New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5499260 = | 64 (1.060) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.5% | coding (38/720 nt) | cobK | precorrin‑6x reductase |
? | NC_002947 | 5499339 = | 43 (0.770) | coding (117/720 nt) | cobK | precorrin‑6x reductase |
GTGTGTGCCCACGCCCTGGCCTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGG > NC_002947/5499113‑5499406 | gtgtgtGCCCACGCCCTGGCCTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGaa < 2:92537/149‑1 (MQ=255) tgtgCCCACGCCCTGGCCTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGACAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGcc > 1:249675/1‑149 (MQ=255) tgCCCACGCCCTGGCCTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCt < 2:39307/149‑1 (MQ=255) tgCCCACGCCCTGGCCTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAACGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCt < 1:167879/149‑1 (MQ=255) cgtgcggcgctggcggcattgcggctgatttgcgcggcataggggtgggtggcgtcgatcagcagggtgatgcccgcttcgcgcaggtaacgggtcaggccctcgacacctccatagcccccgacccgcacctggcattgcAAGCCCTg > 3:43897‑M1/142‑149 (MQ=255) cgtgcggcgctggcggcattgcggctgatttgcgcggcataggggtgggtggcgtcgatcagcagggtgatgcccgcttcgcgcaggtaacgggtcaggccctcgacaccgccatagcccccgacccgcacctggcattgcAAGCCCTg > 3:226340‑M1/142‑149 (MQ=255) gtgcggcgctggcggcattgcggctgatttgcgcggcataggggtgggtggcgtcgatcagcagggtgatgcccgcttcgcgcaggtaacgggtcaggccctcgacaccgccatagcccccgacccgcacctggcattgcAAGCCCTgg < 5:56121‑M1/9‑1 (MQ=255) cccACGCCCTGGCCTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTgg < 7:114105/149‑1 (MQ=255) ccACGCCCTGGCCTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGc < 6:103549/149‑1 (MQ=255) cACGCCCTGGCCTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGc > 1:356623/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATgg > 6:11690/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATgg < 5:11690/148‑1 (MQ=255) ccTGGCCTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGc > 6:3811/1‑149 (MQ=255) cTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGcc > 2:103649/1‑148 (MQ=255) cTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGcc > 5:76395/1‑148 (MQ=255) cccGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGCCTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCg > 7:260481/1‑149 (MQ=255) cccGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCg < 6:176733/149‑1 (MQ=255) cccGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCg < 5:10155/149‑1 (MQ=255) ccGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCgg > 5:377287/1‑149 (MQ=255) gTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGc < 4:247168/149‑1 (MQ=255) tAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGcc > 7:212509/1‑135 (MQ=255) tAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGcc < 8:212509/135‑1 (MQ=255) cgtcgtGCCGGCGCAGGTGAACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAACGCGGCATCGTCGGCCACGCGGGTGTGCAATGCCTGAGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCCATGGCCCGCCAACTccgcccgc > 8:326577/1‑141 (MQ=255) gtGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACa < 1:15170/148‑1 (MQ=255) gCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTc > 4:216848/1‑142 (MQ=255) gCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTc < 3:216848/142‑1 (MQ=255) cGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTc > 3:21372/1‑148 (MQ=255) ctcAGGTTCACGTGGTAGTGTTAGCCATAGAACGCTAAGGAGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGGGGGGTTGCTGTTGATGTGAGGGGTAACTGAAGCCCTGGCGATGGCAGGCCAAATCGGTGCTCGACATGTCTaga < 2:249675/147‑3 (MQ=255) cACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGc < 7:304246/148‑1 (MQ=255) aCGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCg > 8:2638/1‑149 (MQ=255) aCGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCATGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTCGCGATGGCCCGCCAACAGGGGCATCGACATGTATACAGCCTGGCCg > 5:219103/1‑149 (MQ=255) aGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCgg < 1:103649/149‑1 (MQ=255) aGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCgg < 7:2638/149‑1 (MQ=255) gtTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCcg > 1:52241/1‑149 (MQ=255) tcagcagggtgatgcccgcttcgcgcaggtaacgggtcaggccctcgacaccgccatagcccccgacccgcacctggcattgcAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCcgcg < 8:304971‑M1/66‑1 (MQ=255) cGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGt > 7:133572/1‑149 (MQ=255) ccATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGc < 7:326577/149‑1 (MQ=255) ccATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGc < 1:334315/149‑1 (MQ=255) aTCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGccc > 5:184388/1‑149 (MQ=255) gACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAg > 6:85244/1‑149 (MQ=255) gACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAg < 3:347222/149‑1 (MQ=255) aCCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAgg > 5:137843/1‑149 (MQ=255) cccgcttcgcgcaggtaacgggtcaggccctcgacaccgccatagcccccgacccgcacctggcattgcAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTg > 7:304971‑M1/70‑149 (MQ=255) aaGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTg > 4:141359/1‑148 (MQ=255) ggcggcATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTG‑CCCAGGGCTTGCAAt < 6:377287/149‑1 (MQ=255) gcttcgcgcaggtaacgggtcaggccctcgacaccgccatagcccccgacccgcacctggcattgcAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCaa > 3:594‑M1/67‑149 (MQ=255) gcggcATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAAt < 6:76395/149‑1 (MQ=255) cATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCa < 6:137843/149‑1 (MQ=255) aTCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAg < 2:356623/149‑1 (MQ=255) aTCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAg < 4:21372/149‑1 (MQ=255) tcgGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGc > 4:76860/1‑137 (MQ=255) tcgGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGc < 3:76860/137‑1 (MQ=255) tcgGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAggaaa > 5:197552/1‑146 (MQ=255) cAATGACTGCGCGCATCCTGTTGGTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATCTCTACAGCCTGGCCGGTATTCCCCGCGTGCCACAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGc > 4:15116/1‑149 (MQ=255) aaTGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAAGGCTTGCAATGCCAGGTGCg < 3:208946/132‑1 (MQ=255) aaTGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAAGGCTTGCAATGCCAGGTGCg > 4:208946/1‑132 (MQ=255) aTGACTGCGCTCATCCTGTTGCTTGGAGGGGTCACTGAAGCGCTGGCGATGGCCCGGCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCATGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCgg < 7:297127/149‑1 (MQ=255) tGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGgt < 6:288004/149‑1 (MQ=255) tGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGgt < 8:133572/149‑1 (MQ=255) gcgcATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAgg > 3:234778/1‑149 (MQ=255) gcgcATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAgg < 8:61764/149‑1 (MQ=255) ccgcATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCTACATGTCTTCAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGGCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAgg < 6:219103/148‑1 (MQ=255) tGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGAcc > 8:113296/1‑149 (MQ=255) ttGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAg < 6:343578/108‑1 (MQ=255) ttGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAg > 5:343578/1‑108 (MQ=255) gCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGt > 4:140093/1‑148 (MQ=255) ggAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCt > 1:296407/1‑149 (MQ=255) gAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGc < 2:188968/122‑1 (MQ=255) gAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGc > 1:188968/1‑122 (MQ=255) gTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGcgcg > 6:56121/1‑148 (MQ=255) gTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGcgcg > 3:141730/1‑148 (MQ=255) tCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGcgcg > 6:139515/1‑147 (MQ=255) aCTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGc > 4:98226/1‑149 (MQ=255) AAGCCCTGGCGATGGCCCGCCCACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATTGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGGTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCgg > 3:15116‑M1/1‑147 (MQ=255) AAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCGGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGGGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCgg > 5:85244‑M1/1‑147 (MQ=255) | GTGTGTGCCCACGCCCTGGCCTTCGCCCGTAGCGTCGTGCCGGCGCAGGTGCACGTGGAAGTGTTCGCCATCGACCGCCAAGGCGGCATCGTCGGCCAGGCGGGTGTGCAATGACTGCGCGCATCCTGTTGCTGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGG > NC_002947/5499113‑5499406 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |