New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 356708 | 40 (0.660) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 5.9% | coding (53/1377 nt) | tdcG‑I | L‑serine dehydratase |
? | NC_002947 | = 356769 | 59 (1.050) | coding (114/1377 nt) | tdcG‑I | L‑serine dehydratase |
TGCTGGCATTCAAGGCGGCCCGCTGTTTGAGCCTAGCAGCTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCATGGCACCGACAACGCCAC > NC_002947/356561‑356855 | tgCTGGCATTCAAGGCGGCCCGCTGTTTGAGCCTAGCAGCTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTcc < 5:252706/149‑1 (MQ=255) tgCTGGCATTCAAGGCGGCACGCTGTTTGAGCCTAGCAGCTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTcc > 6:251639/1‑149 (MQ=255) ggcggcCCGCTGTTTGAGCCTAGCAGCTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGcc < 5:272847/149‑1 (MQ=255) gcCCGCTGTTTGAGCCTAGCAGCTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCAt < 5:251639/149‑1 (MQ=255) ccTAGCAGCTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGccc > 5:27720/1‑149 (MQ=255) agcTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTgttcg > 8:76888/1‑149 (MQ=255) tACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTgttcgtt > 1:25225/1‑148 (MQ=255) cccGCCCTGCGCATGGTGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCaccgcgttcgcgcaggccctgaacgaacagggcgccagcacgca > 2:6838‑M1/1‑105 (MQ=255) gcgcAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGt < 1:223790/149‑1 (MQ=255) gcAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGt > 4:123044/1‑147 (MQ=255) gcAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGt < 3:123044/147‑1 (MQ=255) aCAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCaccgcgttcgcgcaggccctgaacgaacagggcgccagcacgcatggggccgacggtgtgggagctgga < 1:6838‑M1/149‑70 (MQ=255) aaGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGGCGGGCCCTCCAGCTCaccgcgttcgcgcaggccctgaacgaacagggcgccagcacgcatggggccgacggtgtgggagctggagg < 2:316850‑M1/149‑72 (MQ=255) aaGCCAAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGAGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACAGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGACTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGc > 5:108917/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCATGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCACTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCgt > 3:132029/1‑149 (MQ=255) cAGCACGAGGTGACTCGACAAGGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAACATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTa < 6:27720/149‑1 (MQ=255) ggTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGAt < 7:38741/149‑1 (MQ=255) gTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATc > 6:367450/1‑149 (MQ=255) gTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATc < 2:25225/149‑1 (MQ=255) gACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTCTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTgc > 4:184418/1‑149 (MQ=255) cAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTgcgc < 4:215111/149‑1 (MQ=255) cAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTgcgc < 5:367450/149‑1 (MQ=255) aTGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCt > 7:258820/1‑149 (MQ=255) tGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTgcgc > 5:274718/1‑146 (MQ=255) tGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTgcgc < 6:274718/146‑1 (MQ=255) ccATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTAt > 3:68676/1‑149 (MQ=255) ccATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTAt > 4:13112/1‑149 (MQ=255) ttCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGt > 2:343039/1‑148 (MQ=255) cGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCa < 1:343039/148‑1 (MQ=255) gACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCTTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGa < 1:228965/118‑1 (MQ=255) gACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGa > 2:228965/1‑118 (MQ=255) gACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCCTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCCGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGc > 8:8553/1‑149 (MQ=255) ttgtaGATCGGTGTCGGGGGCTCCAGCTCCCAGACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCTTTCATGGCCTGCGCGTACTCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCTAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCg < 4:132029/144‑1 (MQ=255) ttCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCgg > 5:10158/1‑149 (MQ=255) cAAGATCGGTGGCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGt < 2:334325/148‑1 (MQ=255) ggTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCa < 3:13112/149‑1 (MQ=255) gtgtCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCAt > 4:300115/1‑149 (MQ=255) gtgtCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGACGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCAt > 1:208335/1‑149 (MQ=255) tgtCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCATg < 8:51782/149‑1 (MQ=255) gggCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCATGGCAc > 4:150912/1‑149 (MQ=255) gggCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCATGGCAc > 2:251153/1‑149 (MQ=255) ccTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTgagctggagggcccgccaccgatcttgaacaggtcgaacacgctgatggccattgtcgaatcacctcttgctgggctt < 2:316850‑M2/149‑79 (MQ=255) ccTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCATGGCACCGa > 2:211629/1‑148 (MQ=255) tCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTgagctggagggcccgacaccgatcttgaacaggtcgaacacgctgatggccattgtcgaatcacctcttgctgggcttgt < 1:6838‑M2/149‑81 (MQ=255) tCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCATGGCACCGACaa > 3:332431/1‑149 (MQ=255) tCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCATGGCACCGACaa > 7:79627/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGAGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCATGGCACCGACAAc > 2:127554/1‑149 (MQ=255) aGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCATGGCACCGACAACGc < 3:184418/149‑1 (MQ=255) cccACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCATGGCACCGACAACGccac > 3:357026/1‑148 (MQ=255) | TGCTGGCATTCAAGGCGGCCCGCTGTTTGAGCCTAGCAGCTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCGCTGTCAGCCACCGGTATCGGCCATGGCACCGACAACGCCAC > NC_002947/356561‑356855 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |