| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5844498 | 74 (1.230) | 4 (0.070) | 4/258 | NT | 5.2% | coding (1120/1599 nt) | PP_5122 | GMC family oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | = 5844547 | 74 (1.270) | coding (1169/1599 nt) | PP_5122 | GMC family oxidoreductase | |||||
GTGGCAAGACGGCGCAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGC > NC_002947/5844350‑5844646 | gTGGCAAGACGGCGCAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGC > 1:225089‑M1/1‑149 (MQ=255) tGGCAAGACGGCGCAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCgct > 6:5323/1‑149 (MQ=255) gCAAGACGGCGCAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCgctgc > 5:232532/1‑149 (MQ=255) aGACGGCGCAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTAc > 4:112013/1‑149 (MQ=255) aCGGCGCAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTAcgc < 5:358704/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTAcgc > 4:155860/1‑149 (MQ=255) aCGGCGCAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTAcgc < 3:94688/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGGTCGGGTTGGCTACATGCGGCAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCGGGCCAGCACCCTGCGGGGCGGGCAAGGCCACGTTTAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGa < 1:106661/149‑1 (MQ=255) gcgcAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGAt > 2:228847/1‑149 (MQ=255) cgcAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATg > 6:43344/1‑149 (MQ=255) gcAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATgg > 6:279118/1‑149 (MQ=255) gcAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATgg > 3:108971/1‑149 (MQ=255) tCCGGTTGGCTACAAGCTGTAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCAcc < 5:43344/149‑1 (MQ=255) tCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCAcc > 6:374754/1‑149 (MQ=255) tACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGc > 3:10024/1‑147 (MQ=255) tACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGc > 1:63667/1‑147 (MQ=255) aCAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGa < 8:243957/127‑1 (MQ=255) aCAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGa > 7:243957/1‑127 (MQ=255) cAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGcga < 4:46993/147‑3 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tgATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGCTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGAGCGCCTACCGCAGCATGGCacac > 3:44599/1‑149 (MQ=255) gATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTAc > 5:218051/1‑133 (MQ=255) gATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTAc < 6:218051/133‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGt > 6:120566/1‑149 (MQ=255) aTGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGt > 5:99275/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCAt > 5:155104/1‑138 (MQ=255) gCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCAt < 6:155104/138‑1 (MQ=255) tGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTgcgccagcatcacatgggtatggggcagctcggccatgcgctgggcattctcgtggccttgcccgcccagcagggtgctg < 6:346180‑M2/135‑81 (MQ=255) tGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTgcgccagcatcacatgggtatggggcagctcggccatgcgctgggcattctcgtggccttgcccgcccagcagggtgctg > 5:346180‑M2/1‑55 (MQ=255) ggCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATgg < 7:36970/137‑1 (MQ=255) ggCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATgg > 8:36970/1‑137 (MQ=255) gcgcagctccacggacccgccctggctttcggggtgaaaaccatcgcgtagcagcgccagcatcacatgggtatggggcagctcggccatgcgctgggcattctcgtggccttgcccgcccagcagggtcctggccagggccgggtgca > 7:262010‑M1/1‑4 (MQ=255) cgcTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGttt < 2:268419/149‑1 (MQ=255) gcagctccacggacccgccctggctttcggggtgaaaaccatcgcgtagcagcgccagcatcacatgggtatggggcagctcggccatgcgctgggcattctcgtggccttgcccgcccagcagggtgctggccagggccgggtgcagt < 2:244769‑M1/149‑148 (MQ=255) ctgctACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGc < 8:29878/149‑1 (MQ=255) | GTGGCAAGACGGCGCAGACGGTCCGGTTGGCTACAAGCTGGAAGTGCCGCCACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACG‑AGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGC > NC_002947/5844350‑5844646 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |