New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3547416 = | 59 (0.980) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 5.2% | coding (361/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
? | NC_002947 | 3547489 = | 54 (0.940) | coding (434/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
CGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATCTGGGCGCTGGTG > NC_002947/3547344‑3547637 | cgcgGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTg < 6:246688/149‑1 (MQ=255) gaccaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTg > 5:219442‑M1/72‑148 (MQ=255) ccTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTc < 3:223597/148‑1 (MQ=255) tgctgTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAg > 3:46284/1‑149 (MQ=255) gctgTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGt > 5:142660/1‑149 (MQ=255) gTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGTGGTTTCCAGTcca > 1:159549/1‑149 (MQ=255) ttGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTccac > 5:238992/1‑148 (MQ=255) ttACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGCGCTGTGGCCGGCCGCCTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGGACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCCTCTGGGGTGTCCAGGCCACCAaga > 2:295537/1‑147 (MQ=255) cccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagatagat < 6:156726/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGAtg > 1:103194/1‑149 (MQ=255) ctgctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACGAAGATAGAtgtg < 6:142660/147‑1 (MQ=255) ctgctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTgg < 1:209403/148‑1 (MQ=255) ctgctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGc > 2:337689/1‑149 (MQ=255) ctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCg < 5:287099/147‑1 (MQ=255) ggCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTAc < 8:314668/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACg > 7:14071/1‑149 (MQ=255) ccTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCa > 8:48259/1‑149 (MQ=255) ggAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACtt < 3:253334/148‑1 (MQ=255) aGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTcc < 4:339781/149‑1 (MQ=255) aGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTcc < 8:304416/149‑1 (MQ=255) gCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCca < 6:139223/149‑1 (MQ=255) cTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATACCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCcaa < 1:106013/149‑1 (MQ=255) ttggttggCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCcaa > 3:75997/1‑148 (MQ=255) cccAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCTAGATAGATGTGTCGGTACGCCCTTTGCAT‑CAAAAgcgc > 7:313440/1‑149 (MQ=255) cAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCAACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTc > 4:72983/1‑135 (MQ=255) cAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCAACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTc < 3:72983/135‑1 (MQ=255) aCTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTgg > 6:251738/1‑149 (MQ=255) tGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTa > 2:239054/1‑149 (MQ=255) gCTGAGCTGTGGACGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTAt < 8:55967/148‑1 (MQ=255) cTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTg < 7:48259/149‑1 (MQ=255) tGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTgg < 4:178450/113‑1 (MQ=255) tGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTgg > 3:178450/1‑113 (MQ=255) tGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTgg > 1:266892/1‑149 (MQ=255) aGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTc < 3:21999/149‑1 (MQ=255) cagatggccgccgacaggccggtgaccgccagtaccatcggcagtaccggcgcggcataggtcgagtcggccggccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTc > 5:219442‑M2/78‑148 (MQ=255) TGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGAc > 4:46284‑M1/1‑147 (MQ=255) gccgccgacaggccggtgaccgccagtaccatcggcagtaccggcgcggcataggtcgagtcggccggccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTg > 1:262060‑M2/72‑149 (MQ=255) GCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTg < 4:23982‑M1/149‑1 (MQ=255) CGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGcc < 3:156438‑M1/149‑1 (MQ=255) GGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCt < 3:79770‑M1/149‑1 (MQ=255) ccgACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGAGAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCg > 5:198098/1‑149 (MQ=255) cgACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGc < 2:103194/149‑1 (MQ=255) gACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACCAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGc < 1:239054/149‑1 (MQ=255) aCTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAg < 6:238992/149‑1 (MQ=255) aCTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGGGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAg > 4:239539/1‑149 (MQ=255) tCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAGGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGt > 7:199609/1‑149 (MQ=255) aTGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGc > 1:138340/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtg > 3:23449/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGACCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtg > 1:269061/1‑149 (MQ=255) cgcgCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACACACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtgg > 8:294225/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtggt > 4:297759/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtggt > 2:117038/1‑149 (MQ=255) cagtaccatcggcagtaccggcgcggcataggtcgagtcggccggccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtggtg < 2:262060‑M2/101‑1 (MQ=255) gcCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGGCATCTGGGGTTTCCAGTCAACCAAGATAGATGTGGGGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCGgggtgg > 8:253241/1‑149 (MQ=255) gcCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtggtgg > 1:35432/1‑149 (MQ=255) gcCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtggtgg < 8:14071/149‑1 (MQ=255) cGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGgtggtg < 4:79770/149‑1 (MQ=255) tGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTc > 5:45937/1‑149 (MQ=255) tGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTc > 1:148567/1‑149 (MQ=255) tGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTg < 1:337689/149‑1 (MQ=255) gCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTCCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCt > 3:224912/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCAtt < 4:156438/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGAt < 3:239539/149‑1 (MQ=255) tCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATCt < 5:209586/148‑1 (MQ=255) aTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATCTGGGCGCTGGt < 2:138340‑M2/148‑1 (MQ=255) tCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATCTGGGCGCTGgtg > 3:298563/1‑149 (MQ=255) | CGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAA‑CAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATCTGGGCGCTGGTG > NC_002947/3547344‑3547637 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |