New junction evidence | |||||||||||
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GGCCTGGGCCGCCAGCAGCGAGTGACCACCCAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTCCAGCTTGCCGTTCGGGCTCAGGGGCAGCTCGGGCAACCATATGAGGTGGGCAGGCACCATGTAGTCCGGCAGGCTGCTGCGAAGGTCGGTGCGCAACTGCGCCAGAAGCTCCTGT > NC_002947/4787483‑4787777 | ggCCTGGGCCGCCAGCAGCGAGTGACCACCCAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTggg > 5:213513/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCCGCCAGCAGCGAGTGACCACCCAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGc > 4:111443/1‑149 (MQ=255) gccgccAGCAGCGAGTGACCACCCAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATc < 4:69231/149‑1 (MQ=255) cgccAGCAGCGAGTGACCACCCAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGaccgcaaggc > 4:299316‑M1/1‑139 (MQ=255) cagcagCGAGTGACCACCCAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGtt < 6:276960/149‑1 (MQ=255) gcagcGAGTGACCACCCAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGc > 6:202507/1‑149 (MQ=255) gcGAGTGACCACCCAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGc < 3:262582/149‑1 (MQ=255) gAGTGACCACCCAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAg > 6:121214/1‑149 (MQ=255) cccAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCg < 5:47868/149‑1 (MQ=255) ccAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCgg > 2:264387/1‑149 (MQ=255) cAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGt > 1:134768/1‑149 (MQ=255) cAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTccagc < 5:116118‑M2/149‑6 (MQ=255) cAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTccagc < 3:287035‑M2/149‑6 (MQ=255) aaaGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGaccgcaaggcgctgccgcaacccgatctggcccagct < 3:299316‑M1/149‑38 (MQ=255) aaaGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGaccgcaaggcgctgccgcaacccgatctggcccagc < 4:117632‑M1/148‑37 (MQ=255) aaaGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTccagct < 5:157687‑M2/149‑7 (MQ=255) aaaGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTccagct < 1:203192‑M2/149‑7 (MQ=255) gaagTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTCCAGCTTGc > 8:100030/1‑149 (MQ=255) 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aGCTGGaccgcaaggcgctgccgcaacccgatctggcccagcttcaggtgcgctatgtgccgccgtacagcgataccgaatgcaaggtcgcagcgatctgggccgatgtcctgcgcatcgagcaggtcgggctggacgacaacttcttt < 5:157687‑M1/149‑144 (MQ=255) aGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTccagcttcaggtgcgctatgtgccgccgtacagcgataccgaatgcaaggtcgcagcgatctgggccgatgtcctgcgcatcgagcaggtcgggctggacgacaacttcttt < 3:299316‑M2/149‑113 (MQ=255) aGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTCCAGCTTGCCGTTCGGGCTCAGGGGCAGCTCGGGCAACCATATGAGGTGGGCAGGCACCATGTAGTCCGGCAGGCTGCTGCGAAGGTCGGTg > 3:323994/1‑129 (MQ=255) aGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTCCAGCTTGCCGTTCGGGCTCAGGGGCAGCTCGGGCAACCATATGAGGTGGGCAGGCACCATGTAGTCCGGCAGGCTGCTGCGAAGGTCGGTg < 4:323994/129‑1 (MQ=255) aGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTCCAGCTTGCCGTTCGGGCTCAGGGGCAGCTCGGGCAACCATATGAGGTGGGCAGGCACCATGTAGTCCGGCAGGCTGCTGCGAAGGTCGGTGCGCAACTGCGCCAGAAGCTc < 7:183986/149‑1 (MQ=255) gCTGGaccgcaaggcgctgccgcaacccgatctggcccagcttcaggtgcgctatgtgccgccgtacagcgataccgaatgcaaggtcgcagcgatctgggccgatgtcctgcgcatcgagcaggtcgggctggacgacaacttctttg < 3:287035‑M1/149‑145 (MQ=255) gCTGGaccgcaaggcgctgccgcaacccgatctggcccagcttcaggtgcgctatgtgccgccgtacagcgataccgaatgcaaggtcgcagcgatctgggccgatgtcctgcgcatcgagcaggtcgggctggacgacaacttctttg < 5:116118‑M1/149‑145 (MQ=255) gCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTccagcttcaggtgcgctatgtgccgccgtacagcgataccgaatgcaaggtcgcagcgatctgggccgatgtcctgcgcatcgagcaggtcgggctggacgacaacttcttt < 4:117632‑M2/148‑113 (MQ=255) tGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTCCAGCTTGCCGTTCGGGCTCAGGGGCAGCTCGGGCAACCATATGAGGTGGGCAGGCACCATGTAGTCCGGCAGGCTGCTGCGAAGGTCGGTGCGCAACTGCGCCAGAAGCTCCTg > 5:210292/1‑149 (MQ=255) ggCCAGATCCGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTCCAGCTTGCCGTGCGGGCTCAGGGGCAGCTCGGGCAACCATATGAGGTGGGCAGGCACCATGTAGTCCGGCAGTCTGCTGCGAAGGGCGTTGCGCAACTGCGCCAGAAGCTCCTGt < 2:221826/148‑1 (MQ=255) | GGCCTGGGCCGCCAGCAGCGAGTGACCACCCAGTTCAAAGAAGTTGTCGTCCAGCCCGACCTGCTCGATGCGCAGGACATCGGCCCAGATCGCTGCGACCTTGCATTCGGTATCGCTGTACGGCGGCACATAGCGCACCTGAAGCTGGGCCAGATCGGGTTGCGGCAGCGCCTTGCGGTCCAGCTTGCCGTTCGGGCTCAGGGGCAGCTCGGGCAACCATATGAGGTGGGCAGGCACCATGTAGTCCGGCAGGCTGCTGCGAAGGTCGGTGCGCAACTGCGCCAGAAGCTCCTGT > NC_002947/4787483‑4787777 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |