New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1015699 | 58 (0.960) | 5 (0.090) | 5/256 | NT | 7.9% | coding (542/1431 nt) | PP_0875 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1015729 | 61 (1.050) | coding (512/1431 nt) | PP_0875 | hypothetical protein |
TTCGTAGATCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGC > NC_002947/1015587‑1015875 | ttCGTAGATCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCtcagc > 1:25151‑M2/1‑143 (MQ=255) gTAGATCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTcagccagc > 5:104842/1‑149 (MQ=255) gTAGATCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTcagccag < 5:18668/148‑1 (MQ=255) tAGATCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTcagccag > 1:152566/1‑147 (MQ=255) tAGATCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTcagccag < 2:152566/147‑1 (MQ=255) tAGATCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCg < 1:371536/149‑1 (MQ=255) tAGATCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCg < 7:139950/149‑1 (MQ=255) gATCGCTACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCgg < 5:65166/148‑1 (MQ=255) gATCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCgg > 4:50736/1‑148 (MQ=255) aTACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAgtcg > 6:80478/1‑149 (MQ=255) aTACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAgtcg > 3:285865/1‑149 (MQ=255) aTACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAgtcg > 2:190303/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCgg > 4:222245/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCgg < 4:115866/149‑1 (MQ=255) cACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCtt > 7:75089/1‑149 (MQ=255) cACTGCCCGGCCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGAGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCAGGCTCCCCAGCAGCTCGGGGCACAGCAAGCGGTAGACGTCCTCGGGCATGCCtt > 4:18479/1‑149 (MQ=255) aCTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTg > 1:132261/1‑149 (MQ=255) gCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGc > 2:169264/1‑148 (MQ=255) gCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGc < 1:169264/148‑1 (MQ=255) cccGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCtca < 5:213064‑M2/114‑4 (MQ=255) cccGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCtca > 6:213064‑M2/1‑111 (MQ=255) cGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATa < 6:332673/149‑1 (MQ=255) cGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATa < 2:212213/149‑1 (MQ=255) gCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATTGTCGCCGTGTGCGGTCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACaa < 4:160723/149‑1 (MQ=255) cAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAg < 7:20492/149‑1 (MQ=255) cAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAg < 3:50736/149‑1 (MQ=255) cACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAgg > 3:263720/1‑148 (MQ=255) cACCAGCTTGGCTCGCTGGATGGTCTCCGTGTGCGGTCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGTGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGt < 4:10523/149‑1 (MQ=255) aCCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAgg > 2:350688/1‑147 (MQ=255) cAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGG < 3:222245‑M1/149‑1 (MQ=255) ctggctggATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAgg < 2:132261/149‑1 (MQ=255) gctggATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCt < 2:42892/148‑1 (MQ=255) gctggATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCt < 5:80478/148‑1 (MQ=255) gctggATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCt < 4:285865/148‑1 (MQ=255) gctggATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCt < 4:263720/148‑1 (MQ=255) ggATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGt > 6:385752/1‑149 (MQ=255) aTGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTc < 5:203645/149‑1 (MQ=255) aTGGGCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGATGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTTGCGATACAAGTCGTCGAGGTATGCGCGCAGGCTGCGTTc < 7:157093/149‑1 (MQ=255) gCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTc > 6:367875/1‑149 (MQ=255) ccGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTcc > 2:82397/1‑149 (MQ=255) tGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACaa < 4:265960/100‑1 (MQ=255) tGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACaa > 3:265960/1‑100 (MQ=255) tAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGGCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAgcgcgcc > 8:118248‑M2/1‑140 (MQ=255) aaaTGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGcgcgcc‑gcg > 6:220422/1‑149 (MQ=255) aaTGGCTCCAAACGCTTTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGGCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCtacccggagcaggaacgcagcctgcgcgcctacc < 7:6319‑M1/149‑35 (MQ=255) tCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCATCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATa > 3:49313/1‑147 (MQ=255) tCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATa > 7:331358/1‑147 (MQ=255) cAAACTCCTTCCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGCGGCTCAGCCAGCGGTCTTCGTCCTCGGTCAAGCCTTGGCGATACAAGGCGTCGACGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAACgg < 8:69721/149‑1 (MQ=255) cAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTTGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAgg > 8:167116/1‑149 (MQ=255) cAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAg < 6:305961/148‑1 (MQ=255) cAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAg < 5:40790/148‑1 (MQ=255) cAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCGCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATaaa < 8:75089/147‑1 (MQ=255) aaCGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGAc > 4:111204/1‑149 (MQ=255) gCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGAcgcc > 4:152692/1‑149 (MQ=255) aTTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCtcagcaatgcgtttggagccatttacagaccgcacacggcgaccatacagccagccaagctggtgcgcggccttgcccgggcagtggaggcgctgggcgtatcgatctac < 4:62212‑M2/148‑111 (MQ=255) aTTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGAcgccgc > 3:43284/1‑149 (MQ=255) cTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCtcagcaatgcgtttggagccatttacagcccgcacacggcgaccatccagccagccaagctggtgcgcggccttgcccgggcagtggaggcgctgggc < 7:142138‑M2/132‑99 (MQ=255) cTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCtcagcaatgcgtttggagccatttacagcccgcacacggcgaccatccagccagccaagctggtgcgcggccttgcccgggcagtggaggcgctgggc > 8:142138‑M2/1‑34 (MQ=255) tGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTc < 6:265672/106‑1 (MQ=255) tGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTc > 5:265672/1‑106 (MQ=255) tGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTg > 2:340818/1‑149 (MQ=255) gACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCCGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGAAGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAAAAAAGGACGCCGCCTATGc > 2:335226/1‑149 (MQ=255) aCCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCg < 6:282746/149‑1 (MQ=255) cccGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCgg < 8:331358/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCtt > 6:335141/1‑143 (MQ=255) ccGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCtt < 5:335141/143‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCgg > 1:93985/1‑148 (MQ=255) ccGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCgg > 7:341351/1‑148 (MQ=255) ccGCAGCTGGCTCCCCAGCTGC‑‑GGG‑cagcaatgcgtttggagccatttacagcccgcacacggcgaccatccagccagccaagctggtgcgcggccttgcccgggcagtggaggcgctgggcgtatcgatctacgaaaataccccggc < 2:111726‑M2/149‑124 (MQ=255) cGCAGCTGGCTCCCCAGCTGC‑‑GGG‑cagcaatgcgtttggagccatttacagcccgcacacggcgaccatccagccagccaagctggtgcgcggccttgcccgggcagtggaggcgctgggcgtatcgatctacgaaaataccccggc < 1:324057‑M2/148‑124 (MQ=255) cAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGt > 4:119242/1‑149 (MQ=255) cTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCg > 1:86484/1‑148 (MQ=255) cTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCg < 2:86484/148‑1 (MQ=255) ggCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGc > 2:224103/1‑98 (MQ=255) ggCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGc < 1:224103/98‑1 (MQ=255) gCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAg < 1:350688/148‑1 (MQ=255) ccAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCtacccggagcaggaacgcagcctgcgcgcctacct < 5:374916‑M1/112‑36 (MQ=255) ccAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCtacccggagcaggaacgcagcctgcgcgcctacct > 6:374916‑M1/1‑77 (MQ=255) aGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGcc > 6:199870/1‑149 (MQ=255) ctCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCg < 1:82397/149‑1 (MQ=255) gggCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTg < 6:104842/149‑1 (MQ=255) ggCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTgc < 5:385752/149‑1 (MQ=255) gCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTgc > 4:168025/1‑148 (MQ=255) | TTCGTAGATCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCC‑GCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGC > NC_002947/1015587‑1015875 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |