New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5404701 | 49 (0.810) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 5.6% | coding (519/801 nt) | PP_4748 | amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 5404753 | 54 (0.950) | coding (467/801 nt) | PP_4748 | amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
GGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGTTCGGAAATCTTCGTGT > NC_002947/5404554‑5404849 | ggCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGG < 5:315434‑M1/148‑1 (MQ=255) cTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATgc > 2:331787/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATgc < 4:152608/149‑1 (MQ=255) cTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATgc > 1:37818/1‑149 (MQ=255) gtgtACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCt < 7:166941/149‑1 (MQ=255) tACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGa < 6:92314/149‑1 (MQ=255) cGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGAc < 5:23412/148‑1 (MQ=255) cGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGAc < 6:238776/148‑1 (MQ=255) gAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTAGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCATCCTGGATGCGCCTGGACGt > 6:240440/1‑147 (MQ=255) aGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCAAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAgg < 1:14757/149‑1 (MQ=255) gcgcTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGAc < 7:89014/141‑1 (MQ=255) gcgcTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGAc > 8:89014/1‑141 (MQ=255) ctGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTggg < 3:52675/149‑1 (MQ=255) gggCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATgg < 2:152242/149‑1 (MQ=255) aaGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACgg > 3:328011/1‑149 (MQ=255) aaGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACgg > 4:144659/1‑149 (MQ=255) gCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACgggg > 2:211284/1‑149 (MQ=255) gCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCgg < 3:144659/149‑1 (MQ=255) cTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGACGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGACACCGCGAAGCTGTCCGCGCCACACTGGATTCGCCTGGACGTAAGGTCCTGGGCCATGGACACTGGGTTCggg > 8:302000/1‑148 (MQ=255) gACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTa < 1:211284/147‑1 (MQ=255) ccGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCa > 4:28584/1‑149 (MQ=255) cGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCAc < 2:1884‑M2/149‑2 (MQ=255) gTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCAcc < 2:180341‑M2/149‑3 (MQ=255) gTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCAcc > 2:178566‑M2/1‑147 (MQ=255) ttGCTCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGCCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCAcca > 2:289385‑M2/1‑146 (MQ=255) tCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCGTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTTGtgctctacccgaaccccgtggccatggcccaggacctgacgtccaggcgcatccaggt < 6:61074‑M1/148‑59 (MQ=255) cGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTa > 2:335223/1‑149 (MQ=255) gggCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGtgctctacccgaaccccgtggccatggcccaggacctgacgtccaggcgcatccaggttgg > 3:172924‑M1/1‑88 (MQ=255) gCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGtgctctacccgaaccccgtggccatggcccaggacctgacgtccaggcgcatccaggttggcg < 4:172924‑M1/149‑64 (MQ=255) ggACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTTCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGACCTGGGCCATGGGCACGGTGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCa > 2:93260/1‑148 (MQ=255) ggACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGcc > 5:17976/1‑115 (MQ=255) ggACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGcc < 6:17976/115‑1 (MQ=255) ggACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCAcc < 1:331787/147‑1 (MQ=255) cTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTa > 1:359201/1‑123 (MQ=255) cTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTa < 2:359201/123‑1 (MQ=255) cTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCtt > 6:25149/1‑149 (MQ=255) cTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCtt > 4:158609/1‑149 (MQ=255) gATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCttt < 6:346144/147‑1 (MQ=255) gATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTttc < 3:28584/148‑1 (MQ=255) ctctTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCa > 3:239059/1‑148 (MQ=255) tctTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGAc > 2:292420/1‑80 (MQ=255) gCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCTAAGCTGGCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATc < 7:302000/147‑1 (MQ=255) ccGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTc < 3:158609/149‑1 (MQ=255) cGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTcc < 3:250120/149‑1 (MQ=255) tgcGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTagag > 4:221485/1‑92 (MQ=255) tgcGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTagag < 3:221485/92‑1 (MQ=255) tgcGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATc < 8:89607/104‑1 (MQ=255) tgcGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATc > 7:89607/1‑104 (MQ=255) tgcGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCAc > 4:38878/1‑149 (MQ=255) gaagaaACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGt < 4:239059/149‑1 (MQ=255) aaCGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGa > 1:327334/1‑149 (MQ=255) aCGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGAt < 3:38878/149‑1 (MQ=255) ccGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAACGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCtt < 8:339966/148‑1 (MQ=255) gCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGGAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATc > 3:101196/1‑147 (MQ=255) gTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGtt > 7:253585/1‑149 (MQ=255) tCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGtt < 1:335223/148‑1 (MQ=255) tCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGTTc > 5:129580/1‑149 (MQ=255) gcgcCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGTTCGGa < 6:141286/149‑1 (MQ=255) cgcCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCAccaggttggcgcggacagcttcgcggtggccgtttcttcgcagcagaagggcggctaccccggcaagagcatcaaggtgtccgagc < 4:172924‑M2/149‑87 (MQ=255) cgcCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGTTCGGaa < 6:129580/149‑1 (MQ=255) ccAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCAccaggttggcgcggacagcttcgcggtggccgtttcttcgcagcagaagggcggctaccccggcaagagcatcaaggtgtccgagccc > 3:172924‑M2/1‑61 (MQ=255) cAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGTTCGGAAATc > 3:130119/1‑149 (MQ=255) aCCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCAcaaggttggcgcggacagcttcgcggtggccgtttcttcgcagcagaagggcggctaccccggcacgagcatcaaggtgtccgagcccga < 6:61074‑M2/148‑91 (MQ=255) ccTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGc > 6:243346/1‑117 (MQ=255) ccTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGc < 5:243346/117‑1 (MQ=255) ccTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGTTCGGAAATCTTc < 1:1884/149‑1 (MQ=255) ccTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGTTCGGAAATCTTc < 4:328011/149‑1 (MQ=255) ccTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGTTCGGAAATCTTc < 5:25149/149‑1 (MQ=255) cTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGTTCGGAAATCTTCg < 8:253585/149‑1 (MQ=255) tGGtgctctacccgaaccccgtggccatggcccaggacctgacgtccaggcgcatccaggttggcgcgggcagcttcgcggtggccgtttcttcgcagcagaagggcggctaccccggcaagagcatcaaggtgtccgagcccgagcaa > 2:289385‑M1/1‑3 (MQ=255) tGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGcc < 1:358736/104‑1 (MQ=255) tGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGcc > 2:358736/1‑104 (MQ=255) ggtgctctacccgaaccccgtggccatggcccaggacctgacgtccaggcgcatccaggttggcgcggacagcttcgcggtggccgtttcttcgcagcagaagggcggctaccccggcaagagcatcaaggtgtccgagcccgatcaac < 2:180341‑M1/149‑148 (MQ=255) ggtgctctacccgaaccccgtggccatggcccaggacctgacgtccaggcgcatccaggttggcgcggacagcttcgcggtggccgtttcttcgcagcagaagggcggctaccccggcaagagcatcaaggtgtccgagcccgatcaac > 2:178566‑M1/1‑2 (MQ=255) ggATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGTTCGGAAATCTTCgtg > 4:77302/1‑149 (MQ=255) gtgctctacccgaaccccgtggccatggcccaggacctgacgtccaggcgcatccaggttggcgcggacagcttcgcggtggccgtttcttcgcagcagaagggcggctaccccggcaagagcatcaaggtgtccgagcccgatcaacg < 2:1884‑M1/149‑149 (MQ=255) | GGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCTGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCACAGGTAGCCCTGCACGGTGCCGATACGCTTGCCATCCAGTTCGGAAATCTTCGTGT > NC_002947/5404554‑5404849 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |