCCCAGCACGGTGGTCAGGGCAAACACCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGc > 4:189593/1‑149 (MQ=255) caGGGCAAAGCCCAGCACGGTGGTCAGGGCAAACACCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGACgg > 5:254551/1‑147 (MQ=255) aaGCCCAGCACGGTGGTCAGGGCAAACACCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGgctgct < 8:8565/149‑1 (MQ=255) aaGCCCAGCACGGTGGTCAGGGCAAACACCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGgctgct < 2:22279/149‑1 (MQ=255) cAGCACGGTGGTCAGGGCAAACACCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCt > 6:325132/1‑149 (MQ=255) gggCAAACACCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTcg > 5:367691/1‑149 (MQ=255) cAAACACCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCgg > 8:225136/1‑149 (MQ=255) acacCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGgtg > 7:212096/1‑149 (MQ=255) acacCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGgtg < 6:254551/149‑1 (MQ=255) cacCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGgtgt < 5:9636/149‑1 (MQ=255) cAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTc > 2:208843/1‑148 (MQ=255) cctgaccagccgctgctgcgcaacgaaatcagcgaacggggcatgaccgccaaccgcgaagagcgcgaggccctggtgccgacccacagcggcacgctggcgttGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTccac < 3:151346‑M1/45‑1 (MQ=255) tgGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAg < 5:325132/149‑1 (MQ=255) gACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTc < 1:128084/141‑1 (MQ=255) gACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTc > 2:128084/1‑141 (MQ=255) ccAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTc > 1:132159/1‑147 (MQ=255) ccAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTc < 1:208843/147‑1 (MQ=255) cAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAg > 2:188667/1‑149 (MQ=255) ggCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAgcgc < 8:212096/149‑1 (MQ=255) gaaatcagcgaacggggcatgaccgccaaccgcgaagagcgcgaggccctggtgccgacccacagcggcacgctggcgttGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAAc > 4:151346‑M1/81‑149 (MQ=255) cgggCGCTGCTGTTGGCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGt < 6:262516/147‑1 (MQ=255) ctgTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTGTTCGCGGGTGTTGCGCCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGGCGCggtg > 6:310783/1‑149 (MQ=255) ccACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCAcc > 3:113983/1‑149 (MQ=255) cACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCAc > 1:297196/1‑147 (MQ=255) aCCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAg > 7:256844/1‑149 (MQ=255) cGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAggg > 4:91563/1‑149 (MQ=255) tgtCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTcg < 8:256844/149‑1 (MQ=255) cgcgaggccctggtgccgacccacagcggcacgctggcgttGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCaa > 8:178818‑M1/42‑109 (MQ=255) gcgcTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGctc > 5:305019/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCgg < 1:188667/149‑1 (MQ=255) ggTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCg > 4:41244/1‑149 (MQ=255) ggTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCg < 2:132159/149‑1 (MQ=255) cAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATg < 1:292615/148‑1 (MQ=255) cAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATGc < 6:367691/149‑1 (MQ=255) cAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATGc > 7:316957/1‑149 (MQ=255) cAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATGc < 3:41244/149‑1 (MQ=255) cAGCACGTTCAGCGGGCGCGACGGCAGGCTGCTGTGCG‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCTCTCTTCGCTGTTGGCGGTCATg < 3:189593/148‑1 (MQ=255) gTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCTGCCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATGCCCCGt > 1:234077/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATGCCCCGtt > 7:302163/1‑149 (MQ=255) tCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCTGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATGCCCCGTTCg > 2:349658/1‑149 (MQ=255) tCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATGCCCCGTTCg > 7:104607/1‑149 (MQ=255) aGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCTACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATGCCCCGTTCGc < 8:191981/148‑1 (MQ=255) gCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACGAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATGCCCCGTTCGCt > 5:259691/1‑148 (MQ=255) gcgcCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATGCCCCGTTCGCTGATTTCg > 2:338014/1‑149 (MQ=255) | CCACCACAGGGCAAAGCCCAGCACGGTGGTCAGGGCAAACACCAGTGTGGACAGCTGCCAGGGCCACAGCAGGGTGCTGGCGCTGCTGTTGTCGCCCACCGGGGTGTCGGCGCTCAGTGCCGGGTTGTCCAGCACGTTCAGCGTGCGCGCCGGCAGGCTGCTGTGCT‑CCAGGTGGTCTTCGCGGGTGTTCCACCAGGCCACTTCCAGCGCCGGCAACGCCAGCGTGCCGCTGTGGGTCGGCACCAGGGCCTCGCGCTCTTCGCGGTTGGCGGTCATGCCCCGTTCGCTGATTTCG > NC_002947/2303558‑2303852 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |