New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2775292 | 51 (0.850) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 6.8% | coding (220/1353 nt) | PP_5521 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2775325 | 62 (1.100) | coding (187/1353 nt) | PP_5521 | hypothetical protein |
GCATGCCGATGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGACTGCC > NC_002947/2775145‑2775440 | gCATGCCGATGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCa < 8:316701/149‑1 (MQ=255) gCCGATGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGAc > 8:54497/1‑149 (MQ=255) gCCGATGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGAc > 5:194981/1‑149 (MQ=255) cGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTgg < 6:87159/148‑1 (MQ=255) gggCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGct > 3:189422/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGctgcc > 7:33208/1‑149 (MQ=255) tGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCt > 4:180794/1‑149 (MQ=255) ccATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCt < 4:11890/147‑1 (MQ=255) cagcagcagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAgg < 6:72996‑M2/149‑3 (MQ=255) cagcagcagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAg > 6:194981‑M2/1‑147 (MQ=255) agcagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCtggctgtcagccctgcaggcagccaaccgtcctggcgtc > 2:362914‑M1/1‑110 (MQ=255) gcagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAggcgtc < 4:283695‑M2/148‑7 (MQ=255) cagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGTCtggctgtcagccctgcaggcagccaaccgtcctggcgtcga < 5:45098‑M1/149‑42 (MQ=255) cagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAggcgtcga > 7:153959‑M2/1‑141 (MQ=255) agGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGCCtggctgtcagccctgcaggcagccaaccgtcctg < 3:105379‑M1/149‑35 (MQ=255) cATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCtggctgtcagccctgcaggcagccaaccgtcctggcgtcgacgaac < 1:362914‑M1/149‑47 (MQ=255) aTGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGgt < 3:283695/149‑1 (MQ=255) tGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGgtg > 3:165890/1‑149 (MQ=255) cTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTc < 7:54497/149‑1 (MQ=255) cTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTc > 6:62520/1‑149 (MQ=255) tGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCg > 1:161980/1‑149 (MQ=255) gATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCgg > 8:247699/1‑149 (MQ=255) aTGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCgg < 7:247699/148‑1 (MQ=255) cTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCg < 3:312144/149‑1 (MQ=255) cGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGTCCAGGCCTTGCTGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGcc > 5:264359/1‑149 (MQ=255) cGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGcc > 8:87631/1‑149 (MQ=255) tCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCgg > 5:2633/1‑149 (MQ=255) cTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGc > 7:245114/1‑149 (MQ=255) ttCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGct > 5:290707/1‑149 (MQ=255) cGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGctct > 4:293478/1‑149 (MQ=255) ctaCGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGa < 6:264359/147‑1 (MQ=255) cAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGa < 1:242943/149‑1 (MQ=255) aaCGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAg < 1:101428/149‑1 (MQ=255) aaCGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAg < 3:180794/149‑1 (MQ=255) ggTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGtt > 6:27273/1‑149 (MQ=255) ggTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGtt < 5:87164/149‑1 (MQ=255) tCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTc < 3:293478/148‑1 (MQ=255) aaGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCt < 3:237017/127‑1 (MQ=255) aaGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCt > 4:237017/1‑127 (MQ=255) gtggtgTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGt < 5:27273/149‑1 (MQ=255) tggtgTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTg < 7:87631/149‑1 (MQ=255) gtgtGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGAGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAg < 5:246392/132‑1 (MQ=255) gtgtGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGAGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAg > 6:246392/1‑132 (MQ=255) cGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTGCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACgg < 4:189422/149‑1 (MQ=255) gTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGccc > 1:242498/1‑149 (MQ=255) tGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGGGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCt < 6:290707/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTg > 3:176815/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGCCTTGCGGAATGCCAGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACCCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGGTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTg > 7:66269/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTgcg > 3:20387/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTgcgc > 7:284123/1‑149 (MQ=255) gCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGAc > 4:306662/1‑144 (MQ=255) gCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGAc < 3:306662/144‑1 (MQ=255) gCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGt > 2:108465/1‑149 (MQ=255) aTGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTg < 6:2633/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGAc > 2:947/1‑149 (MQ=255) tGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGcgcg < 4:181511/132‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGcc < 1:947/148‑1 (MQ=255) cgcTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTg < 4:20387/149‑1 (MQ=255) tgTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCa > 3:145053/1‑147 (MQ=255) gTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAggcgtcgacgaacagcagcgccaggcattccgcaaggcctggccacccgcacaccaccccttgataccgttgctcgaagaccacggccaaggcatcagccatg < 1:362914‑M2/149‑104 (MQ=255) ttCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATa < 5:72996/147‑1 (MQ=255) cgtc‑‑‑‑‑‑‑‑gACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGc < 8:284123/148‑1 (MQ=255) gtc‑‑‑‑‑‑‑‑gACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGa > 5:223961/1‑149 (MQ=255) tc‑‑‑‑‑‑‑‑gACGCCtggctgtcagccctgcaggcagccaaccgtcctggcgtcgacgaacagcagcgccaggcattccgcaaggcctggccacccgcacaccaccccttgataccgttgctcgaagaccacggccaaggcatcagccatgtcctg > 7:153959‑M1/1‑8 (MQ=255) tc‑‑‑‑‑‑‑‑gACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAgacgtcgacgaacagcagcgccaggcattccgcaaggcctggccacccgcacaccaccccttgataccgttgctcgaagaccacggccaaggcatcagccatgtcctg < 5:45098‑M2/149‑109 (MQ=255) gACGCCtggctgtcagccctgcaggcagccaaccgtcctggcgtcgacgaacagcagcgccaggcattccgcaaggcctggccacccgcacaccaccccttgataccgttgctcgaagaccacggccaaggcatcagccatgtcctgc < 4:283695‑M1/148‑143 (MQ=255) gACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAggcgtcgacgaacagcagcgccaggcattccgcaaggcctggccacccgcacaccaccccttgataccgttgctcgaagaccacggccaaggcatcagccatgtcctgct > 2:362914‑M2/1‑39 (MQ=255) cctggctgtcagccctgcaggcagccaaccgtcctggcgtcgacgaacagcagcgccaggcattccgcaaggcctggccacccgcacaccaccccttgataccgttgctcgaagaccacggccaaggcatcagccatgtcctgctgctg < 6:72996‑M1/149‑148 (MQ=255) ctggctgtcagccctgcaggcagccaaccgtcctggcgtcgacgaacagcagcgccaggcattccgcaaggcctggccacccgcacaccaccccttgataccgttgctcgaagaccacggccaaggcatcagccatgtcctgctgctg > 6:194981‑M1/1‑1 (MQ=255) cAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAggcgtcctggcgtcgacgaacagcagcgccaggcattccgcaaggcctggccacccgcacaccaccccttgataccgttgctcgaagaccacggccaaggcatcagccatgtcct < 3:105379‑M2/149‑116 (MQ=255) | GCATGCCGATGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGACTGCC > NC_002947/2775145‑2775440 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |