New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2669969 = | 49 (0.810) | 3 (0.050) | 3/258 | NT | 6.4% | coding (2349/2610 nt) | acnB | aconitate hydratase B |
? | NC_002947 | 2670006 = | 40 (0.690) | coding (2312/2610 nt) | acnB | aconitate hydratase B |
CTGCATGTACTCTTCGACGGTCGGCAGTTTGCCGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTCGGAA > NC_002947/2669825‑2670117 | cTGCATGTACTCTTCGACGGTCGGCAGTTTGCCGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGc < 3:144551/148‑1 (MQ=255) cTGCATGTACTCTTCGACGGTCGGCAGTTTGCCGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCa < 1:226744/149‑1 (MQ=255) ttCGACGGTCGGCAGTTTGCCGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGGGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGt > 8:86558/1‑149 (MQ=255) ttCGACGGTCGGCAGTTTGCCGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTg < 1:179354/147‑1 (MQ=255) ttCGACGGTCGGCAGTTTGCCGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGt > 4:336076/1‑149 (MQ=255) gACGGTCGGCAGTTTGCCGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGc > 4:127282/1‑149 (MQ=255) gACGGTCGGCAGTTTGCCGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGGTACCGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGACCCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCAGGTTGc > 3:59241/1‑149 (MQ=255) ggCAGTTTGCCGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGACCAGACGGTTCGGGAAGTTACGTGTCGAGGTGGAGACAACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGca > 2:103889/1‑149 (MQ=255) tGCCGATGATCGTCGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCTGGTACACGGTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTGCGGGAAGTTCCGGGTCGAGGGGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGa < 4:59241/148‑1 (MQ=255) gCCGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGag < 7:68985/148‑1 (MQ=255) ccGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGagca < 1:320959/149‑1 (MQ=255) cGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGagcag < 3:336076/149‑1 (MQ=255) gatgatCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGccc > 5:85358/1‑133 (MQ=255) gatgatCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGccc < 6:85358/133‑1 (MQ=255) gatgatCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGagcagc > 1:36043/1‑149 (MQ=255) tCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCTCATGCACAGCGAGCAGCCTgg < 3:127282/148‑1 (MQ=255) tCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTgg > 5:31203/1‑148 (MQ=255) tCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGc < 2:36043/149‑1 (MQ=255) gAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCAt > 2:219344/1‑149 (MQ=255) gCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTc < 5:324909/149‑1 (MQ=255) gACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCa > 5:70761/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATa < 3:44871/149‑1 (MQ=255) cGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATAc > 7:303151/1‑147 (MQ=255) cGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATAc < 8:303151/147‑1 (MQ=255) gccaaccaagatggacgctcaccagctgaccgaagaaggctactacggcatctacggcaaggccggtgcacgtatggaaatgccaggCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGagcag > 7:123341‑M1/88‑124 (MQ=255) gccaaccaagatggacgctcaccagctgaccgaagaaggctactacggcatctacggcaaggccggtgcacgtatggaaatgccaggCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGagcag < 8:123341‑M1/37‑1 (MQ=255) ggCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACCGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGc < 1:3764/116‑1 (MQ=255) ggCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGc > 2:3764/1‑115 (MQ=255) gCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCtt < 6:70761/149‑1 (MQ=255) gCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCATCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCtt > 6:183042/1‑149 (MQ=255) cAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGa < 1:219344/149‑1 (MQ=255) cacGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCgt < 5:200033/149‑1 (MQ=255) cacGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCg < 8:176544/148‑1 (MQ=255) tcgcgtcgcCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCct > 5:256566/1‑149 (MQ=255) gtcgcCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCcttctt > 5:237233/1‑149 (MQ=255) aCGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTAGGTCAGCt > 6:298759/1‑149 (MQ=255) cGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTg < 6:31203/149‑1 (MQ=255) ggTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTgg > 1:300738/1‑149 (MQ=255) ttCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTg < 6:237233/149‑1 (MQ=255) cGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGa < 5:183042/148‑1 (MQ=255) gggAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGTACCGGCCTTGCCGTAg < 8:9776/114‑1 (MQ=255) gggAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGTACCGGCCTTGCCGTAg > 7:9776/1‑114 (MQ=255) gggAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGc > 7:130436/1‑149 (MQ=255) ctacggcaaggccggtgcacgtatggaaatgccaggCTGCT‑CGCTGTGCATGGGCAACCAGGCAC‑GCGTGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCa < 7:61782‑M1/113‑1 (MQ=255) tACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCgtagt > 6:161983/1‑117 (MQ=255) tACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCgtagt < 5:161983/117‑1 (MQ=255) gggTCGAGGTGGATACCACGGTCGAACCTGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGTCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCttg < 1:103889/149‑1 (MQ=255) ggTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCttgg < 6:85434/149‑1 (MQ=255) tGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGa < 2:300738/149‑1 (MQ=255) cACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGa < 4:274854/142‑1 (MQ=255) cACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGa > 3:274854/1‑142 (MQ=255) aCGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAgccagcca > 7:287750/1‑149 (MQ=255) gAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCTGAGCCAGCCAAAGACg > 8:154553/1‑149 (MQ=255) aCCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACggg > 1:263283/1‑149 (MQ=255) cGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTc < 8:264484/149‑1 (MQ=255) cGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTc > 6:356061/1‑149 (MQ=255) gTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTCg > 3:13301/1‑148 (MQ=255) CTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTCGGaa > 8:287750‑M1/1‑149 (MQ=255) | CTGCATGTACTCTTCGACGGTCGGCAGTTTGCCGATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCA‑CGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTCGGAA > NC_002947/2669825‑2670117 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |