New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1506411 | 55 (0.910) | 3 (0.050) | 3/256 | NT | 5.1% | coding (312/780 nt) | petC | ubiquinol‑‑cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit |
? | NC_002947 | = 1506453 | 59 (1.020) | coding (354/780 nt) | petC | ubiquinol‑‑cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit |
TCCCGCATGAACTGATGCTCGAGAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCAAGGTAACCAGGTGGTGGGTTGCAAGCAGGT > NC_002947/1506308‑1506599 | tCCCGCATGAACTGATGCTCGAGAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTacc < 2:100246‑M2/149‑4 (MQ=255) gCATGAACTGATGCTCGAGAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGAtt < 6:295778/149‑1 (MQ=255) gCATGAACTGATGCTCGAGAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGAtt > 5:67489/1‑149 (MQ=255) cATGAACTGATGCTCGAGAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTg > 8:316390/1‑149 (MQ=255) aTGAACTGATGCTCGAGAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTgg > 6:311238/1‑149 (MQ=255) gCTCGAGAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACacc > 4:29547/1‑148 (MQ=255) gagaAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTac < 1:223402/142‑1 (MQ=255) gagaAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTac > 2:223402/1‑141 (MQ=255) gagaAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACacctacct < 1:153610/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGAAAGGTGACCACATGCAGATCGGGATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTCCGACGCCCGACCTGACACTGGT‑CTCCCGCGTCCGCGGAACCGATAGGCTTTACACGTACCAGCGCa > 6:94095/1‑149 (MQ=255) tGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACAAGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGt > 1:239297/1‑149 (MQ=255) ggTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGtt > 1:342650/1‑149 (MQ=255) aGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAgg < 5:225258/149‑1 (MQ=255) ccAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGAccc > 6:25265/1‑148 (MQ=255) cAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGCCCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCAGCGTGCGCGGTACCGATTCGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCAt > 8:49491/1‑149 (MQ=255) aaGATCGTTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATc < 5:29085/149‑1 (MQ=255) cacaTGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGcc < 2:175495/142‑1 (MQ=255) cacaTGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGcc > 1:175495/1‑142 (MQ=255) cacaTGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATgg > 1:272650/1‑149 (MQ=255) caTGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATgggg > 2:144344/1‑149 (MQ=255) aTGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACTTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGt > 5:242581/1‑149 (MQ=255) aTGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGt < 1:100246/149‑1 (MQ=255) gCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATg < 6:118565/122‑1 (MQ=255) gCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATg > 5:118565/1‑122 (MQ=255) cAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGa < 5:94095/148‑1 (MQ=255) aGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACGTGACAGTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGGACCGAGTGGCTGTACACGTACCTGCGCAGTTGCTAGGAGGACCCATCCCGCGCTTGTGGGGTGaa > 8:243043/1‑148 (MQ=255) aGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTTCCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGaa > 1:3115/1‑148 (MQ=255) ggaggacgCCCCGCGACGCCCCGTCCGCGCTCGGCGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTCGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAg < 4:275577/142‑1 (MQ=255) gTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCtt < 4:24591/132‑1 (MQ=255) gTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCtt > 3:24591/1‑132 (MQ=255) tATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAgg < 3:29547/149‑1 (MQ=255) tGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGAc > 6:219639/1‑116 (MQ=255) tGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGAc < 5:219639/116‑1 (MQ=255) gAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTAt > 6:118355/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACGTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGTTATTcc < 2:239297/149‑1 (MQ=255) gCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGTCTTTACACCGAACTGCGCACTTTCTATGAGGAACCATCCCGCCCTGATGGGGGGAAAAACAAGGTATTcc > 4:320310/1‑149 (MQ=255) ccAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTccc > 5:143755/1‑148 (MQ=255) cGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTg < 5:311238/149‑1 (MQ=255) cGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTg < 6:67489/149‑1 (MQ=255) cAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCa > 5:91001/1‑149 (MQ=255) cAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCa < 3:37043/149‑1 (MQ=255) aaGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCAt < 5:25265/149‑1 (MQ=255) aaGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCGAATGGGGTGAACAAAAAGGTAATCCCGAACGTTGGCAt > 5:340335/1‑149 (MQ=255) aGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATg < 7:316390/149‑1 (MQ=255) cTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCt > 5:180972/1‑148 (MQ=255) tGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGCCCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTaccgcaccaggtcttggcgtcgctgggcttccgaccgatctgcatggggtcaccgatcttggcacctgtgaacaccagcttctcgcgcatccgttcat < 2:131736‑M2/149‑99 (MQ=255) gTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACg > 3:355685/1‑149 (MQ=255) gTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTaccgaaccaggtcttggcgtcgctgggcttcataccgatctgcatgtggtcaccgatcttggcacctgtgaacaccagcttctcgagcatcagttcatgcggga < 2:49163‑M2/148‑105 (MQ=255) gTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCtg > 5:199556/1‑149 (MQ=255) gTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCtg < 2:342650/149‑1 (MQ=255) tgctgcGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCACGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCtgg < 8:240032/149‑1 (MQ=255) ctgcGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCtggt < 7:66522/148‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTaccgaaccaggtcttggcgtcgctgggcttcataccgatctgcaggtggtcaccgatcttggcacctgtgaacaccagcttctcgagcatcagttcatgcgggatacc < 8:257892‑M2/147‑109 (MQ=255) gcgcCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTggg > 2:15339/1‑149 (MQ=255) ccGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCaa < 5:118355/149‑1 (MQ=255) cGACCTTACACAGGT‑AGCCCGCGGGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTATTTGATGACCCATCCCGCCCTTATGGGTTGAAGAACAAGGTATACCCGTACGTTGTCATGCCTTACGTTCTGGTGGGTCTGGAAg < 4:277579/149‑1 (MQ=255) cGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTCTGTGTACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGGATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCAAg < 7:243043/149‑1 (MQ=255) gACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCAAgg < 2:272650/149‑1 (MQ=255) cTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTac < 7:260260/42‑1 (MQ=255) cTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTac > 8:260260/1‑42 (MQ=255) tGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGGAAGGTAAc > 6:251392/1‑149 (MQ=255) gT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCAAGGTAACCAggtggt > 8:199728/1‑149 (MQ=255) t‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCAAGGTAACCAGgtggtg > 1:333831/1‑149 (MQ=255) t‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCAAGGTAACCAGgtggtg < 2:333831/149‑1 (MQ=255) ccGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCAAGGTAACCAGGTGGTGGGtt < 6:91001/149‑1 (MQ=255) gcgTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTTCCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCAAGGTAACCAGGTGGTGGGTTGc < 2:3115/149‑1 (MQ=255) cgcgGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCAAGGTAACCAGGTGGTGGGTTGCAAGc < 6:180972/148‑1 (MQ=255) ggggTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGAGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCAAGGTAACCAGGTGGTGGGTTGCAAGCAg < 7:49491/147‑1 (MQ=255) ggTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCAAGGTAACCAGGTGGTGGGTTGCAAGCAGGt > 1:179968/1‑149 (MQ=255) | TCCCGCATGAACTGATGCTCGAGAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGT‑CGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGGTGGGTCTGCAAGGTAACCAGGTGGTGGGTTGCAAGCAGGT > NC_002947/1506308‑1506599 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |