New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3135652 | 42 (0.700) | 5 (0.090) | 3/256 | NT | 10.6% | coding (305/1335 nt) | PP_2752 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3135680 | 44 (0.760) | coding (333/1335 nt) | PP_2752 | hypothetical protein |
GAAGGCGGCATCAATGGCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCTTCTACAGCGAG > NC_002947/3135543‑3135821 | gAAGGCGGCATCAATGGCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGc > 3:325373/1‑149 (MQ=255) aTGGCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCg < 2:333173/149‑1 (MQ=255) tGGCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCgg > 8:33045/1‑149 (MQ=255) ggCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCg < 4:34614/147‑1 (MQ=255) ggCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCg > 3:34614/1‑147 (MQ=255) gCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAaggcc > 3:357175/1‑148 (MQ=255) cTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAaggcc > 1:190416/1‑147 (MQ=255) gCAGGAAGTTGAGACCGAGGGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGAGCTTCAAGCACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGAGCCGGCTTCCTATGACCTGGCGGACAAggccgaggccga < 3:230212/147‑1 (MQ=255) cAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCg < 5:314245/149‑1 (MQ=255) cAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCg > 4:81146/1‑149 (MQ=255) tgAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGTTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGc < 1:10538/149‑1 (MQ=255) tgAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCg < 6:379751/148‑1 (MQ=255) tgAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGc > 5:368376/1‑149 (MQ=255) agaCCGAGGGGACGGCCGAGAAGGGCAGCGAGGGCTACGAGCGCTTCAAGACCGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCt < 4:74441/148‑1 (MQ=255) gaCCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGa > 3:85346/1‑149 (MQ=255) cGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCa < 4:85346/149‑1 (MQ=255) gAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACATGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCAc < 4:126049/149‑1 (MQ=255) aGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGGCAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCAcc > 2:365386/1‑149 (MQ=255) actgCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCgg < 6:185939/146‑1 (MQ=255) gaAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTc < 4:357175/149‑1 (MQ=255) tCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAg < 4:325373/149‑1 (MQ=255) tACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAg < 7:153552/141‑1 (MQ=255) tACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAg > 8:153552/1‑141 (MQ=255) tACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGa > 8:189969/1‑149 (MQ=255) aCGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGAt > 6:345980/1‑149 (MQ=255) cGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATg < 7:33045/149‑1 (MQ=255) gAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATgg > 1:85009/1‑149 (MQ=255) gAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATgg > 1:25376/1‑149 (MQ=255) ttCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGt > 1:95482/1‑149 (MQ=255) aGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCttt < 2:190416/149‑1 (MQ=255) gCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTgcgccattgaggccgttcttgaagcgctcgtagcactcgatgcccttctcggccgtccactcggtctcacattcctgccagaccagcttgacgccattgatgccgcct < 5:284096‑M2/149‑109 (MQ=255) gCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTa > 1:325609/1‑148 (MQ=255) cTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACaa > 4:279223/1‑149 (MQ=255) tCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAAc > 3:110148/1‑149 (MQ=255) aTGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTgcgccattgaggccgttcttgaagcgctcgtagcactcgatgcccttctcggccgtccactcggtctcacattcctgccaga < 1:326351‑M2/117‑83 (MQ=255) aTGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTgcgccattgaggccgttcttgaagcgctcgtagcactcgatgcccttctcggccgtccactcggtctcacattcctgccaga < 1:331627‑M2/117‑83 (MQ=255) aTGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTgcgccattgaggccgttcttgaagcgctcgtagcactcgatgcccttctcggccgtccactcggtctcacattcctgccaga > 2:331627‑M2/1‑35 (MQ=255) aTGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTgcgccattgaggccgttcttgaagcgctcgtagcactcgatgcccttctcggccgtccactcggtctcacattcctgccaga > 2:326351‑M2/1‑35 (MQ=255) tGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTcc < 2:25376/149‑1 (MQ=255) gcgcTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCt > 1:18440/1‑149 (MQ=255) gCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGGCAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGAc < 1:365386/149‑1 (MQ=255) gCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGAc < 3:81146/149‑1 (MQ=255) tCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCTTc > 5:270047/1‑149 (MQ=255) tACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCTTCTa > 8:50893/1‑149 (MQ=255) cAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCTTCTa < 4:62759/146‑1 (MQ=255) cAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCTTCTa > 3:62759/1‑146 (MQ=255) gCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCTTCTACAGCg < 6:270047/149‑1 (MQ=255) cccAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCTTCTACAGCGa < 7:189969/149‑1 (MQ=255) cAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGGTGTTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCTTCTACAGCGAg > 1:284425/1‑149 (MQ=255) | GAAGGCGGCATCAATGGCGTCAAGCTGGTCTGGCAGGAATGTGAGACCGAGTGGACGGCCGAGAAGGGCATCGAGTGCTACGAGCGCTTCAAGAACGGCCTCAATGGCGCTCCGGTGGCGGTCTACCAGCCCAATGGTGCGCCGGCTGCCTATGCCCTGGCGGACAAGGCCGAGGCCGACCGG‑ATTCCGCTGATCACCCTCGGCTATGGTCGTACCGAGGCCACCGATGGCCGCGTCTTTCCCTACAACTTCCCTGTGATGTTGACCTTCTACAGCGAG > NC_002947/3135543‑3135821 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |