| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 581956 | 72 (1.200) | 8 (0.140) | 8/244 | NT | 10.5% | coding (1246/1428 nt) | selA | selenocysteine synthase |
| ? | NC_002947 | = 581974 | 70 (1.260) | coding (1264/1428 nt) | selA | selenocysteine synthase | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CAGGCCCAGGCCGAGCGCCTGGCGCCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGCCCA > NC_002947/581809‑582104 | caggcccaggccGAGCGCCTGGCGCCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGC > 7:251610‑M1/1‑148 (MQ=255) gcccaggccGAGCGCCTGGCGCCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAgt < 5:85600/149‑1 (MQ=255) gcccaggccGAGCGCCTGGCGCCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAgt > 7:149866/1‑149 (MQ=255) ccaggccGAGCGCCTGGCGCCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAgtgt > 5:175146/1‑149 (MQ=255) ggccGAGCGCCTGGCGCCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCga < 5:120703/149‑1 (MQ=255) gccGAGCGCCTGGCGCCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCgaa < 2:306319/149‑1 (MQ=255) cgcctggcgcctg‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGtt < 4:353955/149‑1 (MQ=255) cgcctggcgcctg‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGtt > 7:156551/1‑149 (MQ=255) cctggcgcctg‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTgc < 8:251610/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCg < 4:341946‑M2/149‑2 (MQ=255) gcgcctg‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCC‑‑Cgcaacttcttcgacacttgcgg < 5:157164‑M1/147‑23 (MQ=255) gcgcCTGGAGCTC‑AGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgg < 2:274794‑M2/149‑5 (MQ=255) gcgcCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgg > 3:341946‑M2/1‑145 (MQ=255) gcgcCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgg > 1:16720‑M2/1‑145 (MQ=255) gcCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggc > 8:6603‑M2/1‑143 (MQ=255) ccTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggcg < 6:242116‑M2/149‑8 (MQ=255) aGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCgcaacttcttcgacacttgcgggcgcagg < 2:192338‑M1/149‑30 (MQ=255) aGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCgcaacttcttcgacacttgcgggcgcag < 8:11798‑M1/148‑29 (MQ=255) aGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGc < 4:138879/149‑1 (MQ=255) cTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGGAGAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGcc > 1:302832/1‑149 (MQ=255) cTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCt > 6:203085/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCCTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTAGGGCATGATCGG‑CACTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGAAAGAGTCTAAGAAGTTGCGCGGCCGCAGCCTg > 4:26631/1‑148 (MQ=255) gcgTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATgtgt < 6:37936/149‑1 (MQ=255) gTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCa < 8:283110/142‑1 (MQ=255) gTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCa > 7:283110/1‑142 (MQ=255) ctcGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTg > 5:137766/1‑147 (MQ=255) tcGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCgcaacttcttcgacacttgcgggcgca > 6:336903‑M1/1‑105 (MQ=255) tcGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCgcaacttcttcgacacttgcgggcgca < 5:336903‑M1/132‑28 (MQ=255) ggTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGa < 1:100336/146‑1 (MQ=255) ggTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGa < 7:346359/146‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAgcgcgc < 8:303085/148‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGcc < 8:149866/149‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGcc > 7:272209/1‑149 (MQ=255) aTGCGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTgc < 2:309029/149‑1 (MQ=255) tGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTgcg < 1:177716/149‑1 (MQ=255) gCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAgc > 2:43638/1‑136 (MQ=255) gCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAgc < 1:43638/136‑1 (MQ=255) aTCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCgcaacttcttcgacacttgcgggcgcaggcacagag > 7:23879‑M1/1‑88 (MQ=255) aTCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCgcaacttcttcgacacttgcgggcgcaggcacagag < 8:23879‑M1/124‑37 (MQ=255) tAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCtgccggtg > 8:219326/1‑149 (MQ=255) 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ggCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCg > 2:101336/1‑149 (MQ=255) gCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCaa > 7:335075/1‑68 (MQ=255) gCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCaa < 8:335075/68‑1 (MQ=255) aTGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCAt > 7:17983/1‑149 (MQ=255) aTCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGGTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGAGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGTGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTga < 3:26631/149‑1 (MQ=255) aTCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTga > 5:193100/1‑149 (MQ=255) tCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTga < 2:302832/148‑1 (MQ=255) gg‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTgacga < 7:219326/149‑1 (MQ=255) gg‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTgacga < 4:123867/149‑1 (MQ=255) gg‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTgacg < 3:276272/148‑1 (MQ=255) g‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGTGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTgacgac > 5:1946/1‑149 (MQ=255) g‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTgacgac > 4:329212/1‑149 (MQ=255) g‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCACAGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCACCCTGCATGTGTTGGAGCGCCCCCTGAGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTgacgac > 1:227294/1‑149 (MQ=255) aGTGGCAGCCAGCGGGTGGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCGGTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGTGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGAcgacga < 8:258291/149‑1 (MQ=255) gCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGcc > 7:116978/1‑149 (MQ=255) agccagccGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCt > 6:5775/1‑149 (MQ=255) 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ttGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTgcgc > 7:286559/1‑147 (MQ=255) ttGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTgcgc > 7:262723/1‑147 (MQ=255) ttGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTCGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTgcgc > 5:320847/1‑147 (MQ=255) gCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGc > 3:253587/1‑149 (MQ=255) cccAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCt < 3:329212/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTg > 6:281969/1‑149 (MQ=255) ccAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTg > 2:74107/1‑149 (MQ=255) ccAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACAAgcgctccatc > 4:3634/1‑143 (MQ=255) naGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTg > 2:52688/2‑148 (MQ=255) cAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATg < 6:26848/122‑1 (MQ=255) cAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATg > 5:26848/1‑122 (MQ=255) cAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTg > 7:305690/1‑148 (MQ=255) gTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGAt < 1:274794/149‑1 (MQ=255) ccGCTCTTTGCCTGCGCGCGCCAGGGTCGAAGAAGTCGCGCGGGCTCAGCCTGCTTTTGTTGGAGCGCGCACTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACTATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGAc < 6:364543/149‑1 (MQ=255) ctctGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgat > 7:23879‑M2/1‑36 (MQ=255) ctctGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgat < 8:23879‑M2/124‑89 (MQ=255) ctctGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGCGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGaa < 8:156551/149‑1 (MQ=255) tgtgCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGcc < 8:286559/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccgagacgcgcctggagct < 2:192338‑M2/149‑121 (MQ=255) cTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccgagacgcgcctggagct < 8:11798‑M2/148‑121 (MQ=255) cTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGtg > 7:324858/1‑149 (MQ=255) cTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGtg > 5:268035/1‑149 (MQ=255) cTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGtg > 7:169549/1‑149 (MQ=255) tGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccga < 5:336903‑M2/132‑106 (MQ=255) tGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccga > 6:336903‑M2/1‑27 (MQ=255) cgcCCGCgcaacttcttcgacacttgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccgagacgcgcctggagctcagg < 6:242116‑M1/149‑143 (MQ=255) cgcCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccgagacgcgcctggagctca > 7:11798‑M2/1‑25 (MQ=255) gcCCGCgcaacttcttcgacacttgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccgagacgcgcctggagctcaggc > 8:6603‑M1/1‑6 (MQ=255) ccGCgcaacttcttcgacacttgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccgagacgcgcctggagctcaggcgc > 1:16720‑M1/1‑4 (MQ=255) ccGCgcaacttcttcgacacttgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccgagacgcgcctggagctcaggcgc > 3:341946‑M1/1‑4 (MQ=255) ccGCgcaacttcttcgacacttgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccgagacgcgcctgagctccaggcgc < 2:274794‑M1/149‑146 (MQ=255) cGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGcc < 1:190759/149‑1 (MQ=255) gCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGccc < 1:52688/149‑1 (MQ=255) cgcaacttcttcgacacttgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccgagacgcgcctggagctcaggcgccag < 4:341946‑M1/149‑149 (MQ=255) | CAGGCCCAGGCCGAGCGCCTGGCGCCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGCCCA > NC_002947/581809‑582104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |