| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4013887 = | 66 (1.100) | 5 (0.090) | 4/248 | NT | 8.2% | coding (229/519 nt) | PP_3541 | MgtC family transporter |
| ? | NC_002947 | 4013931 = | 50 (0.890) | coding (185/519 nt) | PP_3541 | MgtC family transporter | |||||
GCCGTGCCGATGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACTGCGCCAAGCACAGCAGCCATCAGCAA > NC_002947/4013739‑4014034 | gccgTGCCGATGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGc < 7:245329/149‑1 (MQ=255) cgTGCCGATGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCt < 6:177057/149‑1 (MQ=255) gCCGATGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGtt < 5:270337/149‑1 (MQ=255) ccGATGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTc < 5:138482/149‑1 (MQ=255) aTGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATc < 8:107790/149‑1 (MQ=255) cAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGcc > 5:56696/1‑149 (MQ=255) cAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGcc > 1:142592/1‑149 (MQ=255) cAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGcc < 8:237574/149‑1 (MQ=255) tCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATg > 2:41106/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCAGGGGTCGAGAGGCACTTCACATGACTGGGGTTGAGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGt < 7:276030/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGc < 2:171739/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCAGTTAGCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCATCGATGACCTGGAGCACCCGACTTAGTGCATCTTCATAGGACCACGCAATGCTCGGTGc > 3:209249/1‑149 (MQ=255) gCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAg < 2:213919/149‑1 (MQ=255) gCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAg < 1:41106/149‑1 (MQ=255) cGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCAt > 1:217795/1‑148 (MQ=255) ggTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATg > 7:221075/1‑148 (MQ=255) gtcgtcAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGaa < 1:369415/149‑1 (MQ=255) cgcttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACa > 3:1087‑M1/108‑149 (MQ=255) gcttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAg > 7:231791‑M1/107‑149 (MQ=255) aGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGc < 8:221075/149‑1 (MQ=255) aGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGc < 1:227551/149‑1 (MQ=255) ggCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCa < 5:206121/149‑1 (MQ=255) gctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAggg > 2:17338‑M1/103‑147 (MQ=255) gCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAg > 7:352187/1‑144 (MQ=255) gCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAg < 8:352187/144‑1 (MQ=255) ttCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGcc > 3:302045/1‑149 (MQ=255) cacaTGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGcc > 7:326994/1‑147 (MQ=255) gctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTGt < 4:223746‑M1/5‑1 (MQ=255) gctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTGt > 3:223746‑M1/93‑97 (MQ=255) tGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGa > 1:245311/1‑149 (MQ=255) gACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGa > 1:215585/1‑148 (MQ=255) aCTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGac < 4:302045/148‑1 (MQ=255) ttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAg < 2:48248‑M1/43‑1 (MQ=255) ttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAg > 1:48248‑M1/86‑128 (MQ=255) gtgtTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCa < 6:56696/148‑1 (MQ=255) gCCGTTACCCTTCAGAATGTTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTTCCTGTTCATCGGCCCCCTCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACATGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCAtgt < 3:357100/146‑1 (MQ=255) gCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCAtgtg < 3:170454/147‑1 (MQ=255) gCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCAtgtg < 2:217795/147‑1 (MQ=255) gCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCAtgt < 3:333949/146‑1 (MQ=255) gCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTggg < 2:245311/149‑1 (MQ=255) gCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTggg > 7:206827/1‑149 (MQ=255) cTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGCTCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCAccc > 8:353630/1‑149 (MQ=255) cTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCAccc > 1:205316/1‑149 (MQ=255) ttCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCAcccc > 8:107882/1‑149 (MQ=255) ttCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCAcccc > 4:42165/1‑149 (MQ=255) cAGAATGGTACCCGCACCGAGAACACCGACACCGGCACCGATGCCCTGGAGCCCCCGCCTGAGTGCCTGTTCCTCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCg < 6:370218/148‑1 (MQ=255) cAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGc < 3:327707/100‑1 (MQ=255) cAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGc > 4:327707/1‑100 (MQ=255) aaTGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAg > 4:354498/1‑149 (MQ=255) gTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTCTTCATTGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCCCCCCGGCAGACtt > 5:64857/1‑149 (MQ=255) ccGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGccc > 5:193783/1‑149 (MQ=255) gCACCGAGAAAACCGATACAGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCtt > 8:50973/1‑149 (MQ=255) cACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTtg > 2:370862/1‑149 (MQ=255) aCCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTtgt < 3:297546/149‑1 (MQ=255) agaAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTc > 5:369616/1‑149 (MQ=255) agaAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTc < 8:206827/149‑1 (MQ=255) aaCCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCa > 7:247870/1‑128 (MQ=255) aaCCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCa < 8:247870/128‑1 (MQ=255) aCCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCt < 8:326994/149‑1 (MQ=255) aTACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGaa < 5:22914/149‑1 (MQ=255) cGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGa < 6:128537/121‑1 (MQ=255) cGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGa > 5:128537/1‑121 (MQ=255) 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2:217061/109‑1 (MQ=255) gATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGTGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACTGCGCCAAGca < 2:142592/149‑1 (MQ=255) gATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACTGCGCCAAGca > 2:44993/1‑149 (MQ=255) tCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACTGCGCCAAGca > 5:313413/1‑147 (MQ=255) aCCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACTGCGCCAAGCAcag < 3:354498/148‑1 (MQ=255) aCCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGAGCTCGAAGCCCAGTACTGCGCCAAGCAcagc < 7:50973/149‑1 (MQ=255) aCTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACTGCGCCAAGCACAGCAGCCa < 6:317838/149‑1 (MQ=255) tGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACTGCGCCAAGCACAGCAGCCAt > 1:249833/1‑148 (MQ=255) tGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACTGCGCCAAGCACAGCAGCCATCAGc > 8:194217/1‑148 (MQ=255) CCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCa > 8:1037‑M1/1‑86 (MQ=255) CCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCa < 7:1037‑M1/86‑1 (MQ=255) CCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACTGCGCCAAGCACAGCAGCCATCAGCaa > 5:103978‑M1/1‑148 (MQ=255) | GCCGTGCCGATGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACTGCGCCAAGCACAGCAGCCATCAGCAA > NC_002947/4013739‑4014034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |