New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5969511 | 56 (0.930) | 3 (0.050) | 3/256 | NT | 5.9% | coding (1783/2124 nt) | PP_5236 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5969543 | 42 (0.730) | coding (1751/2124 nt) | PP_5236 | hypothetical protein |
GGTTGCAAGCTGGCCGCTCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGACAAGCAGGCGCCTGACCGCCAGCATGGCACTGCGCTC > NC_002947/5969399‑5969691 | ggTTGCAAGCTGGCCGCTCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAgca > 5:205618‑M2/1‑145 (MQ=255) ggTTGCAAGCTGGCCGCTCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAgca > 3:121275‑M2/1‑145 (MQ=255) ggTTGCAAGCTGGCCGCTCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAgc > 3:153301‑M2/1‑145 (MQ=255) ggTTGCAAGCTGGCCGCTCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAgc > 2:72270‑M2/1‑145 (MQ=255) ggTTGCAAGCTGGCCGCTCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAgc > 7:196935‑M2/1‑145 (MQ=255) gTTGCAAGCTGGCCGCTCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAgcag > 3:138774‑M2/1‑144 (MQ=255) cAAGCTGGCCGCTCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTaa < 2:11299/148‑1 (MQ=255) cAAGCTGGCCGCTCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAg > 7:211095/1‑149 (MQ=255) aaGCTGGCCGCTCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCACCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCCACCAGGCTCAGCATGTAAg > 6:123285/1‑148 (MQ=255) gCTCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTc > 7:211845/1‑149 (MQ=255) tCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCAc < 1:134929/149‑1 (MQ=255) gACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCt > 3:76582/1‑149 (MQ=255) gACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCt > 4:46113/1‑149 (MQ=255) ccATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCCGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCGCCCTTCgggccg > 8:256049/1‑144 (MQ=255) aTTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTgc < 8:147873/149‑1 (MQ=255) gATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCt < 3:363668/149‑1 (MQ=255) tGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCa < 3:46113/149‑1 (MQ=255) ggcAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCa > 6:322679/1‑148 (MQ=255) gCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGt > 7:87124/1‑148 (MQ=255) gcGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGTCCAGCACCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTTCAAGCCAAGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATc < 5:381194/148‑1 (MQ=255) gTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAg > 6:100183/1‑149 (MQ=255) ccACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGt < 5:247779/148‑1 (MQ=255) cccTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACcg > 3:358967/1‑149 (MQ=255) cccTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACcg > 3:264147/1‑149 (MQ=255) cTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACcgcg < 5:322679/149‑1 (MQ=255) cTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACcgcg > 1:155682/1‑149 (MQ=255) aTCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCCAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGcaca > 5:292029/1‑149 (MQ=255) aTCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGcaca < 8:87124/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCacac > 5:54309/1‑149 (MQ=255) cAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCTACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACg > 6:295165/1‑148 (MQ=255) aGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCAc > 2:252805/1‑105 (MQ=255) aGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCAc < 1:252805/105‑1 (MQ=255) gCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCAtt < 1:149202/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTg < 4:96557/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTg < 8:211095/149‑1 (MQ=255) cAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCTACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTgg < 5:295165/149‑1 (MQ=255) cccAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTg < 2:112227/149‑1 (MQ=255) cccAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTCCAACCGCGCACACGCATTGGTCTg > 2:44995/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCACCCGCCTCCCTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGc > 1:250985/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGc > 5:157957/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGcc > 7:355129/1‑149 (MQ=255) cGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGtt < 1:44995/148‑1 (MQ=255) aCGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAgcagggcgtgccagcgccgaactggggctggcctggatgcaggggcgtggcacccgcaagcaaagccgctttgccgccatccaatgggtcaaccgagcggccagcttg < 5:361088‑M2/149‑109 (MQ=255) ccTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAgcagggcgtgccagcgccgaactggggctggcctggatgcaggggcgtggcacccgcaagcaaagccgctttgccgccatccaatgggtcaaccgagcggccagcttgcaac < 8:115532‑M2/149‑113 (MQ=255) tGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGAc > 6:51978/1‑147 (MQ=255) cAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAgcagggcgtgccagcgccgaactggggctggcctggatgcaggggcgtggcacccgcaagcaaagccgctttgccgccatccaatgggtcaaccgagcggccagcttgcaaccaag > 6:361088‑M2/1‑33 (MQ=255) cAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGACaa < 4:76582/147‑1 (MQ=255) gCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCCCACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGACAAGCAgg > 5:184300/1‑149 (MQ=255) ccACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGACAAGCAGgc > 6:195472/1‑149 (MQ=255) cACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGACAAGCAGgcg > 3:8273/1‑149 (MQ=255) aCGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGACAAGCAGgcgc > 6:351629/1‑149 (MQ=255) aCGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGACAAGCAGgcgc > 5:228471/1‑149 (MQ=255) aCGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCGCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGACAAGCAGgcgc < 6:292029/149‑1 (MQ=255) aGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGACAAGCAGGCGCCTGACCGCCAGCATGGCACt > 4:67831/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGACAAGCAGGCGCCTGACCGCCAGCATGGCACTgc < 6:228471/149‑1 (MQ=255) agcagGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGACAAGCAGGCGCCTGACCGCCAGCATGGCACTGCGCTc < 8:211845/149‑1 (MQ=255) | GGTTGCAAGCTGGCCGCTCGGTTGACCCATTGGATGGCGGCAAAGCGGCTTTGCTTGCGGGTGCCACGCCCCTGCATCCAGGCCAGCCCCAGTTCGGCGCTGGCACGCCCTGCAAGCCACGGGTCCGGGTGCTCGACCAGGCTCAGCAGGTAAGCAACCGCCTCACTTCGCTCCTGCGCCTCACCAAACCGGCGTAACAAAATCCCCAGGTGCAACCGCGCACACGCATTGGTCTGCCCGTTGCCCAGCGCGTCGACAAGCAGGCGCCTGACCGCCAGCATGGCACTGCGCTC > NC_002947/5969399‑5969691 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |