| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 581956 | 72 (1.200) | 8 (0.140) | 8/244 | NT | 10.5% | coding (1246/1428 nt) | selA | selenocysteine synthase |
| ? | NC_002947 | = 581974 | 70 (1.260) | coding (1264/1428 nt) | selA | selenocysteine synthase | |||||
CCTGGCGCCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGCCCAGTTGCCAGCCCTGCA > NC_002947/581826‑582119 | cctggcgcctg‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTgc < 8:251610/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCg < 4:341946‑M2/149‑2 (MQ=255) gcgcCTGGAGCTC‑AGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgg < 2:274794‑M2/149‑5 (MQ=255) gcgcCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgg > 3:341946‑M2/1‑145 (MQ=255) gcgcCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgg > 1:16720‑M2/1‑145 (MQ=255) gcCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggc > 8:6603‑M2/1‑143 (MQ=255) ccTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggcg < 6:242116‑M2/149‑8 (MQ=255) tg‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGCGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTgc > 7:266455/1‑140 (MQ=255) aGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGc < 4:138879/149‑1 (MQ=255) cTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGGAGAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGcc > 1:302832/1‑149 (MQ=255) cTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCt > 6:203085/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCCTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTAGGGCATGATCGG‑CACTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGAAAGAGTCTAAGAAGTTGCGCGGCCGCAGCCTg > 4:26631/1‑148 (MQ=255) gcgTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATgtgt < 6:37936/149‑1 (MQ=255) gTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCa < 8:283110/142‑1 (MQ=255) gTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCa > 7:283110/1‑142 (MQ=255) ctcGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTg > 5:137766/1‑147 (MQ=255) ggTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGa < 1:100336/146‑1 (MQ=255) ggTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGa < 7:346359/146‑1 (MQ=255) 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gcgTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCt > 5:12586/1‑149 (MQ=255) gTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTgg < 4:84511/149‑1 (MQ=255) gggCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGc < 6:137766/148‑1 (MQ=255) ggCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGcc < 7:142315/148‑1 (MQ=255) ggCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCg > 2:101336/1‑149 (MQ=255) aTGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCAt > 7:17983/1‑149 (MQ=255) aTCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGGTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGAGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGTGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTga < 3:26631/149‑1 (MQ=255) aTCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTga > 5:193100/1‑149 (MQ=255) tCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTga < 2:302832/148‑1 (MQ=255) gg‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTgacga < 4:123867/149‑1 (MQ=255) gg‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTgacga < 7:219326/149‑1 (MQ=255) gg‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTgacg < 3:276272/148‑1 (MQ=255) g‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGTGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTgacgac > 5:1946/1‑149 (MQ=255) g‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTgacgac > 4:329212/1‑149 (MQ=255) g‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCACAGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCACCCTGCATGTGTTGGAGCGCCCCCTGAGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTgacgac > 1:227294/1‑149 (MQ=255) 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ccagccGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCtg < 4:259830/148‑1 (MQ=255) ccGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCt > 2:190759/1‑149 (MQ=255) ttGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGAc < 5:242116/149‑1 (MQ=255) gcgcTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTgc < 6:175146/149‑1 (MQ=255) gcTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCCGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTgcgc > 1:107621/1‑149 (MQ=255) 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cTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGtg > 5:268035/1‑149 (MQ=255) cTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGtg > 7:324858/1‑149 (MQ=255) tGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccga < 5:336903‑M2/132‑106 (MQ=255) tGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccga > 6:336903‑M2/1‑27 (MQ=255) cgcCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgcgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccgagacgcgcctggagctca > 7:11798‑M2/1‑25 (MQ=255) ccGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCgggcgcaggcacagagcggcactgggcaagcgcgcaaccggctggctgccactgccgatcatgcccaacgcgggctctacgctgattgcccattgctcaccgagacgcgcctggagctcaggcgc < 5:157164‑M2/147‑126 (MQ=255) cGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGcc < 1:190759/149‑1 (MQ=255) gCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGccc < 1:52688/149‑1 (MQ=255) gtCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGCTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGACAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGCCCAGTTGc > 2:275680/1‑149 (MQ=255) gaagaaGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGCCCAGTTGCCAg > 3:25312/1‑149 (MQ=255) aagaagTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGCCCAGTTGCCAGc > 2:184218/1‑149 (MQ=255) aagaagTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGCCCAGTTGCCAGc > 3:140986/1‑149 (MQ=255) agaagTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGACGCCCAGTGGCTGGCCCAGTTGCCAGcc > 8:153486/1‑149 (MQ=255) agaagTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGCCCAGTTGCCAGcc < 4:253587/149‑1 (MQ=255) gaagTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCCCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGTCGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGCCCAGTTGCCAGccc > 3:338622/1‑149 (MQ=255) ttGCGCGTGGTCAGCCTGCTTGTGTTGGAGCGCGCAATGCGCGACCTGCCGGTGCCTGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGACCTGTTGCTGGACCTGAGCCAGCTGGATGACGAAGCCCATTGGCTGGACCAGTTGCCAGCCCTGCa < 2:227294/149‑1 (MQ=255) | CCTGGCGCCTG‑AGCTCCAGGCGCGTCTCGGTGAGCAATGGGCAATCAGCGTAGAGCCCGCGTTGGGCATGATCGG‑CAGTGGCAGCCAGCCGGTTGCGCGCTTGCCCAGTGCCGCTCTGTGCCTGCGCCCGCAAGTGTCGAAGAAGTTGCGCGGGCGCAGCCTGCATGTGTTGGAGCGCGCCCTGCGCGACCTGCCGGTGCCGGTGCTGGGCCGCATTGACGACGATGCCCTGTGGCTGGACCTGCGCCAGCTGGATGACGAAGCCCAGTGGCTGGCCCAGTTGCCAGCCCTGCA > NC_002947/581826‑582119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |