New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3564614 = | 24 (0.400) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 11.8% | coding (312/1089 nt) | potF‑II | putrescine‑binding protein |
? | NC_002947 | 3564650 = | 22 (0.380) | coding (276/1089 nt) | potF‑II | putrescine‑binding protein |
GGTCCACACCCAGTGCCGCCTTGACCTTGTCGACGTTGTAGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTG > NC_002947/3564481‑3564752 | ggTCCACACCCAGTGCCGCCTTGACCTTGTCGACGTTGTAGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCgg < 1:275519/145‑1 (MQ=255) ggTCCACACCCAGTGCCGCCTTGACCTTGTCGACGTTGTAGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCgg > 2:275519/1‑145 (MQ=255) cacaCCCAGTGCCGCCTTGACCTTGTCGACGTTGTAGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTGGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTtgc > 8:135265/1‑149 (MQ=255) cacaCCCAGTGCCGCCTTGACCTTGACGACGTTGTAGCCGATGCCATAGGTGCCCCACAGGAAACGCACGGCCTACAGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTAGCTTGAGCACTATGAGGT‑CCAGGTCCTGCCACTTCGGAAGCTtgc > 5:342041/1‑149 (MQ=255) ccAGTGCCGCCTTGACCTTGTCGACGTTGTAGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTtg < 6:133142/143‑1 (MQ=255) ccAGTGCCGCCTTGACCTTGTCGACGTTGTAGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTtg > 5:133142/1‑143 (MQ=255) cgccTTGACCTTGTCGACGTTGTAGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAAt < 1:66655/149‑1 (MQ=255) gactccaacgaaacccttgaaggcaagctgttggccgggcgtacgggttatgacgtggtggtaccgtccaaccacttcctcgcccgccaggcccaggccggcgccttcCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAg > 1:100086‑M1/109‑148 (MQ=255) tccaacgaaacccttgaaggcaagctgttggccgggcgtacgggttatgacgtggtggtaccgtccaaccacttcctcgcccgccaggcccaggccggcgccttcCTACCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGaa > 6:283945‑M1/106‑144 (MQ=255) tccaacgaaacccttgaaggcaagctgttggccgggcgtacgggttatgacgtggtggtaccgtccaaccacttcctcgcccgccaggcccaggccggcgccttcCTACCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGaa < 5:283945‑M1/39‑1 (MQ=255) gACGTTGTAGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCgg > 8:75203/1‑149 (MQ=255) aGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCggcctgggcc > 1:141102/1‑149 (MQ=255) cGATGCCATTGGTGGCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTTTGGAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGgcctgggcctgg < 6:342041/149‑1 (MQ=255) ttGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGATGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGGTTGCTGCGGTACAATGTCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCTGGCGAg < 6:52970/149‑1 (MQ=255) tGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGGCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGaa < 5:345207/148‑1 (MQ=255) tGCCCAACAGGTAAGGAACGGCGTACTGGTTGCAGGGGTAGTTCTGTTAAAGTAGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCAGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGAGGTCCAATGGCAGGAAGTCGACGGCCTGAGCCTGGCGGGCGAgc > 6:345207/1‑145 (MQ=255) gTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACg < 2:141102/149‑1 (MQ=255) atggcatcGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTACTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACgg < 6:23378/142‑1 (MQ=255) gCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTacc > 7:326584/1‑149 (MQ=255) gCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTacc < 5:161133/149‑1 (MQ=255) aCTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCa > 5:143244/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTac > 5:100794/1‑135 (MQ=255) gTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTac < 6:100794/135‑1 (MQ=255) ggggTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTAc < 7:75203/149‑1 (MQ=255) ttCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGtgct < 7:286908/35‑1 (MQ=255) ttCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGtgct > 8:286908/1‑35 (MQ=255) gAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTc > 4:121353/1‑147 (MQ=255) ggggT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGATGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGt > 3:333098/1‑149 (MQ=255) gT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTg > 1:168219/1‑148 (MQ=255) | GGTCCACACCCAGTGCCGCCTTGACCTTGTCGACGTTGTAGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGT‑CCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTG > NC_002947/3564481‑3564752 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |