New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2366297 | 64 (1.060) | 5 (0.090) | 5/250 | NT | 7.6% | coding (733/906 nt) | lysR | transcriptional regulator LysR |
? | NC_002947 | = 2366321 | 62 (1.100) | coding (757/906 nt) | lysR | transcriptional regulator LysR |
CCAGCGTCTGGATCAGCACTTTCGTGCAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTGCAGGCCAAAGAAATGCAGCAGGCGCTGGCC > NC_002947/2366173‑2366467 | ccAGCGTCTGGATCAGCACTTTCGTGCAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAg > 2:131413/1‑149 (MQ=255) cagcgtggatcAGCACTTTCGTGCAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGgcg < 8:169899‑M2/144‑4 (MQ=255) gTCTGGATCAGCACTTTCGTGCAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGgcggg > 7:300188‑M2/1‑144 (MQ=255) gCACTTTCGTGCAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATcc < 7:30403/149‑1 (MQ=255) gCACTTTCGTGCAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATcc > 1:62190/1‑149 (MQ=255) tttCGTGCAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATTGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAg > 4:50231/1‑149 (MQ=255) tCGTGCAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAg < 5:364016/147‑1 (MQ=255) tGCAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTAc < 4:248892/149‑1 (MQ=255) tGCAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTAc < 2:274716/149‑1 (MQ=255) tGCAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGAACATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTAc > 3:254583/1‑149 (MQ=255) cAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGTGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACgg < 7:236125/149‑1 (MQ=255) cAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACgg < 1:131413/149‑1 (MQ=255) aGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACggg > 3:131155/1‑149 (MQ=255) gCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACggg > 5:30471/1‑148 (MQ=255) gTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGt < 5:173944/149‑1 (MQ=255) aaCCGCCGCACGGGCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGc < 2:40861/148‑1 (MQ=255) ccgccgCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGccc > 7:326073/1‑148 (MQ=255) aCGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGt < 2:62190/149‑1 (MQ=255) aCGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGt < 7:179843/149‑1 (MQ=255) ggTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGa < 1:46650/149‑1 (MQ=255) tCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATg < 8:6690/149‑1 (MQ=255) aTCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGc < 4:29662/148‑1 (MQ=255) aTCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCt < 6:134142/149‑1 (MQ=255) gAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCa > 6:140627/1‑148 (MQ=255) aaaCCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATa > 4:74560/1‑149 (MQ=255) aaCCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATAc > 6:203917/1‑149 (MQ=255) accaccAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACg > 7:136682/1‑149 (MQ=255) ccGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACg < 3:94137/106‑1 (MQ=255) ccGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACg > 4:94137/1‑106 (MQ=255) ccGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCa < 4:131155/148‑1 (MQ=255) cGCTTCGGGTTGCGCCATGGGCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCGCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTTCGGGTATCGGTGCGCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATc < 8:196296/149‑1 (MQ=255) gCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTGCCCCATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATc < 1:106858/149‑1 (MQ=255) gtgtGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATcggccggc < 8:136682/149‑1 (MQ=255) gtgtGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATcggccgg > 6:21017/1‑148 (MQ=255) cgcCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCgg < 3:50231/149‑1 (MQ=255) gcCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCgg > 1:328932/1‑148 (MQ=255) ccATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGAGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCgg > 5:378981/1‑147 (MQ=255) ggTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCgg > 1:167970/1‑149 (MQ=255) tCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGt < 5:203917/148‑1 (MQ=255) ggCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAg > 5:83675/1‑149 (MQ=255) gCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGc > 7:185619/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGTCATCGGCAGCGGTGGa < 5:326029/146‑1 (MQ=255) cAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGa > 6:326029/1‑146 (MQ=255) cAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGcc < 8:185619/149‑1 (MQ=255) aaGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCTGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCg > 6:304466/1‑149 (MQ=255) cTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTg > 5:51937/1‑149 (MQ=255) ggggTGGCGATCATCACCGCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGGGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGa < 6:72395/149‑1 (MQ=255) ggggTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGa < 8:326073/149‑1 (MQ=255) tGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCTGGGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGc > 1:28320/1‑149 (MQ=255) gCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGtt > 5:381220/1‑149 (MQ=255) gATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGc > 5:358260/1‑149 (MQ=255) tcatcaACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGgcgggttgatgatcgccacccccaggccttgcctgaccatggcgcacaccgaagcggcactggtggtttcga < 2:139015‑M2/108‑73 (MQ=255) tcatcaACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGgcgggttgatgatcgccacccccaggccttgcctgaccatggcgcacaccgaagcggcactggtggtttcga > 1:139015‑M2/1‑36 (MQ=255) tcatcaACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCgg < 4:42906/149‑1 (MQ=255) tcatcaACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCgg < 5:21017/149‑1 (MQ=255) tcaACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTg < 4:254583/149‑1 (MQ=255) caACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGgcgggttgatgatcgccacccccaggccttgcctgaccatggcgcacaccgaagcggcactggtggtttcgatgaccgtgcggcggttaaccccggctgcacgaaagtgctgatc < 5:257504‑M2/147‑116 (MQ=255) aaCCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTGc < 3:74560/148‑1 (MQ=255) cccGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGgcgggttgatgatcgccacccccaggccttgcctgaccatggcgcacaccgaagcggcactggtggtttcgatgaccgtgcggcggttaaccccggctgcacgaaagtgctgatccagac < 8:343808‑M2/149‑121 (MQ=255) cccGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATC‑GCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTGCAGGc < 6:30471/149‑1 (MQ=255) aGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGgcgggttgatgatcgccacccccaggccttgcctgaccatggcgcacaccgaagcggcactggtggtttcgatgaccgtgcggcggttaaccccggctgcacgaaagtgctgatccagacgctgg > 7:343808‑M2/1‑22 (MQ=255) aGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTGCAGGCCaaa < 6:381220/147‑1 (MQ=255) cGGGCT‑GGATGCTGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATTCGCGCGGTCCCTCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGGGCAGGCCAAAGaaa < 5:304466/149‑1 (MQ=255) cGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTGCAGGCCAAAGaaa < 7:169899/149‑1 (MQ=255) cT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTGCAGGCCAAAGAAATgca < 6:51937/149‑1 (MQ=255) cT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTGCAGGCCAAAGAAATgca < 2:28320/149‑1 (MQ=255) aGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGc > 3:181864/1‑105 (MQ=255) aGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGc < 4:181864/105‑1 (MQ=255) aGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTGCAGGCCAAAGAAATGcagcag < 6:83675/149‑1 (MQ=255) gcgcAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTGCAGGCCAAAGAAATGCAGCAGGCGCt > 8:214239/1‑149 (MQ=255) gcAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTGCAGGCCAAAGAAATGCAGCAGGCGCTgg > 1:42101/1‑149 (MQ=255) aaGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTGCAGGCCAAAGAAATGCAGCAGGCGCTGGcc > 5:119138/1‑149 (MQ=255) ggCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGa < 6:247946/104‑1 (MQ=255) ggCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGa > 5:247946/1‑104 (MQ=255) | CCAGCGTCTGGATCAGCACTTTCGTGCAGCCGGGGTTAACCGCCGCACGGTCATCGAAACCACCAGTGCCGCTTCGGTGTGCGCCATGGTCAGGCAAGGCCTGGGGGTGGCGATCATCAACCCGCTCAGCGGGCT‑GGAGGCGGCGCAAGGCGGGTTG‑CCGATCCGCAGGTTACGGGTATCGGTGCCCTATCAGGTGATGCTCATACGCCCGGACCATCGGCCGGCATCGGCAGCGGTGGAGCCGTTTTGCGAGGCGTTGCGGGTGCAGGCCAAAGAAATGCAGCAGGCGCTGGCC > NC_002947/2366173‑2366467 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |