New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3564614 = | 24 (0.400) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 11.8% | coding (312/1089 nt) | potF‑II | putrescine‑binding protein |
? | NC_002947 | 3564650 = | 22 (0.380) | coding (276/1089 nt) | potF‑II | putrescine‑binding protein |
CTTGTCGACGTTGTAGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTGGAGTCGAACACGTCATAGACCACCTTGATTCCGCTGCT > NC_002947/3564506‑3564790 | gactccaacgaaacccttgaaggcaagctgttggccgggcgtacgggttatgacgtggtggtaccgtccaaccacttcctcgcccgccaggcccaggccggcgccttcCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAg > 1:100086‑M1/109‑148 (MQ=255) tccaacgaaacccttgaaggcaagctgttggccgggcgtacgggttatgacgtggtggtaccgtccaaccacttcctcgcccgccaggcccaggccggcgccttcCTACCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGaa > 6:283945‑M1/106‑144 (MQ=255) tccaacgaaacccttgaaggcaagctgttggccgggcgtacgggttatgacgtggtggtaccgtccaaccacttcctcgcccgccaggcccaggccggcgccttcCTACCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGaa < 5:283945‑M1/39‑1 (MQ=255) gACGTTGTAGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCgg > 8:75203/1‑149 (MQ=255) aGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCggcctgggcc > 1:141102/1‑149 (MQ=255) cGATGCCATTGGTGGCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTTTGGAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGgcctgggcctgg < 6:342041/149‑1 (MQ=255) ttGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGATGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGGTTGCTGCGGTACAATGTCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCTGGCGAg < 6:52970/149‑1 (MQ=255) tGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGGCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGaa < 5:345207/148‑1 (MQ=255) tGCCCAACAGGTAAGGAACGGCGTACTGGTTGCAGGGGTAGTTCTGTTAAAGTAGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCAGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGAGGTCCAATGGCAGGAAGTCGACGGCCTGAGCCTGGCGGGCGAgc > 6:345207/1‑145 (MQ=255) gTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACg < 2:141102/149‑1 (MQ=255) atggcatcGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTACTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACgg < 6:23378/142‑1 (MQ=255) gCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTacc > 7:326584/1‑149 (MQ=255) gCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTacc < 5:161133/149‑1 (MQ=255) aCTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCa > 5:143244/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTac > 5:100794/1‑135 (MQ=255) gTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTac < 6:100794/135‑1 (MQ=255) ggggTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTAc < 7:75203/149‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTc > 4:121353/1‑147 (MQ=255) ggggTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGATGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGt > 3:333098/1‑149 (MQ=255) gTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTg > 1:168219/1‑148 (MQ=255) cttcctgccattggaccgcagcaagcttccgaactggcagGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTGGAGTc > 1:100086‑M2/41‑148 (MQ=255) ttcctgccattggaccgcagcaagcttccgaactggtagGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTGGa > 6:283945‑M2/40‑144 (MQ=255) ttcctgccattggaccgcagcaagcttccgaactggtagGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTGGa < 5:283945‑M2/105‑1 (MQ=255) TGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTGGAGTCGAacac < 2:367043‑M1/149‑1 (MQ=255) gTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTGGAGTCGAACACGTCa > 6:141505/1‑148 (MQ=255) ttCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCGAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTGGAGTc < 2:17903/137‑1 (MQ=255) ttCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTGGAGTc > 1:17903/1‑137 (MQ=255) gctgcGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTGGAGTCGAACACGTCATAGACCACCtt < 1:367043/147‑1 (MQ=255) ggTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTGGAGTCGAAAACGTCATAGACCACCTTCATTCCg > 8:141176/1‑149 (MQ=255) aaTGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTGGAGTCGAACACGTCATAGACCACCTTGATTCCgctgct > 4:278769/1‑149 (MQ=255) | CTTGTCGACGTTGTAGCCGATGCCATTGGTGCCCCACAGGTAAGGCACGGCGTACTGGTTGCCGGGGTCGTTCTGTTCAAGTTGCTTGAGCAGTTTGGGGTCCAGGTGCTGCCAGTTCGGAAGCTTGCTGCGGTCCAATGGCAGGAAGGCGCCGGCCTGGGCCTGGCGGGCGAGGAAGTGGTTGGACGGTACCACCACGTCATAACCCGTACGCCCGGCCAACAGCTTGCCTTCAAGGGTTTCGTTGGAGTCGAACACGTCATAGACCACCTTGATTCCGCTGCT > NC_002947/3564506‑3564790 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |