New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5844498 | 74 (1.230) | 4 (0.070) | 4/258 | NT | 5.2% | coding (1120/1599 nt) | PP_5122 | GMC family oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 5844547 | 74 (1.270) | coding (1169/1599 nt) | PP_5122 | GMC family oxidoreductase |
ACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTGCATAGCGACGCCAGCGCCGCC > NC_002947/5844401‑5844695 | aCTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTgc < 2:244769‑M2/149‑3 (MQ=255) tGCACCCGGCCCTGGCCAGGACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTgcgc > 7:262010‑M2/1‑145 (MQ=255) ccGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCCTACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCATGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGa < 5:263922/149‑1 (MQ=255) ccGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGa > 8:216733/1‑149 (MQ=255) cccTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGt > 7:29878/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGtt < 6:169061/149‑1 (MQ=255) tGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCa > 7:85081/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCt < 8:335539/149‑1 (MQ=255) gCACCCTGCTGGGCGGGAAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGCGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGACAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCtgtg > 2:55750/1‑149 (MQ=255) cccTGCTGGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTc < 1:153733/149‑1 (MQ=255) tgctgGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGAt > 8:66079/1‑149 (MQ=255) gctgGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGAt > 1:84412/1‑148 (MQ=255) ggcgggcAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑Acc < 2:145236/148‑1 (MQ=255) cgggcAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGCTTCACCTGAGCTCGATT‑CCCCgg > 2:83178/1‑149 (MQ=255) gcAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCa > 3:283000/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCAc < 6:90778/149‑1 (MQ=255) ggCCACGAGAAAGCCCAGCGGATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATCTGAGGCTGGCGCTGCTACGCGATTGGTTTCACCCCGAACCCCAGCGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGa < 4:215428/149‑1 (MQ=255) aCGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTAc < 4:10024/149‑1 (MQ=255) aCGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTAc > 1:268419/1‑149 (MQ=255) aaTGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCg < 5:279118/149‑1 (MQ=255) aaTGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCg < 8:85081/149‑1 (MQ=255) aTGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCgg < 5:374754/149‑1 (MQ=255) tGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTgcgg > 5:31708/1‑149 (MQ=255) ggCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTgcggc > 2:145207/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATTAACCCGGTCACCGACTACCTGCGTGACGGCTTgcggc < 1:55750/149‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTgcggc < 3:112013/148‑1 (MQ=255) ccGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGgcgc < 2:63667/149‑1 (MQ=255) cGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGgcgcg > 7:47534/1‑149 (MQ=255) aGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGcc < 2:225089/149‑1 (MQ=255) aGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGcc < 1:145207/149‑1 (MQ=255) gCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCt < 1:83178/149‑1 (MQ=255) cTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑Acc > 1:337752/1‑109 (MQ=255) cTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑Acc < 2:337752/109‑1 (MQ=255) ccccATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCg < 5:5323/149‑1 (MQ=255) ccccATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCg < 7:66079/149‑1 (MQ=255) cccATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTgcgccagcatcacatgggtatggggcagctcggccatgcgctgg < 5:315380‑M2/117‑45 (MQ=255) cccATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTgcgccagcatcacatgggtatggggcagctcggccatgcgctgg > 6:315380‑M2/1‑73 (MQ=255) aCCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCg > 6:172541/1‑102 (MQ=255) aCCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCg < 5:172541/102‑1 (MQ=255) ccATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATgg > 1:248752/1‑149 (MQ=255) tgATGCTGGCGCTGCTACTCGATGGGTTTCACCCCGCAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCacac < 6:31708/149‑1 (MQ=255) tgATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGCTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGAGCGCCTACCGCAGCATGGCacac > 3:44599/1‑149 (MQ=255) gATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTAc < 6:218051/133‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTAc > 5:218051/1‑133 (MQ=255) aTGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGt > 5:99275/1‑149 (MQ=255) aTGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGt > 6:120566/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCAt > 5:155104/1‑138 (MQ=255) gCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCAt < 6:155104/138‑1 (MQ=255) tGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTgcgccagcatcacatgggtatggggcagctcggccatgcgctgggcattctcgtggccttgcccgcccagcagggtgctg < 6:346180‑M2/135‑81 (MQ=255) tGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTgcgccagcatcacatgggtatggggcagctcggccatgcgctgggcattctcgtggccttgcccgcccagcagggtgctg > 5:346180‑M2/1‑55 (MQ=255) ggCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATgg > 8:36970/1‑137 (MQ=255) ggCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATgg < 7:36970/137‑1 (MQ=255) cgcTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGttt < 2:268419/149‑1 (MQ=255) ctgctACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGc < 8:29878/149‑1 (MQ=255) tgctACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGcc > 7:341643/1‑149 (MQ=255) aCGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTg > 7:318820/1‑149 (MQ=255) gcgATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGgc < 2:248752/149‑1 (MQ=255) gcgATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGgc > 3:331714/1‑149 (MQ=255) gcgATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGgc < 7:216733/149‑1 (MQ=255) gATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCgcagc > 2:244144/1‑120 (MQ=255) gATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCgcagc < 1:244144/120‑1 (MQ=255) aTGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGcc < 4:283000/149‑1 (MQ=255) gTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCAc < 8:318820/148‑1 (MQ=255) ttttCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCAcc > 1:77615/1‑148 (MQ=255) aCCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGt > 3:61298/1‑148 (MQ=255) aCCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGt > 7:204557/1‑148 (MQ=255) gAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACTTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAAcccc < 1:244769/149‑1 (MQ=255) gAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAAcccc < 4:61298/149‑1 (MQ=255) aGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGt < 6:99275/149‑1 (MQ=255) aGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGt < 8:341643/149‑1 (MQ=255) gCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTg < 1:228847/149‑1 (MQ=255) aGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTGCa > 5:194892/1‑148 (MQ=255) aGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTGCAt < 8:91529/149‑1 (MQ=255) gggCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTGCa > 2:336979/1‑147 (MQ=255) gggCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTGCa > 1:215161/1‑147 (MQ=255) cGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTGCATAGc > 4:328827/1‑148 (MQ=255) cGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTGCATAGCg < 5:120566/149‑1 (MQ=255) gggTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTGCATAGCGa < 3:328827/149‑1 (MQ=255) gTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTaa < 2:17712/131‑1 (MQ=255) gTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTaa > 1:17712/1‑131 (MQ=255) gTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTGCATAGCGACg > 4:157281/1‑149 (MQ=255) tGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTGCATAGCGACGCCAgc < 2:77615/149‑1 (MQ=255) tGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTGCATAGCGACGCCAGCgccgcc > 4:157388/1‑149 (MQ=255) | ACTGCACCCGGCCCTGGCCAGCACCCTGCTGGGCGGGCAAGGCCACGAGAATGCCCAGCGCATGGCCGAGCTGCCCCATACCCATGTGATGCTGGCGCTGCTACGCGATGGTTTTCACCCCGAAAGCCAGGGCGGGTCCGTGGAGCTGCGCGGCGATGGTTCACCTGTGCTCGATT‑ACCCGGTCACCGACTACCTGCGGGACGGCTTGCGGCGCGCCTACCGCAGCATGGCACACGTCCAGTTTGCCGCTGGCGCCACCCATGTAACCCCGGTGCATAGCGACGCCAGCGCCGCC > NC_002947/5844401‑5844695 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |