New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2669969 = | 49 (0.810) | 3 (0.050) | 3/258 | NT | 6.4% | coding (2349/2610 nt) | acnB | aconitate hydratase B |
? | NC_002947 | 2670006 = | 40 (0.690) | coding (2312/2610 nt) | acnB | aconitate hydratase B |
GATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTCGGAATGCCACCCTTGACCTTCTCCAGCA > NC_002947/2669858‑2670141 | gatgatCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGagcagc > 1:36043/1‑149 (MQ=255) tCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCTCATGCACAGCGAGCAGCCTgg < 3:127282/148‑1 (MQ=255) tCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTgg > 5:31203/1‑148 (MQ=255) tCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGc < 2:36043/149‑1 (MQ=255) gAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCAt > 2:219344/1‑149 (MQ=255) gCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTc < 5:324909/149‑1 (MQ=255) gACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCa > 5:70761/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATa < 3:44871/149‑1 (MQ=255) cGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATAc < 8:303151/147‑1 (MQ=255) cGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATAc > 7:303151/1‑147 (MQ=255) gCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCtt < 6:70761/149‑1 (MQ=255) gCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCATCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCtt > 6:183042/1‑149 (MQ=255) tggacgctcaccagctgaccgaagaaggctactacggcatctacggcaaggccggtgcacgtatggaaatgccaggctgcacgcgtgcctggttgcccatgcacagcgagcagCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAg < 7:61782‑M2/36‑1 (MQ=255) cAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGa < 1:219344/149‑1 (MQ=255) cacGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCgt < 5:200033/149‑1 (MQ=255) cacGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCg < 8:176544/148‑1 (MQ=255) tcgcgtcgcCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCct > 5:256566/1‑149 (MQ=255) gtcgcCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCcttctt > 5:237233/1‑149 (MQ=255) aCGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTAGGTCAGCt > 6:298759/1‑149 (MQ=255) cGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTg < 6:31203/149‑1 (MQ=255) ggTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTgg > 1:300738/1‑149 (MQ=255) ttCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTg < 6:237233/149‑1 (MQ=255) cGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGa < 5:183042/148‑1 (MQ=255) gggAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGTACCGGCCTTGCCGTAg < 8:9776/114‑1 (MQ=255) gggAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGTACCGGCCTTGCCGTAg > 7:9776/1‑114 (MQ=255) gggAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGc > 7:130436/1‑149 (MQ=255) ctacggcaaggccggtgcacgtatggaaatgccaggCTGCTCGCTGTGCATGGGCAACCAGGCAC‑GCGTGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCa < 7:61782‑M1/113‑1 (MQ=255) tACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCgtagt > 6:161983/1‑117 (MQ=255) tACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCgtagt < 5:161983/117‑1 (MQ=255) gggTCGAGGTGGATACCACGGTCGAACCTGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGTCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCttg < 1:103889/149‑1 (MQ=255) ggTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCttgg < 6:85434/149‑1 (MQ=255) tGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGa < 2:300738/149‑1 (MQ=255) cACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGa < 4:274854/142‑1 (MQ=255) cACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGa > 3:274854/1‑142 (MQ=255) aCGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAgccagcca > 7:287750/1‑149 (MQ=255) gAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCTGAGCCAGCCAAAGACg > 8:154553/1‑149 (MQ=255) aCCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACggg > 1:263283/1‑149 (MQ=255) cGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTc > 6:356061/1‑149 (MQ=255) cGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTc < 8:264484/149‑1 (MQ=255) gTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTCg > 3:13301/1‑148 (MQ=255) CTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTCGGaa > 8:287750‑M1/1‑149 (MQ=255) ctgctcgctgtgcatgggcaaccaggcacgcgtgcagCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGc < 8:123341‑M2/87‑1 (MQ=255) ctgctcgctgtgcatgggcaaccaggcacgcgtgcagCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGc > 7:123341‑M2/38‑124 (MQ=255) aCGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCGACAGACGGGTCGGAATGc > 7:254913/1‑148 (MQ=255) gc‑gTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTCGGAATGCCAc < 7:86558/149‑1 (MQ=255) tGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACTGGTCGGAATGCCACCCTTGag > 5:306579/1‑148 (MQ=255) gTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGCCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGATCGTCCATCTTGGTTGGAGTAGCCATCCACAGACTGGTCGGAATGCCACCCTTGACCt < 4:100860/149‑1 (MQ=255) cacaGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATAGGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTCGGAATGCCACCCTTGACCTTCTCcatca < 8:130436/148‑1 (MQ=255) ggCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTCGGAATGCCACCCtt < 5:377383/130‑1 (MQ=255) ggCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTCGGAATGCCACCCtt > 6:377383/2‑131 (MQ=255) | GATGATCGAAGCGACAGCGGCCAGCTCGGCCGATGCCAGGTACACGTTGGTCGCGTCGCCCAGACGGTTCGGGAAGTTACGGGTCGAGGTGGAGACCACGGTCGAACCGGTCTGCACGC‑GTGCCTGGTTGCCCATGCACAGCGAGCAGCCTGGCATTTCCATACGTGCACCGGCCTTGCCGTAGATGCCGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAGCTGGTGAGCGTCCATCTTGGTTGGCGGAGCCAGCCACAGACGGGTCGGAATGCCACCCTTGACCTTCTCCAGCA > NC_002947/2669858‑2670141 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |