| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5141238 = | 66 (1.100) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 6.2% | coding (324/894 nt) | PP_4525 | LysR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 5141272 = | 58 (1.000) | coding (290/894 nt) | PP_4525 | LysR family transcriptional regulator | |||||
CGGCACGCCATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCT > NC_002947/5141091‑5141382 | cGGCACGCCATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCa < 1:7592/149‑1 (MQ=255) ctgcgcgaacgtcagcgcctgcaactgtcgccagcaggcaaggtgctgctggactatgccaaccgtatgtccgccttgcgcgacgaagcgctgggcgccgtgcgtggcggtcagccggctggggacttcgtgctggggaccatgtaCa > 8:205271‑M1/147‑148 (MQ=255) ctgcgcgaacgtcagcgcctgcaactgtcgccagcaggcaaggtgctgctggactatgccaaccgtatgtccgccttgcgcgacgaagcgctgggcgccgtgcgtggcggtcagccggctggggacttcgtgctggggaccatgtaCa > 1:8654‑M1/147‑148 (MQ=255) ctgcgcgaacgtcagcgcctgcaactgtcgccagcaggcaaggtgctgctggactatgccaaccgtatgtccgccttgcgcgacgaagcgctgggcgccgtgcgtggcggtcagccggctggggacttcgtgctggggaccatgtaCAg < 1:147845‑M1/3‑1 (MQ=255) aCGCCATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCaa > 8:208527/1‑149 (MQ=255) ccATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGc < 2:22003/149‑1 (MQ=255) ccATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGc < 6:74480/149‑1 (MQ=255) cATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGcc < 3:336744/149‑1 (MQ=255) aGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGc > 2:224737/1‑147 (MQ=255) aGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCaa > 8:277399/1‑149 (MQ=255) gCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGt < 4:147622/149‑1 (MQ=255) aaGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTcg < 7:208527/149‑1 (MQ=255) tcgccagcaggcaaggtgctgctggactatgccaaccgtatgtccgccttgcgcgacgaagcgctgggcgccgtgcgtggcggtcagccggctggggacttcgtgctggggaccatgtaCAGCA‑CGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTg > 6:67440‑M1/120‑149 (MQ=255) cccGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGt < 1:224737/149‑1 (MQ=255) agcaggcaaggtgctgctggactatgccaaccgtatgtccgccttgcgcgacgaagcgctgggcgccgtgcgtggcggtcagccggctggggacttcgtgctgcggaccatgtaCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGt > 1:262307‑M1/115‑149 (MQ=255) ccGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGt > 1:74952/1‑148 (MQ=255) ccGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTa > 5:125326/1‑149 (MQ=255) ccGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTa > 3:330841/1‑149 (MQ=255) cGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTCGGTGCATCACGCACTAGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGAAAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTCGGTCGCCACCATGCTGTa > 5:282643/1‑148 (MQ=255) cacaAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATg < 4:330841/148‑1 (MQ=255) cacaAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATg < 7:103024/148‑1 (MQ=255) acaAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCt < 6:61523/140‑1 (MQ=255) acaAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCt > 5:61523/1‑140 (MQ=255) acaAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATgg < 6:739/148‑1 (MQ=255) acaAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATgg > 5:739/1‑148 (MQ=255) caAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTc < 7:232331/149‑1 (MQ=255) caAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTc < 7:277399/149‑1 (MQ=255) ctggactatgccaaccgtatgtccgccttgcgcgacgaagcgctgggcgccgtgcgtggcggtcagccggctggggacttcgtgctggggaccatgtac < 7:34064‑M1/1‑1 (MQ=255) ctggactatgccaaccgtatgtccgccttgcgcgacgaagcgctgggcgccgtgcgtggcggtcagccggctggggacttcgtgctggggaccatgtac > 8:34064‑M1/99‑99 (MQ=255) gccaaccgtatgtccgccttgcgcgacgaagcgctgggcgccgtgcgtggcggtcagccggctggggacttcgtgctggggaccatgtaCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCt > 7:82343‑M1/90‑122 (MQ=255) gccaaccgtatgtccgccttgcgcgacgaagcgctgggcgccgtgcgtggcggtcagccggctggggacttcgtgctggggaccatgtaCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCt < 8:82343‑M1/33‑1 (MQ=255) tgtgGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCa < 5:1501/149‑1 (MQ=255) ttCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTcgccg < 4:287716/109‑1 (MQ=255) ttCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTcgccg > 3:287716/1‑109 (MQ=255) aCAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCaa > 6:269946/1‑94 (MQ=255) aCAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCaa < 5:269946/94‑1 (MQ=255) aCAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGa > 7:58925/1‑149 (MQ=255) aaGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCcccgca > 7:277105/1‑149 (MQ=255) gCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGGACATGGTCCGCGGCACGAAGTCCGCAGCCGGCTGCCCGCcgcgcacg > 8:333775/1‑149 (MQ=255) cAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACgg > 2:366967/1‑149 (MQ=255) gccgcTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGccc < 6:125326/148‑1 (MQ=255) cgcTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCcacgc > 5:191836/1‑137 (MQ=255) cgcTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCcacgc < 6:191836/137‑1 (MQ=255) cTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAgcgc > 1:41715/1‑149 (MQ=255) tgcACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTcgc > 8:128760/1‑149 (MQ=255) cacgcacTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTcgc < 2:41715/147‑1 (MQ=255) acgcacTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCgcgc > 5:371549/1‑148 (MQ=255) cacTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAgg < 3:278541/149‑1 (MQ=255) acTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGc > 7:57205/1‑149 (MQ=255) acTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGc > 4:247569/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTTGTGATATCGCGCCAGCAAAGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCg < 6:282643/149‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCg > 1:367719/1‑148 (MQ=255) gCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGa > 8:129916/1‑148 (MQ=255) ggTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATa < 5:147483/149‑1 (MQ=255) ggTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATa < 3:271287/149‑1 (MQ=255) ggTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATa < 6:255540/149‑1 (MQ=255) gTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATAc > 3:176141/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTg < 2:74952/149‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTg < 3:297896/149‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTg < 3:82601/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTgg > 6:370941/1‑149 (MQ=255) gCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCa > 8:271684/1‑149 (MQ=255) cGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGc < 3:247569/147‑1 (MQ=255) cGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCa < 6:371549/148‑1 (MQ=255) gACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGc < 4:49778/140‑1 (MQ=255) gACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGc > 3:49778/1‑140 (MQ=255) gACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCcag < 5:40516/149‑1 (MQ=255) aCTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACTTGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTcc > 2:88128/1‑146 (MQ=255) aCTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACTTGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTcc < 1:88128/146‑1 (MQ=255) cTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCcagca < 7:271684/149‑1 (MQ=255) tGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCcagcag > 6:137022/1‑149 (MQ=255) gTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCCGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAgcagca > 7:205530/1‑149 (MQ=255) gTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCcagcag < 1:366967/147‑1 (MQ=255) aTAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGTCGGACATACGCTGGGCATAGTCCAGCAGCACCt > 6:201331/1‑149 (MQ=255) tAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCtt < 2:367719/149‑1 (MQ=255) tAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCtt < 7:129916/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCct > 1:21141/1‑149 (MQ=255) | CGGCACGCCATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCT > NC_002947/5141091‑5141382 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |