New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3904389 = | 54 (0.900) | 4 (0.070) | 4/260 | NT | 6.5% | coding (354/1593 nt) | ilvA‑I | threonine deaminase |
? | NC_002947 | 3904431 = | 62 (1.050) | coding (312/1593 nt) | ilvA‑I | threonine deaminase |
GCGCATGCGGGAAGCTCTCGCCATGCAGCACCACATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCTTCGCGCTTGAGCAACACCTGGTTGCCCAGGGCGGCAG > NC_002947/3904283‑3904576 | gcgcATGCGGGAAGCTCTCGCCATGCAGCACCAAATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATgg > 6:221319/1‑149 (MQ=255) ctgcagcctacgttttcgttcaagatccggggtgcctacacccgcctgtcgcgactgaccgatgtgcagcgtgagcgcggggtgatcaccgcttcggcgggcaacCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGt > 6:276948‑M1/106‑149 (MQ=255) gcctacgttttcgttcaagatccggggtgcctacacccgcctgtcgcgactgaccgatgtgcagcgtgagcgcggggtgatcaccgcttcggcgggcaacCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGccc > 5:301329‑M1/101‑149 (MQ=255) gggAAGCTCTCGCCATGCAGCACCACATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCccgc > 3:200321/1‑149 (MQ=255) gggAAGCTCTCGCCATGCAGCACCACATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCccgc > 7:290013/1‑149 (MQ=255) ggAAGCTCTCGCCATGCAGCACCACATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCccgcc > 2:338879/1‑149 (MQ=255) tctcGCCATGCAGCACCACATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCg > 2:240534/1‑149 (MQ=255) ttcaagatccggggtgcctacacccgcctgtcgcgactgaccgatgtgcagcgtgagcgcggggtgatcaccgcttcggcgggcaacCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATgg > 2:65337‑M1/88‑130 (MQ=255) ttcaagatccggggtgcctacacccgcctgtcgcgactgaccgatgtgcagcgtgagcgcggggtgatcaccgcttcggcgggcaacCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATgg < 1:65337‑M1/43‑1 (MQ=255) gCCATGCAGCACCACATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTCGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGa > 7:331403/1‑149 (MQ=255) ccATGCAGCACCACATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGGTGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGAt > 8:73294/1‑149 (MQ=255) cATGCAGCACCACATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGAt > 2:308471/1‑148 (MQ=255) atctcagcaCCACATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATc < 5:360691/145‑1 (MQ=255) agcaCCACATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCAcccc > 5:379882/1‑149 (MQ=255) agcaCCACATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCAGCCGAAGCGGTGAtg > 6:360691/1‑143 (MQ=255) gcaCCACATGCCTGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCcg > 8:118440/1‑149 (MQ=255) cacaTGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCt > 6:54970/1‑149 (MQ=255) aTGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCAc > 6:107055/1‑149 (MQ=255) cccGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCt > 8:340967/1‑149 (MQ=255) cgccgcGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATAGCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGc < 1:118530/149‑1 (MQ=255) cgccgcGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGc < 6:379882/149‑1 (MQ=255) ccgcGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGca > 3:231713/1‑148 (MQ=255) gcgAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGGCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCg > 5:320859/1‑149 (MQ=255) gcacgcacgcCTTCCCCTTTCATCGCAGGCCTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGCTGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCCCGCTGCACATCGGt < 2:347718/147‑1 (MQ=255) gAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGt > 1:347718/1‑149 (MQ=255) gcacgcCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGt > 7:239484/1‑149 (MQ=255) gcacgcCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGt > 3:93888/1‑149 (MQ=255) acgcCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGt < 8:264950/113‑1 (MQ=255) acgcCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGt > 7:264950/1‑113 (MQ=255) cgcCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCGACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTcgc < 7:340967/149‑1 (MQ=255) cTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGa > 2:356973/1‑148 (MQ=255) cACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTc > 6:286315/1‑120 (MQ=255) cACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTc < 5:286315/120‑1 (MQ=255) cTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCgg < 1:356973/149‑1 (MQ=255) tttCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCggg > 7:7746/1‑149 (MQ=255) tCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGgtg > 5:354791/1‑149 (MQ=255) tCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACACAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGgtg > 8:339756/1‑149 (MQ=255) aaCGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGgtgt < 4:266128/148‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCAcc < 4:93888/148‑1 (MQ=255) tggtggttgGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCgg < 8:331403/149‑1 (MQ=255) tggtggtggGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCgg < 4:200321/149‑1 (MQ=255) gcggcgggCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGAt < 6:67605/144‑1 (MQ=255) tggtggGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCAACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGCTCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCTCCCCGGATc > 4:325132/1‑149 (MQ=255) gtggGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGGTGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGGCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCtt < 7:73294/149‑1 (MQ=255) tggGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCTTTGGGCATATATTTTCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTg < 1:308471/149‑1 (MQ=255) ggCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGaa < 1:240534/149‑1 (MQ=255) ggCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGaa < 8:290013/149‑1 (MQ=255) aCGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGaa > 4:20422/1‑143 (MQ=255) aCGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGaa < 3:20422/143‑1 (MQ=255) aCGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGaaa < 5:175640/148‑1 (MQ=255) tGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTa < 5:107055/149‑1 (MQ=255) gggcaaccatgcccagggcgtggccttggccgcatcgcatctgggtatgGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGc > 5:301329‑M2/50‑149 (MQ=255) ccTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTg < 5:17295/148‑1 (MQ=255) cTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTc > 2:324103/1‑78 (MQ=255) cTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTc < 1:324103/78‑1 (MQ=255) accatgcccagggcgtggccttggccgcatcgcatctgggtatgGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAg > 6:276948‑M2/45‑149 (MQ=255) ccatgcccagggcgtggccttggccgcatcgcatctgggtatgGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGaa > 2:65337‑M2/44‑130 (MQ=255) ccatgcccagggcgtggccttggccgcatcgcatctgggtatgGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGaa < 1:65337‑M2/87‑1 (MQ=255) ATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTc < 4:138405‑M1/149‑1 (MQ=255) aCCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCtt > 8:42202/1‑149 (MQ=255) ccAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATc > 5:266517/1‑119 (MQ=255) ccAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATc < 6:266517/119‑1 (MQ=255) cgatgcgGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCTTCGCGCTTGa < 7:118440/149‑1 (MQ=255) gatgcgGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCTTCGCGCTTGAg < 3:138405/149‑1 (MQ=255) ggCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCTTCGCGCTTGAGCAaca > 4:337842/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCTTCGCGCTTGAGCAACAcc > 1:282897/1‑149 (MQ=255) cACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCTTCGCGCTTGa < 7:293337/134‑1 (MQ=255) cACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCTTCGCGCTTGa > 8:293337/1‑134 (MQ=255) aCGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGaaaa > 3:334840/1‑107 (MQ=255) aCGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGaaaa < 4:334840/107‑1 (MQ=255) aCGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCTTCGCGCTTGAGCAACACCTGGTTGcc > 3:138972/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCTTCGCGCTTGAGCAACACCTGGTTGCCCAgg > 2:335806/1‑149 (MQ=255) cATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCTGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCTTCGCGCTTGAGCAACACCTGGTTGCCCAGGCCGGCa < 7:339756/149‑1 (MQ=255) atgGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCTTCGCGCTTGAGCAACACCTGGTTGCCCAGGGCGGCAg > 6:5072‑M2/4‑149 (MQ=255) | GCGCATGCGGGAAGCTCTCGCCATGCAGCACCACATGCCCGCCGCGCGAACGCACGCCTTCCACTTTCAACGATGGCGTGGTGGTGGGCATGACGATGGTTGCCTTCATACCCAGATGCGATGCGGCCAAGGCCACGCCCTGGGCATGGTTGCCCGCCGAAGCGGTGATCACCCCGCGCTCACGCTGCACATCGGTCAGTCGCGACAGGCGGGTGTAGGCACCCCGGATCTTGAACGAAAACGTAGGCTGCAGGTCTTCGCGCTTGAGCAACACCTGGTTGCCCAGGGCGGCAG > NC_002947/3904283‑3904576 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |