New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 608687 = | 80 (1.330) | 6 (0.100) | 6/258 | NT | 7.0% | coding (558/813 nt) | PP_0524 | cobalamin‑binding protein HutB |
? | NC_002947 | 608720 = | 81 (1.390) | coding (591/813 nt) | PP_0524 | cobalamin‑binding protein HutB |
AGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGC > NC_002947/608572‑608867 | agTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAg < 4:266812/149‑1 (MQ=255) tATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGt > 1:168251/1‑149 (MQ=255) tATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGt < 5:290564/149‑1 (MQ=255) tCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTg > 4:57704/1‑148 (MQ=255) tCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGa < 5:245389/149‑1 (MQ=255) ggCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAAt < 3:57704/149‑1 (MQ=255) atcagccaccgcccgaatctgcggccaggccttccagctggccagttgcgcctcatcagcggccaggatgacctgcggattacgcagcagcacggactctacattcaccTGTGG‑CGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATg < 4:324074‑M1/40‑1 (MQ=255) tcagccaccgcccgaatctgcggccaggccttccagctggccagttgcgcctcatcagcggccaggatgacctgcggattacgcagcagcacggactctacattcaccTGTGG‑CGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGt > 3:324074‑M1/109‑149 (MQ=255) gCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATg > 2:100567/1‑149 (MQ=255) gTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTa < 1:217094/149‑1 (MQ=255) gTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTa < 8:18105/149‑1 (MQ=255) aCGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTa > 4:48481/1‑146 (MQ=255) aCCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATg > 4:205746/1‑140 (MQ=255) aCCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATg < 3:205746/140‑1 (MQ=255) aCCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCg < 5:171848/149‑1 (MQ=255) cccTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGt < 2:101506/149‑1 (MQ=255) ccTTGCAGGTGCTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGtg < 5:333843/149‑1 (MQ=255) cTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTTACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGtgc > 1:184768/1‑149 (MQ=255) 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ttttATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTaa > 6:59322/1‑149 (MQ=255) tATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑cc > 1:291797/1‑149 (MQ=255) aTCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCg > 5:279004/1‑149 (MQ=255) tCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTGGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTTCGTGGCGCGCATTGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CAGAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGc < 7:30300/149‑1 (MQ=255) tCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCg < 3:48481/148‑1 (MQ=255) 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cgcgcAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGGGGCTGAt < 7:319314/149‑1 (MQ=255) cgcAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATgg < 2:210550/149‑1 (MQ=255) acattcacctgtggcgccggctggccaaggtcggcgccacaGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGa > 3:324074‑M2/42‑149 (MQ=255) gcAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGATTGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAGCTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATggg > 4:215308/1‑149 (MQ=255) gcAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTg < 3:273239/121‑1 (MQ=255) gcAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTg > 4:273239/1‑121 (MQ=255) cattcacctgtggcgccggctggccaaggtcggcgccacaGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGAt < 4:324074‑M2/109‑1 (MQ=255) ttCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTctgct > 2:97222/1‑149 (MQ=255) tgtggcgccggctggccaaggtcggcgccacaGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTct > 3:186946‑M2/33‑149 (MQ=255) gtggcgccggctggccaaggtcggcgaacacaGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGcc < 8:155375‑M2/87‑1 (MQ=255) gtggcgccggctggccaaggtcggcgaacacaGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGcc > 7:155375‑M2/33‑119 (MQ=255) cGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCtgg > 5:136703/1‑149 (MQ=255) gACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTggtggt > 5:196927/1‑149 (MQ=255) ggCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCg < 3:304572/147‑1 (MQ=255) gCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGa > 6:20136/1‑148 (MQ=255) gCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGAc < 6:136703/149‑1 (MQ=255) cA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGaa > 1:161792/1‑92 (MQ=255) cA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGaa < 2:161792/92‑1 (MQ=255) cA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGc > 6:230965/1‑113 (MQ=255) cA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGc < 5:230965/113‑1 (MQ=255) cA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACa > 4:64565/1‑148 (MQ=255) a‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACaaa < 1:46075/149‑1 (MQ=255) aGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAgcgc > 5:374750‑M2/2‑149 (MQ=255) aGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAgcgc < 5:28238‑M2/148‑1 (MQ=255) | AGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCA‑‑GCCGGCGC‑CACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAAT‑CCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGC > NC_002947/608572‑608867 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |