New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 402553 = | 67 (1.110) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 5.9% | coding (645/669 nt) | msrA | peptide methionine sulfoxide reductase MsrA |
? | NC_002947 | 402652 = | 32 (0.560) | coding (546/669 nt) | msrA | peptide methionine sulfoxide reductase MsrA |
CGGGCTTATGTTCACCGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCT > NC_002947/402406‑402701 | cgccagggcaacgacatcggcacccagtaccgctcggccatctactgcaccagcccggaacagctggaacaggccaaggccagccgcgacgccttccaggccgagctgagcaaggccggcttcggtgagatcaccaccgaaatcgacc > 1:165619‑M1/148‑148 (MQ=255) cgccagggcaacgacatcggcacccagtaccgctcggccatctactgcaccagcccggaacagctggaacaggccaaggccagccgcgacgccttccaggccgagctgagcaaggccggcttcggtgagatcaccaccgaaatcgacCa > 1:255557‑M1/148‑149 (MQ=255) gggCTTATGTTCACCGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTggcag < 3:128508/149‑1 (MQ=255) ggCTTATGTTCACCGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTggcagg < 4:220928/149‑1 (MQ=255) ccagggcaacgacatcggcacccagtaccgctcggccatctactgcaccagcccggaacagctggaacaggccaaggccagccgcgacgccttccaggccgagctgagcaaggccggcttcggtgagatcaccaccgaaatcgacCAgg > 2:333898‑M1/146‑149 (MQ=255) cagggcaacgacatcggcacccagtaccgctcggccatctactgcaccagcccggaacagctggaacaggccaaggccagccgcgacgccttccaggccgagctgagcaaggccggcttcggtgagatcaccaccgaaatcgacCAgg < 8:270128‑M1/4‑1 (MQ=255) aTGTTCACCGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACATTGCAGGCTGGGTGGCAGGCacac > 4:257581/1‑149 (MQ=255) tGTTCACCGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCacac < 6:270725/148‑1 (MQ=255) gTTCACCGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGc > 6:314975/1‑149 (MQ=255) ttCACCGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGcc > 7:65850/1‑149 (MQ=255) tCACCGGCTGCAGCTGCTCACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCg > 8:16108/1‑149 (MQ=255) cACCGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCgg > 7:279806/1‑149 (MQ=255) aCCGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCgg < 8:140331/148‑1 (MQ=255) aCCGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGt < 7:74140/149‑1 (MQ=255) aCCGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGt < 6:296821/149‑1 (MQ=255) ccGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTg > 3:353983/1‑149 (MQ=255) ctgcagctgcaCACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGTGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTgccgc < 5:229957/149‑1 (MQ=255) cagctgcaCACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTgccgcc < 3:251778/147‑1 (MQ=255) cagctgcaCACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGa < 5:314975/149‑1 (MQ=255) agctgcaCACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGAt < 5:339158/149‑1 (MQ=255) gctgcaCACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATg > 5:250785/1‑149 (MQ=255) gcaCACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCg < 6:355359/149‑1 (MQ=255) cacaCGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCg < 4:162280/148‑1 (MQ=255) cacaCGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCg < 6:360832/148‑1 (MQ=255) cacaCGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGc < 2:27841/149‑1 (MQ=255) acacGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCa < 7:145478/149‑1 (MQ=255) cacGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCg > 4:135235/1‑146 (MQ=255) cacGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGGGGAACAGGGTCATCGGGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGGGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAg < 3:318989/149‑1 (MQ=255) gCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAg > 1:76888/1‑149 (MQ=255) tCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGcc > 1:238890/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCg < 8:65850/149‑1 (MQ=255) gCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCgg < 4:249627/147‑1 (MQ=255) gCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGt > 5:143678/1‑149 (MQ=255) caggTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGt > 2:25681/3‑148 (MQ=255) cGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTc > 2:360529/1‑149 (MQ=255) cGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTc < 2:238890/149‑1 (MQ=255) tCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTgg < 1:360529/148‑1 (MQ=255) tGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAg < 8:279806/149‑1 (MQ=255) gCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAgg > 1:157917/1‑149 (MQ=255) cAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAgg > 2:250179/1‑148 (MQ=255) accaccATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTActg < 1:270596/149‑1 (MQ=255) ccaccaTGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTActgc < 2:78247/149‑1 (MQ=255) caccaTGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTActgct < 3:97596/149‑1 (MQ=255) ccaTGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCtgg < 2:76888/149‑1 (MQ=255) ccaTGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCtgg > 8:167309/1‑149 (MQ=255) ccaTGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCtgg < 6:250785/149‑1 (MQ=255) caTGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTg < 4:369971/133‑1 (MQ=255) caTGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTg > 3:369971/1‑133 (MQ=255) caTGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCtggt > 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cGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCg < 6:143678/149‑1 (MQ=255) gAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGACACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCg > 5:92505/1‑148 (MQ=255) aaGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTAACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGCTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGaaa < 6:194827/149‑1 (MQ=255) ggCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATa < 7:16108/149‑1 (MQ=255) gCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGaaa > 1:361503/1‑146 (MQ=255) gCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGaaa > 7:270128/1‑146 (MQ=255) cGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGa < 4:353983/149‑1 (MQ=255) ctaaCGGGGAGGGCAACAGTGGAAGCGTGCTCCTGCTTCAGTGACCTTGCAGGCGGGGGGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCCGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGAcg < 6:261796/147‑1 (MQ=255) ggccgagctgagcaaggccggcttcggtgagatcaccaccgaaatcgacCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTgg > 8:285867‑M1/50‑149 (MQ=255) ccgagctgagcaaggccggcttcggtgagatcaccaccgaaatcgacCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTc > 3:109356‑M1/48‑149 (MQ=255) aaCAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTc > 7:332627/1‑149 (MQ=255) gTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCggtggt < 8:228653/149‑1 (MQ=255) cTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGAt < 2:157917/149‑1 (MQ=255) aTGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGAtct > 2:272042/1‑148 (MQ=255) tGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTc < 7:127509/130‑1 (MQ=255) tGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTc > 8:127509/1‑130 (MQ=255) gCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGGCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCAc > 1:122028/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGcc > 4:193506/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCt > 5:105986/1‑149 (MQ=255) tcAGGCTGTGTGGCAGGCACACGCGGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAATTAGACGGTGGGTGCGTGGTCGATTTCggtg < 6:318372/124‑1 (MQ=255) gCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCtt < 3:135235/148‑1 (MQ=255) gCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTCCCTGGTGGATTTCggtg > 5:318372/1‑125 (MQ=255) gTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCg < 3:193506/149‑1 (MQ=255) gTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCg > 4:70797/1‑149 (MQ=255) ggcaggcaCACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGGCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGc < 4:287004/149‑1 (MQ=255) CAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCt > 1:25681‑M1/1‑149 (MQ=255) | CGGGCTTATGTTCACCGGCTGCAGCTGCACACGCTCAAGCTGGCCGGTTTCGTGCAACACCACCATGACCTTGCGCACGAAAGGCGACAACGGCGAGTGGAACAGGGTCATCGTGCTCATGCTTCAGTTACCTTGCAGGCTGGGTGGCAGGCACACGCCGGTGCCGCCGATGCCGCAGTAGCCGTCCGGGTTCTTGGCCAGGTACTGCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCT > NC_002947/402406‑402701 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |