New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 319049 = | 62 (1.030) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.7% | coding (693/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 319095 = | 41 (0.720) | coding (647/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase |
CGAGCGATCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTT > NC_002947/318902‑319195 | cGAGCGATCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCt > 6:328213/1‑149 (MQ=255) cggccgtgcgcgaccgcgagcggatcgtcggcgtgctggtggtcaaagtcgatctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTgg > 6:176120‑M1/146‑149 (MQ=255) cggccgtgcgcgaccgcgagcggatcgtcggcgtgctggtggtcaaagtcgatctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTgg > 2:294661‑M1/146‑149 (MQ=255) cggccgtgcgcgaccgcgagcggatcgtcggcgtgctggtggtcaaagtcgatctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTgg > 4:73747‑M1/146‑149 (MQ=255) gCGATCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTgg < 8:118919/148‑1 (MQ=255) gCGATCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTgg > 7:118919/1‑148 (MQ=255) cGATCAACCAGCGTGCGCGGCGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGgcg > 5:355486/1‑149 (MQ=255) cgtgcgcgaccgcgagcggatcgtcggcgtgctggtggtcaaagtcgatctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGGCGCt > 5:371654‑M1/142‑149 (MQ=255) aTCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCt < 2:39561/149‑1 (MQ=255) aTCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCt < 2:45096/149‑1 (MQ=255) cAGGGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGt < 3:251388/149‑1 (MQ=255) aGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTc > 2:343146/1‑149 (MQ=255) gCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCg < 6:42997/149‑1 (MQ=255) gggCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCACCGGCTGTGGGGCATGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCATg > 7:270658/1‑149 (MQ=255) gCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGTCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGgcg < 4:78886/128‑1 (MQ=255) gCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGgcg > 3:78886/1‑128 (MQ=255) cGAGGTTGCGGACTTGCCACCCTGTTTCCTTGATGGCGCTGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCgg < 8:341106/149‑1 (MQ=255) gAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCggg > 7:195956/1‑149 (MQ=255) gAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGAGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGt < 4:37637/134‑1 (MQ=255) gAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGAGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGt > 3:37637/1‑134 (MQ=255) tGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACg > 2:376184/1‑148 (MQ=255) ttGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCAc < 5:277963/143‑1 (MQ=255) ttGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCAc > 6:277963/1‑143 (MQ=255) cAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAgcgc > 2:280854/1‑147 (MQ=255) cAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAgcgc > 4:314843/1‑147 (MQ=255) gcaaagtcgatctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAg > 1:358015‑M1/104‑149 (MQ=255) aaCCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAg > 3:145891/1‑149 (MQ=255) aaCCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAg > 1:178386/1‑149 (MQ=255) aaCCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGCGTGATCCACGCCTGCCGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCGTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGAAGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAg > 2:177935/1‑149 (MQ=255) aGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg < 8:80394/149‑1 (MQ=255) ccTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCg < 4:249571/110‑1 (MQ=255) ccTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCg > 3:249571/1‑110 (MQ=255) cTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg < 3:355476/143‑1 (MQ=255) cTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg > 4:355476/1‑143 (MQ=255) cTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCcgc > 2:352295/1‑148 (MQ=255) gATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGaa < 1:352295/148‑1 (MQ=255) gATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGaa < 5:65133/148‑1 (MQ=255) cgcgGGTGTGGGTGATCCATGCCTGGGGGTTGAGAACCATCGGCTGTGTGGCCTGGGTCGGATAGGGCTTGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTATGGCCGCGAAGTCAg < 8:270658/148‑1 (MQ=255) gcgGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGa < 2:178386/149‑1 (MQ=255) gcgGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGa < 6:282302/149‑1 (MQ=255) caccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGt > 1:370850‑M1/85‑131 (MQ=255) caccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGt < 2:370850‑M1/47‑1 (MQ=255) cgGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGAt < 1:343146/149‑1 (MQ=255) cgGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGAt < 7:228191/149‑1 (MQ=255) gggTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACg > 5:213104/1‑149 (MQ=255) aTCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCAtt > 2:299870/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATtg < 6:355486/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACGACGCCATtg < 4:56693/148‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGACGCGAAGTCAGGATGCCCACGCCATtgt > 5:96982/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATtgt < 1:299870/148‑1 (MQ=255) cAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATtgt < 3:314843/148‑1 (MQ=255) cAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATtgt < 1:280854/148‑1 (MQ=255) cAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCGGGGTCGGATAGGGCTGTATGGCTATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCTAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATtg < 1:109097/148‑1 (MQ=255) cGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCa < 5:328213/149‑1 (MQ=255) gTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCa < 4:145891/149‑1 (MQ=255) gaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATc > 3:189082/1‑136 (MQ=255) gaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATc < 4:189082/136‑1 (MQ=255) ccAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAg < 8:221520/112‑1 (MQ=255) ccAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAg > 7:221520/1‑112 (MQ=255) cAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAgctgct > 3:43140/1‑149 (MQ=255) cGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCgg < 6:213104/149‑1 (MQ=255) ggggCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACg < 4:284354/149‑1 (MQ=255) gggTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCca > 3:33031/1‑148 (MQ=255) ggTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCcaca < 1:177935/149‑1 (MQ=255) ggTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCca > 8:142273/1‑147 (MQ=255) tCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAgg < 7:183847/149‑1 (MQ=255) ggCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGgt < 8:195956/149‑1 (MQ=255) gATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGt > 6:334143/1‑149 (MQ=255) gATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGt > 1:137274/1‑149 (MQ=255) gATGGAGATCATGTCCTGGCGCTAGTAGTCCGTC‑AGAGTGAGCGTAGCACGGAAGCGCAAGTCGTGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTAGGGAGTACGGCACCACAGGGTTTAGGTGTGGt > 2:188441/1‑149 (MQ=255) gatgatGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTc > 3:172913/1‑144 (MQ=255) gatgatGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGAt < 4:172913/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACttt < 7:142273/149‑1 (MQ=255) | CGAGCGATCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTC‑AGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTT > NC_002947/318902‑319195 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |