New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5796711 | 71 (1.180) | 9 (0.160) | 8/254 | NT | 11.0% | coding (1189/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
? | NC_002947 | = 5796729 | 78 (1.360) | coding (1171/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
AGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGA > NC_002947/5796581‑5796875 | aGCGTTGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCtt > 4:333369/1‑149 (MQ=255) gCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTg > 3:335347‑M2/1‑148 (MQ=255) cGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTgg < 3:171753‑M2/149‑3 (MQ=255) cTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCCCGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCGTggcccgca < 3:220451‑M2/149‑9 (MQ=255) tGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCAc > 5:254000/1‑149 (MQ=255) gCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCAAGGGCCGTGTCGGCCCGgccagatccttg > 5:64115‑M2/1‑136 (MQ=255) gCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTGCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCAAGGGCCGTGTCGGCCCGgccagatccttgc > 8:44881‑M2/1‑136 (MQ=255) ggCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCt > 3:288008/1‑149 (MQ=255) gCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCt > 4:231590/1‑148 (MQ=255) gACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGccc < 3:311471/149‑1 (MQ=255) aCGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGccc > 6:383860/1‑148 (MQ=255) gCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCCCTTCCTCAGGCTGATAGCCCCa > 3:47911/1‑148 (MQ=255) gCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCa > 1:23668/1‑148 (MQ=255) gCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCa > 7:148659/1‑148 (MQ=255) gCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCAt < 2:299546/149‑1 (MQ=255) ccagcGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGc > 2:342906/1‑149 (MQ=255) ccagcGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGc < 2:23668/149‑1 (MQ=255) agcGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGGCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCg < 6:271167/149‑1 (MQ=255) 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ggCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATg < 3:231590/149‑1 (MQ=255) gcgcGAGTTCAGGCGGTTGGCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATgg < 7:326442/149‑1 (MQ=255) gcgcGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATgg > 7:297401/1‑149 (MQ=255) gcgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGt > 4:312236/1‑148 (MQ=255) gcgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGt > 4:216934/1‑148 (MQ=255) ttCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATTGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGt > 2:257848/1‑148 (MQ=255) ttCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTg < 2:118747/144‑1 (MQ=255) ttCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGt > 7:92607/1‑148 (MQ=255) ttCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGt > 2:322755/1‑148 (MQ=255) ttCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCCACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTg > 1:118747/1‑144 (MQ=255) aGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAAcc < 4:204070/149‑1 (MQ=255) gCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCAt > 3:161977/1‑149 (MQ=255) ggTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtg < 5:383860/149‑1 (MQ=255) gTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtgg > 5:223784/1‑149 (MQ=255) ttGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggt < 1:322755/149‑1 (MQ=255) 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cGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCg > 7:43668/1‑149 (MQ=255) gTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGt > 4:162562/1‑148 (MQ=255) gTTGCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGtt < 6:254000/149‑1 (MQ=255) tttCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTa < 8:148659/149‑1 (MQ=255) gtgtCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTc > 6:339322/1‑149 (MQ=255) 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gATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatc < 8:60152‑M2/147‑121 (MQ=255) gATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgc < 1:198542‑M2/103‑77 (MQ=255) gATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgc > 2:198542‑M2/1‑27 (MQ=255) tCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatccagg < 6:300702‑M2/149‑125 (MQ=255) tGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTg > 3:160305/1‑149 (MQ=255) ggCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacacccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatccaggcga < 6:70245‑M2/149‑128 (MQ=255) gCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGt < 8:297401/146‑1 (MQ=255) gCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGt < 2:191879/146‑1 (MQ=255) gCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTgg < 5:32639/148‑1 (MQ=255) ccc‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggcg > 1:134151/1‑149 (MQ=255) cc‑GGGCCGACACGGCCCGgccagatccttgccgtggacaccgaacccggccagatcctcgacaccgacgccagcgaccaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatccaggcgccgct < 3:39179‑M2/149‑131 (MQ=255) gACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCgg < 4:161977/149‑1 (MQ=255) cacGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGtt < 3:312236/149‑2 (MQ=255) acGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACcgcg > 5:288187/1‑133 (MQ=255) acGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACcgcg < 6:288187/133‑1 (MQ=255) ggCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCAt > 8:22728/1‑148 (MQ=255) ggCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATg < 4:160305/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGa > 2:219732/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGAc > 2:20208/1‑148 (MQ=255) cTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGa < 3:162562/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGa > 3:22458/1‑149 (MQ=255) | AGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGA > NC_002947/5796581‑5796875 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |