New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5919152 | 61 (1.010) | 4 (0.070) | 4/266 | NT | 6.4% | coding (151/306 nt) | PP_5189 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5919176 | 56 (0.930) | coding (175/306 nt) | PP_5189 | hypothetical protein |
CGCACAGCCCCGTACCGACGCCTGGGCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGCCTGACCAACTTGCAGCGAGTGGCGTTGGCA > NC_002947/5919007‑5919298 | cGCACAGCCCCGTACCGACGCCTGGGCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTTCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGTGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTca < 7:332485/149‑1 (MQ=255) cGCACAGCCCCGTACCGACGCCTGGGCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTca < 7:53270/149‑1 (MQ=255) cacaGCCCCGTACCGACGCCTGGGCCGCCAACAACGCCCACACCACCGTGCACAATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGAAAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTACGCCTTGCAGTACCTCACCCCGCATAGCGTGCAGGTcagc < 1:243325/149‑1 (MQ=255) ccccGTACCGACGCCTGGGCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTcagccag > 7:136410/1‑147 (MQ=255) cccGTACCGACGCCTGGGCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCcag‑cag > 6:169740/1‑149 (MQ=255) ccGTACCGACGCCTGGGCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCcag‑cag > 8:35148/1‑148 (MQ=255) ccGTACCGACGCCTGGGCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAgg < 6:360573/149‑1 (MQ=255) aCCGACGCCTGGGCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGa > 5:307208/1‑149 (MQ=255) cGACGCCTGGGCCGCCAACAACGCCCACTGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGACGCCGCGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATATGGTGCATGTAACCCAG‑CACGATGAcg > 1:213288/1‑148 (MQ=255) tGGGCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGa > 6:79155/1‑149 (MQ=255) ggCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGtcagccagtcatcctgctggctgac < 2:312080‑M1/147‑26 (MQ=255) ggCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGata < 3:251349/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGata > 7:218165/1‑149 (MQ=255) cgccAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCg < 5:79155/149‑1 (MQ=255) caacGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCg < 5:295624/149‑1 (MQ=255) gCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGAGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCAt > 1:259299/1‑149 (MQ=255) cccACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCAtt < 8:136410/149‑1 (MQ=255) cacaGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTgg > 2:54421/1‑149 (MQ=255) acaGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCATCCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGc < 7:304820/149‑1 (MQ=255) aGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCgg < 7:35148/149‑1 (MQ=255) aCCGTGCACTCTCGCCTGCACGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGCGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGATCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGtt < 4:281554/149‑1 (MQ=255) ccGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGtt > 2:162808/1‑148 (MQ=255) cGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCTCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGtt > 8:299675/1‑147 (MQ=255) tGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGCCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGc > 2:61068/1‑134 (MQ=255) tGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGCCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGc < 1:61068/134‑1 (MQ=255) cACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGCCAGCCAGTCATCCTGCC‑GGCTGAcctgcacgctatgcggggtcaggaactgcaa > 3:248374‑M2/1‑118 (MQ=255) tCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCAc < 1:160230/148‑1 (MQ=255) ccgaggccgagCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGt > 1:375012/1‑148 (MQ=255) cgagttcgagCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCATCCTGTTCGCCTTGCAGTTCGTGACCGCGCATAGAGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTTAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCa < 2:213288/143‑1 (MQ=255) aggccgagCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCAtt < 8:218165/149‑1 (MQ=255) ccgagCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGca < 8:7384/149‑1 (MQ=255) cgagCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGCCAGCCAGTCATCCTG‑CTGGCTGAcctgcacgctatgcggggtcaggaact < 3:253364‑M2/122‑28 (MQ=255) cgagCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGCCAGCCAGTCATCCTG‑CTGGCTGAcctgcacgctatgcggggtcaggaact > 4:253364‑M2/1‑95 (MQ=255) gagCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTTCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCAt < 8:88886/143‑1 (MQ=255) gagCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCAt > 7:88886/1‑143 (MQ=255) gagCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGcaca < 1:162808/149‑1 (MQ=255) cGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGc < 8:173170/129‑1 (MQ=255) cGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGc > 7:173170/1‑129 (MQ=255) gATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGatat > 1:108056/1‑92 (MQ=255) gATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGatat < 2:108056/92‑1 (MQ=255) tAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGc < 5:169740/149‑1 (MQ=255) cGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTGATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGgt < 2:259299/149‑1 (MQ=255) cGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGca > 4:169309/1‑129 (MQ=255) cGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGca < 3:169309/129‑1 (MQ=255) tCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGtgtgtgtg > 4:266355/1‑149 (MQ=255) tCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGtgtgtgtg > 4:264550/1‑149 (MQ=255) cAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTgg > 7:92318/1‑149 (MQ=255) aaCCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTggg > 4:267722/1‑149 (MQ=255) aCCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCTCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGggt < 7:299675/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGggtga < 2:375012/149‑1 (MQ=255) ttCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGggtgaggt < 1:54421/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGggtgaggtga < 3:267722/148‑1 (MQ=255) ccTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGc > 4:163256/1‑149 (MQ=255) cTTGAAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGAATGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGACGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGcc > 7:186507/1‑149 (MQ=255) ttGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGtcagccggcaggatgactggctggcctgcacgctatgcggggtcaggaactgcaaggcgaacaggttgagcacccggcacaggctatcgggctcggcctcggcctgcaggcgatagtg > 3:248374‑M1/1‑31 (MQ=255) ttGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGCCt > 1:135787/1‑149 (MQ=255) cAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGCCTGa < 2:135787/148‑1 (MQ=255) aGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGtcagccagcaggatgactggctggcctgcacgctatgcggggtcaggaactgcaaggcgaacaggttgagcacccggcacaggctatcgggctcg < 3:253364‑M1/122‑96 (MQ=255) aGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGtcagccagcaggatgactggctggcctgcacgctatgcggggtcaggaactgcaaggcgaacaggttgagcacccggcacaggctatcgggctcg > 4:253364‑M1/1‑27 (MQ=255) ccTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGCCTGACCAACt > 1:277984/1‑149 (MQ=255) tGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGCCTGACCAACTTg > 6:277445/1‑149 (MQ=255) cccGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTg > 3:224333/1‑112 (MQ=255) cccGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTg < 4:224333/112‑1 (MQ=255) cccGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGCCTGACCAACTTGCAGc > 2:136992/1‑149 (MQ=255) cccGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGCCTGACCAACTTGCAGc < 1:12296/149‑1 (MQ=255) ccGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGCCTGACCAACTTGCAGc > 7:186330/1‑148 (MQ=255) cGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGgt < 2:320919/112‑1 (MQ=255) cGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGgt > 1:320919/1‑112 (MQ=255) cGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGCCTGACCAACTTGCAGc > 1:158540/1‑147 (MQ=255) cATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGCCTGACCAACTTGCAGCGAGt < 6:307208/149‑1 (MQ=255) cGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGCCTGACCAACTTGCAGCGAGTGGCGt > 3:352592/1‑149 (MQ=255) gTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGAcctgcacgctatgcggggtcaggaactgcaaggcgaacaggttgagcacccggcacaggctatcgggctcggcctcggcctgcaggcgatagtgcacggtgctgtgggcgttgttggcggcc < 2:312080‑M2/147‑123 (MQ=255) | CGCACAGCCCCGTACCGACGCCTGGGCCGCCAACAACGCCCACAGCACCGTGCACTATCGCCTGCAGGCCGAGGCCGAGCCCGATAGCCTGTGCCGGGTGCTCAACCTGTTCGCCTTGCAGTTCCTGACCCCGCATAGCGTGCAGGTCAGCCAG‑CAGGATGACTGGCTGGATATCGAAATCGGCATTGGCGGGTTGAGCTGGCACCGGGCCGAGGTCATTGCACAGAAACTGCGTAACCTGGTGTGTGTGGGTGAGGTGAGCCTGACCAACTTGCAGCGAGTGGCGTTGGCA > NC_002947/5919007‑5919298 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |