New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5487124 = | 67 (1.110) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 5.8% | coding (453/2772 nt) | PP_4824 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | 5487166 = | 65 (1.120) | coding (495/2772 nt) | PP_4824 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
GGCAATGCCAGCCCGACCCTGCGTGGCAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCACCCTGATCCTGGCGCTGTACCACGGCCTGATGCTGCTCAGCG > NC_002947/5487023‑5487311 | ggCAATGCCAGCCCGACCCTGCGTGGCAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGa > 7:62012/1‑149 (MQ=255) gCAATGCCAGCCCGACCCTGCGTGGCAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGAt < 4:76176/149‑1 (MQ=255) aaTGCCAGCCCGACCCTGCGTGGCAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATc > 1:118087/1‑148 (MQ=255) tGCCAGCCCGACCCTGCGTGGCAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAAc < 4:248918/149‑1 (MQ=255) tGCCAGCCCGACCCTGCGTGGCAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGGCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAAc < 7:354499/149‑1 (MQ=255) tGCCAGCCCGACCCTGCGTGGCAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTCGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAAc < 2:156205/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCGACCCTGCGTGGCAGCGACGATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATGAACGc < 6:82059/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCGACCCTGCGTGGCAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGc < 8:62012/149‑1 (MQ=255) ccGACCCTGCGTGGCAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACATGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTCAGCCTGCGGCCGAGGCACCCTCGGATAAACGCCAGcc > 1:287282/1‑149 (MQ=255) ccTGCGTGGCAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCgctgc > 7:217744/1‑149 (MQ=255) gTGGCAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGTATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTc < 7:109245/149‑1 (MQ=255) cAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCa > 2:231834/1‑149 (MQ=255) cAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCa < 1:231834/149‑1 (MQ=255) cGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGc < 5:313051/149‑1 (MQ=255) gACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCt > 7:137920/1‑149 (MQ=255) gACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCt > 8:29461/1‑149 (MQ=255) cATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGtt > 8:205982/1‑149 (MQ=255) aTGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTc < 2:118087/149‑1 (MQ=255) gTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTcgg > 4:349551/1‑149 (MQ=255) gTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTcgg > 4:355097/1‑149 (MQ=255) gTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTCCGGCATGCTGTTcgg > 6:75955/1‑149 (MQ=255) aTTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTcggcg > 7:296239/1‑149 (MQ=255) aTTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGAGCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTcggcg > 1:279796/1‑149 (MQ=255) ttGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTcggcg < 2:55169/148‑1 (MQ=255) gCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCggcggc < 4:351867/148‑1 (MQ=255) gCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCggcggc < 1:236541/148‑1 (MQ=255) ccccTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTc > 1:51909/1‑104 (MQ=255) ccccTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTc < 2:51909/104‑1 (MQ=255) gCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCctgatca > 8:237548/1‑149 (MQ=255) ccAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCctgatcatg < 4:313317/149‑1 (MQ=255) cagGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCctgatcatgctgatca < 5:277450/149‑1 (MQ=255) cGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAAc > 7:157028/1‑149 (MQ=255) gCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAAcc < 5:25624/149‑1 (MQ=255) gCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAAcc < 7:178775/149‑1 (MQ=255) aCATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATc < 7:12773/149‑1 (MQ=255) cTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCt > 2:1635/1‑149 (MQ=255) tACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCtt > 3:170706/1‑149 (MQ=255) tACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCtt > 7:40264/1‑149 (MQ=255) aCCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCctgatcatg < 6:2767/122‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCctgatcatg > 5:2767/1‑122 (MQ=255) ccTTCGCCTGGTCTCAGAGCTCCAGCTGCGTCGGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGTCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGGATTCTGTTCGGCGGCCTGTTCATGCTGATCTTGCACAACCTGATCCGCtt < 2:287282/147‑1 (MQ=255) cTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCct < 7:237548/149‑1 (MQ=255) cTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCct < 8:157028/149‑1 (MQ=255) cTGCGCCTGGTCTCAGAGCACAAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTcc > 8:44647/1‑148 (MQ=255) cgcCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCctc < 3:355097/147‑1 (MQ=255) cgcCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCctc < 3:349551/147‑1 (MQ=255) cgcCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTa < 7:205982/149‑1 (MQ=255) gcCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTa > 3:115954/1‑148 (MQ=255) cTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCctgatcatgc > 2:326373/1‑115 (MQ=255) cTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCctgatcatgc < 1:326373/115‑1 (MQ=255) gTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGca < 2:373856/122‑1 (MQ=255) gTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGca > 1:373856/1‑122 (MQ=255) agagCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTc > 3:155239/1‑147 (MQ=255) agagCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCa > 3:303378/1‑149 (MQ=255) gagCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAg < 8:296239/149‑1 (MQ=255) GCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCAccc > 8:137920‑M1/1‑149 (MQ=255) ctgcctcggccgcaggctcaaggctgatggccggacgcagcCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAg < 8:109262‑M2/99‑1 (MQ=255) ctgcctcggccgcaggctcaaggctgatggccggacgcagcCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAg > 7:109262‑M2/42‑140 (MQ=255) gcctcggccgcaggctcaaggctgatggccggacgcagcCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCAccc < 7:219433‑M2/107‑1 (MQ=255) gcctcggccgcaggctcaaggctgatggccggacgcagcCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCAccc > 8:219433‑M2/40‑146 (MQ=255) tCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCCTGCACACCCTGATCCGCGTCCTCTACACCCGCTCCCGCACCCCCCTGAGcc > 8:204165/1‑149 (MQ=255) cGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCACCCTGATCCTg < 1:1635/149‑1 (MQ=255) aTCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCACCCTGATCCTGGCGCt > 2:135027/1‑149 (MQ=255) aTCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTAGGCGGCCTCATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCACCCTGATCCTGGCGCt > 5:262894/1‑149 (MQ=255) tCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTAGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACCCCCGCTCCAGCACCACCCTGATCCTGCAGCTg > 3:206104/1‑149 (MQ=255) ccTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTcc > 3:168074/1‑107 (MQ=255) ccTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTcc < 4:168074/107‑1 (MQ=255) ttGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCACCCTGATCCTGGCGCTGTACCAc > 3:317506/1‑149 (MQ=255) gAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCACCCTGATCCTGGCGCTGTACCACg < 2:134958/148‑1 (MQ=255) gCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTCCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCACCCTGATCCTGGCGCTGTACCACGGcc < 5:75955/149‑1 (MQ=255) gCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATc < 1:63496/87‑1 (MQ=255) gCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATc > 2:63496/1‑87 (MQ=255) gAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCACCCTGATCCTGGCGCTGTACCACGGCCTGAtgctgc > 1:156758/1‑148 (MQ=255) agcCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCACCCTGATCCTGGCGCTGTACCACGGCCTGATGCTGCTCAGCg < 4:170706‑M2/146‑1 (MQ=255) agcCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCACCCTGATCCTGGCGCTGTACCACGGCCTGATGCTGCTCAGCg < 8:40264‑M2/146‑1 (MQ=255) | GGCAATGCCAGCCCGACCCTGCGTGGCAGCGACCATGTATTGCCCCTGCCCAACAGCAGGCAACCGCTGGACATCTACCTGCGCCTGGTCTCAGAGCACCAGCTGCGTCCGGCCATCAGCCTTGAGCCTGCGGCCGAGGCAGCCTCGGATCAACGCCAGCCGCTGCTGTTCGGCATGCTGTTCGGCGGCCTGATCATGCTGATCATGCACAACCTGATCCGCTTCCTCTACACCCGCTCCAGCACCACCCTGATCCTGGCGCTGTACCACGGCCTGATGCTGCTCAGCG > NC_002947/5487023‑5487311 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |