| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 619226 = | 86 (1.430) | 5 (0.090) | 4/250 | NT | 5.9% | coding (772/1329 nt) | pfeS‑I | histidine kinase |
| ? | NC_002947 | 619283 = | 77 (1.350) | coding (715/1329 nt) | pfeS‑I | histidine kinase | |||||
CACACGGAAAGCACCAATACCGGCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCAC > NC_002947/619081‑619372 | cacaCGGAAAGCACCAATACCGGCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCt < 5:184070/149‑1 (MQ=255)cacaCGGAAAGCACCAATACCGGCTCGGTCACCAGGCGGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCt < 3:214165/149‑1 (MQ=255) gccctgcgggccgatgatctggacagccccgccctgcccctgcaggagcggcgtgatgagctgggtgagctggctcaggccttcaagcacatggccgggcgcctgcgccagagccttgagcaacagcgcctgctgttgcgcaCGCTGTc < 6:297762‑M1/7‑1 (MQ=255) acGGAAAGCACCAATACCGGCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTc < 6:155126/149‑1 (MQ=255) cctgcgggccgatgatctggacagccccgccctgcccctgcaggagcggcgtgatgagctgggtgagctggctcaggccttcgagcacatggccgggcgcctgcgccagagccttgagcaacagcgcctgctgttgcgcaCgctgact < 8:280933‑M1/8‑4 (MQ=255) ctgcgggccgatgatctggacagccccgccctgcccctgcaggagcggcgtgatgagctgggtgagctggctcaggccttcgagcacatggccgggcgcctgcgccagagccttgagcaacagcgcctgctgttgcgcaCg < 4:223264‑M1/2‑1 (MQ=255) ctgcgggccgatgatctggacagccccgccctgcccctgcaggagcggcgtgatgagctgggtgagctggctcaggccttcgagcacatggccgggcgcctgcgccagagccttgagcaacagcgcctgctgttgcgcaCg > 3:223264‑M1/140‑141 (MQ=255) ataGCACCAATACCTGCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCTGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCGAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATgg < 4:200525/147‑1 (MQ=255) aaGCACCAATACCGGCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATggg < 6:159090/149‑1 (MQ=255) aaGCACCAATACCGGCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATggg < 4:39328/149‑1 (MQ=255) cACCAATACCGGCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGa > 8:96127/1‑149 (MQ=255) ccAATACCGGCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATg > 5:171282/1‑149 (MQ=255) cAATACCGGCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATgc > 3:154079/1‑149 (MQ=255) cGGCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGcc > 7:213920/1‑149 (MQ=255) cGGCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGcc > 5:210108/1‑149 (MQ=255) gCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCcgc < 1:136141/149‑1 (MQ=255) gCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTATTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCcgc < 6:111051/149‑1 (MQ=255) ggTCACCAGGCTGGGCTGTACGGTGTCCATCCAGGCCAGGGCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCgcgc < 6:220572/147‑1 (MQ=255) gTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAg < 7:96127/149‑1 (MQ=255) gctgggctgTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑Tg‑c > 6:75230/1‑149 (MQ=255) gctgggctgTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑Tg‑c > 2:370329/1‑149 (MQ=255) tgTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTc > 1:163074/1‑149 (MQ=255) ttCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CTCAATTCGt < 6:256005/149‑1 (MQ=255) ttCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTc < 8:259185/147‑1 (MQ=255) ttCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGt > 1:142266/1‑149 (MQ=255) ggTGTCCATCCCGGCCAGGGCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTga < 2:337487/148‑1 (MQ=255) ggTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTga < 6:81558/148‑1 (MQ=255) ggTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTga < 6:138659/148‑1 (MQ=255) gtgtCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTgaga > 7:13254/1‑149 (MQ=255) gagcggcgtgatgagctgggtgagctggctcaggccttcgagcacatggccgggcgcctgcgccagagccttgagcaacagcgcctgctgttgcgcaCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑Tg‑c < 8:198281‑M1/39‑1 (MQ=255) gagcggcgtgatgagctgggtgagctggctcaggcctccgagcacatggccgggcgcctgcgccagagccttgagcaacagcgcctgctgttgcgcaCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑Tg‑c > 7:198281‑M1/98‑136 (MQ=255) tgtCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTgaga > 5:5648/1‑148 (MQ=255) tccatccaGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAg < 4:323326/149‑1 (MQ=255) catccaGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCg > 6:352985/1‑149 (MQ=255) catccaGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCg > 2:124471/1‑149 (MQ=255) tccaGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGCCAGCGTg > 6:207018/1‑149 (MQ=255) tccaGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTg > 5:153616/1‑149 (MQ=255) gtgatgagctgggtgagctggctcaggccttcgagcacatggccgggcgcctgcgccagagccttgagcaacagcgcctgctgttgcgcaCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTg > 5:75360‑M1/91‑149 (MQ=255) ccaggccaggTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGt > 2:78212/1‑147 (MQ=255) ggccaggTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTgcgc > 4:365528/1‑148 (MQ=255) gccaggTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCaa > 4:33026/1‑149 (MQ=255) gccaggTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCaa > 5:12369/1‑149 (MQ=255) ccaggTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCaa > 7:283348/1‑148 (MQ=255) aggTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCTCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGATACAGCGTGCGCAAcag > 7:280933/1‑149 (MQ=255) 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ggTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCt > 4:352109/1‑149 (MQ=255) gtgtTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTg < 5:75230/149‑1 (MQ=255) tgtTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGt > 6:368019/1‑149 (MQ=255) tttCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGc > 1:255951/1‑149 (MQ=255) tCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGCTG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGAGCAACAGCGCCTGCTGTTGc < 1:78212/148‑1 (MQ=255) cagcagCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATTCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGGGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTc > 3:42524/1‑147 (MQ=255) cagcagCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTc > 8:199517/1‑147 (MQ=255) cagcagCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGAGCAACAGCGCCTGCTGTTGCGCac < 2:132183/149‑2 (MQ=255) gcagcTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAgg < 7:114543/149‑1 (MQ=255) gcagcTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAgg > 1:257885/1‑149 (MQ=255) gcagcTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAgg < 4:193958/149‑1 (MQ=255) gcagcTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAg > 8:239239/1‑148 (MQ=255) cttcgagcacatggccgggcgcctgcgccagagccttgagcaacagcgcctgctgttgcgcaCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTg < 3:371557‑M1/59‑1 (MQ=255) cttcgagcacatggccgggcgcctgcgccagagccttgagcaacagcgcctgctgttgcgcaCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTg > 4:371557‑M1/63‑121 (MQ=255) tGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGgcg > 2:227358/1‑149 (MQ=255) cATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATTCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TGCCTCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTgg < 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tCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGgc < 3:105233/148‑1 (MQ=255) tACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCgg > 3:183641/1‑149 (MQ=255) tCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAt > 5:113125/1‑149 (MQ=255) aCGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAtgt > 5:188980/1‑149 (MQ=255) aCGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCGGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAtgt < 5:210191/149‑1 (MQ=255) ggTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTACTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGc < 2:308218/149‑1 (MQ=255) gTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCt < 1:124471/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAtg > 5:96244/1‑142 (MQ=255) cAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAtg < 6:96244/142‑1 (MQ=255) aGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCg > 3:47067/1‑147 (MQ=255) ggCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAg < 5:368019/149‑1 (MQ=255) ggCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAg < 8:213920/149‑1 (MQ=255) ggCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAg < 6:171282/149‑1 (MQ=255) ctcgcTCGCGCAGCTGCGGCGGTCGCAAGTCGCCGTCATCGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAg < 4:286256/147‑1 (MQ=255) gcgcTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAgg > 8:128516/1‑149 (MQ=255) gcTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAg > 3:286256/1‑146 (MQ=255) tCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAg < 3:84240/144‑1 (MQ=255) tCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAg > 4:84240/1‑144 (MQ=255) tCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCt > 6:317134/1‑148 (MQ=255) gcgcAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGa < 4:63097/148‑1 (MQ=255) gcgcAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGa < 2:163074/148‑1 (MQ=255) gcgcAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAACGCCTGAg > 2:239742/1‑149 (MQ=255) cgcAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGc < 2:257885/149‑1 (MQ=255) gCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGc < 4:154079/149‑1 (MQ=255) ggcggTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCAcc < 7:128516/149‑1 (MQ=255) gcggTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCAccc < 2:275089/149‑1 (MQ=255) gcggTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCAcc > 6:307683/1‑148 (MQ=255) aaGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCGCGGCCAtgt < 6:349132/115‑1 (MQ=255) aaGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCGCGGCCAtgt > 5:349132/1‑115 (MQ=255) gTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCAc < 7:239239/149‑1 (MQ=255) | CACACGGAAAGCACCAATACCGGCTCGGTCACCAGGCTGGGCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCG‑TG‑CGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCAC > NC_002947/619081‑619372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |