| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
ACCCTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCG > NC_002947/5796565‑5796858 | acCCTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC > 6:64115‑M1/1‑147 (MQ=255)acCCTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTAGCCC‑g > 7:203073/1‑149 (MQ=255) cTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGc < 6:199595/149‑1 (MQ=255) tGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGAGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GTGcc > 4:335347/1‑149 (MQ=255) cgtcgGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGaca > 7:295443/1‑149 (MQ=255) cAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCAGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCt > 7:147101/1‑149 (MQ=255) aGCGTTGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCtt > 4:333369/1‑149 (MQ=255) aGCGGCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTGGTCGCTGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGGTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCcgggccgtgtcggcccgg < 3:39179‑M1/149‑19 (MQ=255) gCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTg > 3:335347‑M2/1‑148 (MQ=255) cGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTgg < 3:171753‑M2/149‑3 (MQ=255) tCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGGTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCaagggccgtgtcggcccgggcc < 6:70245‑M1/149‑23 (MQ=255) ccTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCaagggccgtgtcggcccgggccaga < 6:300702‑M1/149‑26 (MQ=255) cTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCCCGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCGTggcccgca < 3:220451‑M2/149‑9 (MQ=255) tGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCAc > 5:254000/1‑149 (MQ=255) gATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCaagggccgtgtcggcccgggccagatcc < 6:226986‑M1/148‑29 (MQ=255) gATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCaagggccgtgtcggcccgggccagatc < 8:60152‑M1/147‑28 (MQ=255) gCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCAAGGGCCGTGTCGGCCCGgccagatccttg > 5:64115‑M2/1‑136 (MQ=255) gCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTGCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCAAGGGCCGTGTCGGCCCGgccagatccttgc > 8:44881‑M2/1‑136 (MQ=255) 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tGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCAGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGAt < 8:147101/149‑1 (MQ=255) ggCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATg < 3:231590/149‑1 (MQ=255) gcgcGAGTTCAGGCGGTTGGCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATgg < 7:326442/149‑1 (MQ=255) gcgcGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATgg > 7:297401/1‑149 (MQ=255) gcgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCaagggccgtgtcggcccgggccagatc < 1:198542‑M1/103‑28 (MQ=255) gcgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCaagggccgtgtcggcccgggccagatc > 2:198542‑M1/1‑76 (MQ=255) 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cACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTAc > 5:220849/1‑140 (MQ=255) cACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAg > 3:14684/1‑147 (MQ=255) aCGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAg > 8:88367/1‑149 (MQ=255) cGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAgg < 3:216934/149‑1 (MQ=255) cGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAgg < 5:35098/149‑1 (MQ=255) gCAAGGATCTGGCCcgggccgacacggcccttggccagatccttgccgtggacaccgcaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgc > 8:44881‑M1/1‑14 (MQ=255) gCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGca < 8:79278/149‑1 (MQ=255) cAAGGATCTGGCCcgggccgacacggcccttggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgc > 5:64115‑M1/1‑13 (MQ=255) aaGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGcaca < 4:25991/149‑1 (MQ=255) aaGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGcaca > 6:32639/1‑149 (MQ=255) aaGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCATAGACCGTTACGGTCGAGCAGGcaca < 1:342906/149‑1 (MQ=255) ggATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatc < 6:226986‑M2/148‑121 (MQ=255) gATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatc < 8:60152‑M2/147‑121 (MQ=255) gATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgc < 1:198542‑M2/103‑77 (MQ=255) gATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgc > 2:198542‑M2/1‑27 (MQ=255) tgcgggccacgggccgtgtcggcccgggccagatccttgccggggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatccag < 3:220451‑M1/145‑142 (MQ=255) tGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTg > 3:160305/1‑149 (MQ=255) ggCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacacccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatccaggcga < 6:70245‑M2/149‑128 (MQ=255) gCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGt < 2:191879/146‑1 (MQ=255) gCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGt < 8:297401/146‑1 (MQ=255) gCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTgg < 5:32639/148‑1 (MQ=255) ccc‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggcg > 1:134151/1‑149 (MQ=255) ccaagggccgtgtcggcccgggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatccaggcgacg < 3:171753‑M1/149‑148 (MQ=255) cc‑GGGCCGACACGGCCCGgccagatccttgccgtggacaccgaacccggccagatcctcgacaccgacgccagcgaccaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatccaggcgccgct < 3:39179‑M2/149‑131 (MQ=255) caagggccgtgtcggcccgggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatccaggcgacgc > 3:335347‑M1/1‑1 (MQ=255) | ACCCTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCG > NC_002947/5796565‑5796858 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |