New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4311733 = | 77 (1.280) | 5 (0.090) | 5/256 | NT | 6.4% | coding (453/1152 nt) | PP_3784 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4311764 = | 71 (1.230) | coding (484/1152 nt) | PP_3784 | hypothetical protein |
GGTAGACACAGCTGCCATTGCCGATGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCTCCGCACCTGGATCTACATTGGCGGCATCACTCAAGGTCCTCACGATGAAACCCGCTATCAACGGGTCAATGCGGCCCGACAGGATGCTTTCCGAGAAGTCTCGATCG > NC_002947/4311586‑4311878 | ggTAGACACAGCTGCCATTGCCGATGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAAt > 7:25165/1‑149 (MQ=255) gtcgACACAGCTTCCATTGCCGTTGCACCTGCCGTGAGCGGCTCGCCCGCGGGGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATc < 6:101764/146‑1 (MQ=255) ccggaaatggcgagcacagtgcccccataccgatctagacttctcggaaagcatcctgtcgtgccgcattgaccctttgatagcgggtttcatcgtgaggaccttgagtgatgccgccaatgtagatccaggttcggagcaggtcATcc > 8:104689‑M1/146‑149 (MQ=255) ccggaaatggcgagcacagtgcccccataccgatcgagacttctcggaaagcatcctgtcgggccgcattgacccgttgatagcgggtttcatcgtgaggaccttgagtgatgccgccaatgtagatccaggtgcggagcaggtcATcc > 2:207328‑M1/146‑149 (MQ=255) gACACAGCTGCCATTGCCGATGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGc > 1:190644/1‑149 (MQ=255) gACACAGCTGCCATTGCCGATGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGc < 2:190644/149‑1 (MQ=255) cacaGCTGCCATTGCCGATGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTc < 4:178175/149‑1 (MQ=255) gagcacagtgcccccataccgatcgagacttctcggaaagcatcctgtcgggccgcattgacccgttgatagcgggtttcatcgtgaggaccttgagtgatgccgccaatgtagatccaggtgcggagcaggtcATCCGCTCATGcc < 1:327683‑M1/13‑1 (MQ=255) ccATTGCCGATGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAg < 2:55083/149‑1 (MQ=255) ccATTGCCGATGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAg < 7:307351/149‑1 (MQ=255) aTTGCCGATGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGCCGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGCCGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAggg > 5:231817/1‑149 (MQ=255) aTTGCCGATGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAggg > 8:48985/1‑149 (MQ=255) aTTGCCGATGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAggg < 7:48985/149‑1 (MQ=255) gATGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CAt > 4:242784/1‑149 (MQ=255) tGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGc < 3:242784/149‑1 (MQ=255) cACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGcc < 1:20320/148‑1 (MQ=255) aCCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCg > 8:138293/1‑148 (MQ=255) ataccgatcgagacttctcggaaagcatcctgtcgggccgcattgacccgttgatagcgggtttcatcgtgaggaccttgagtgatgccgccaatgtagatccaggtgcggagcaggtcATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGa > 2:327683‑M1/120‑149 (MQ=255) 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gCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCTCCGCAcc < 7:138293/148‑1 (MQ=255) gCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCTCCGCACCt > 8:81645/1‑149 (MQ=255) cccGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCATCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCACCCGAAAATTCTACGACGGCCTGGTATCCGCTCATGCCCAGGGGCATCATGCCGGATGACCTGCTCCGCACCt < 1:3376/149‑1 (MQ=255) cgcgGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCTCCGCACCAggg > 1:321154/1‑148 (MQ=255) gcggcgTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCTCCGCACCTGGAt < 8:25165/149‑1 (MQ=255) ttACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCTCCGCACCTGGATCTACAt > 5:104570/1‑149 (MQ=255) aCAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCt > 6:115395/1‑129 (MQ=255) aCAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCt < 5:115395/129‑1 (MQ=255) tgtcgggccgcattgacccgttgatagcgggtttcatcgtgaggaccttgagtgatgccgccaatgtagatccaggtgcggagcaggtcATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCt > 6:210109‑M1/90‑125 (MQ=255) tgtcgggccgcattgacccgttgatagcgggtttcatcgtgaggaccttgagtgatgccgccaatgtagatccaggtgcggagcaggtcATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCt < 5:210109‑M1/36‑1 (MQ=255) cAATGTCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCTCCGCACCTGGATCTACATTg < 6:262956/148‑1 (MQ=255) aaTGGCTGATCTCGCCCAGCAACTCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGCCATTCAGACGACAAATCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGCGCA‑CATGCCCCATTACCAGCACCGCACATGGATCTACATTggc > 6:288914/1‑149 (MQ=255) tGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCTCCGCACCTGGATCTACATTggcgg > 6:180598/1‑149 (MQ=255) tGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCTCCGCACCTGGATCTACATTggcgg < 6:184858/149‑1 (MQ=255) tGGCTGTTATCGTCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACTATTCTACGACGGCCTGGAATGCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CTTGCCGGATGACCTGCTCCGCACCTGGATCTACATTggcgg < 8:82740/149‑1 (MQ=255) ggCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCTCCGCACCTGGATCTACATTggcgg > 3:230922/1‑148 (MQ=255) 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gAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCTCCGCACCTGGATCTACATTGGCGGCATCACTCAAGGTCCTCACGATGAAACCCGCTATCAACGGGTCAATGCGGCCCGACAGGATGCTTTCCGAGAAGTCTCGATCg < 5:230575/148‑1 (MQ=255) | GGTAGACACAGCTGCCATTGCCGATGCACCAGCCGTGATCGGCTCGCCCGCGGCGTTACAATGGCTGTTCTCGGCCAGCAACGCGCATGCGCTCGACGATACGCAAGTTTCCCCGGCATTCAGCCGACAATTCTACGACGGCCTGGAATCCGCTCATGCCCAGGGGCA‑CATGCCGGATGACCTGCTCCGCACCTGGATCTACATTGGCGGCATCACTCAAGGTCCTCACGATGAAACCCGCTATCAACGGGTCAATGCGGCCCGACAGGATGCTTTCCGAGAAGTCTCGATCG > NC_002947/4311586‑4311878 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |