New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5745137 = | 76 (1.260) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 5.7% | coding (728/2451 nt) | glgP | glycogen phosphorylase |
? | NC_002947 | 5745181 = | 60 (1.050) | coding (684/2451 nt) | glgP | glycogen phosphorylase |
AAAAAGTACTCCTGGCGAAGGCGCAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCGCCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCGTTTCGA > NC_002947/5744990‑5745284 | gagcgcgccgaggtgatctacccgatcagctttggcggcagtgtcgaaacggtgcacgatgcaagcggtacccagcgccaggtatggtggccgggcgagacggtgcgggcggttgcctacgacacgccggtagtcggctggcgtggaTc < 3:338309‑M1/2‑1 (MQ=255) gagcgcgccgaggtgatctacccgatcagcgttggcggcagtgtcgaaacggagcacgatgcaagcggtccccagcgccaggtatggtggccgggcgagacggtgcgggcggttgcctacgacacgccgggagtcggctggcctggaTc < 6:121281‑M1/2‑1 (MQ=255) agcgcgccgaggtgatctacccgatcagctttggcggcagtgtcgaaacggtgcacgatgcaagcggtacccagcgccaggtatggtggccgggcgagacggtgcgggcggttgcctacgacacgccggtagtcggctggcgtggaTcc > 4:338309‑M1/147‑149 (MQ=255) agcgcgccgaggtgatctacccgatcagctttggcggcagtgtcgaaacggtgcacgatgcaagcggtacccagcgccaggtatggtggccgggcgagacggtgcgggcggttgcctacgacacgccggtagtcggctggcgtggaTcc > 5:137867‑M1/147‑149 (MQ=255) aaaaGTACTCCTGGCGAAGGCGCAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCGCCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTcc < 2:198156/149‑1 (MQ=255) aaaaGTACTCCTGGCGAAGGCGCAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCGCCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTc > 2:284580/1‑148 (MQ=255) aaaaGTACTCCTGGCGAAGGCGCAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCGCCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTc > 5:250402/1‑148 (MQ=255) gcgccgaggtgatctacccgatcagctttggcggcagtgtcgaaacggtgcacgatgcaagcggtacccagcgccaggtatggtggccgggcgagacggtgcgggcggttgcctacgacacgccggtagtcggctggcgtggaTCCAgc > 1:169361‑M1/144‑149 (MQ=255) gcgccgaggtgatctacccgatcagctttggcggcagtgtcgaaacggtgcacgatgcaagcggtacccagcgccaggtatggtggccgggcgagacggtgcgggcggttgcctacgacacgccggtagtcggctggcgtggaTCCAgc > 2:242149‑M1/144‑149 (MQ=255) gTACTCCTGGCGAAGGCGCAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCGCCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAgcg < 2:98797/149‑1 (MQ=255) tCCTGGCGAAGGCGCAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCGCCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCcg > 4:119848/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCGAAGGCGCAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCGCCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCcg > 3:150857/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCGAAGGCGCAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCGCCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCcg > 1:191870/1‑149 (MQ=255) 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tCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCTCCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGgcg > 5:7325/1‑149 (MQ=255) cACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGgcgc > 3:117990/1‑149 (MQ=255) cGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTgg > 4:128993/1‑149 (MQ=255) gcgcTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCTACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTg < 1:283988/149‑1 (MQ=255) cgcTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCt < 4:221288/130‑1 (MQ=255) cgcTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCt > 3:221288/1‑130 (MQ=255) gcTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTTCCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCa < 5:177836/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCGGCAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATc > 1:298798/1‑149 (MQ=255) aGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTg < 4:117990/149‑1 (MQ=255) tGCAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCAc < 4:142852/149‑1 (MQ=255) cAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCa > 4:141242/1‑146 (MQ=255) cAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCa < 3:141242/146‑1 (MQ=255) cAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCg > 8:113702/1‑149 (MQ=255) aGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCGt > 6:15526/1‑149 (MQ=255) gCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACTCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTTCACCCtt > 4:190770/1‑149 (MQ=255) tctTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCGTTTc > 5:346782/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCGTTTCGa > 4:274491/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGACGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCGTGCAGCGTGCACCGTTTCGa > 8:45128/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCG‑CCAGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCTGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCGTTTCGa > 2:18447/1‑149 (MQ=255) | AAAAAGTACTCCTGGCGAAGGCGCAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCGCCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCG‑CCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGC‑‑CAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCGTTTCGA > NC_002947/5744990‑5745284 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |