| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 628581 = | 88 (1.460) | 5 (0.090) | 3/248 | NT | 5.9% | coding (214/819 nt) | eutC | ethanolamine ammonia‑lyase subunit beta |
| ? | NC_002947 | 628637 = | 76 (1.340) | coding (158/819 nt) | eutC | ethanolamine ammonia‑lyase subunit beta | |||||
CCACCACGATGGCCAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGA > NC_002947/628437‑628727 | ccaccaCGATGGCCAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCtt < 3:25572/149‑1 (MQ=255) caccacGATGGCCAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCttt > 3:240301/1‑149 (MQ=255) accacGATGGCCAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTc < 4:70057/149‑1 (MQ=255) accacGATGGCCAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTc < 3:10200/149‑1 (MQ=255) ctacccccgacaacccttggctggccctgcgcaacctgaccccggcgcgcatcgccctgggccgcaccggcaccagcctgccgaccggggcgcagctggacttccagttcgcccatgcccaggcacgagatgccgtgcacctGGCTTTc < 7:84950‑M1/7‑1 (MQ=255) ctacccccgacaacccttggctggccctgcgcaacctgaccccggcgcgcatcgccctgggccgcaccggcaccagcctgccgaccggggcgcagctggacttccagttcgcccatgcccaggcacgagatgccgtgcacctGGCTTTc < 4:93207‑M1/7‑1 (MQ=255) cacGATGGCCAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTcgc < 3:264267/149‑1 (MQ=255) cacGATGGCCAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTc < 1:125529/147‑1 (MQ=255) cacGATGGCCAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTc > 2:125529/1‑147 (MQ=255) aTGGCCAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGccc < 6:70302/149‑1 (MQ=255) cgaGATCGACGCCGCGGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGGCGCAAGCGGGGCTTCGGTCCGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCGGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCGGTGCCACCCCCGGGGTGCGCGCCCGCgg > 8:84950/3‑149 (MQ=255) ccAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCgg > 6:335463/1‑149 (MQ=255) ccAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCgg > 1:290472/1‑149 (MQ=255) cAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGt < 1:13509/149‑1 (MQ=255) cAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGt < 5:82366/149‑1 (MQ=255) gATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCa < 5:228851/149‑1 (MQ=255) gccgccGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAgct > 8:62677/1‑149 (MQ=255) gccgccGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAgct > 4:102414/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCg < 4:240301/149‑1 (MQ=255) 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ggTCGCAATCGTTGCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGGCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGTTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGt < 8:236206/149‑1 (MQ=255) tCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTg > 6:358662/1‑148 (MQ=255) cAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACg > 5:39542/1‑149 (MQ=255) gAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCAtc > 8:174882/1‑149 (MQ=255) gTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCAtctc < 5:153086/149‑1 (MQ=255) 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aGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGc < 6:39542/149‑1 (MQ=255) ccgccgccCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACgg < 1:211583/131‑1 (MQ=255) ccgccgccCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACgg > 2:211583/1‑131 (MQ=255) ccgccgccCAAGGTCCGAGCGCTGCAGTTACTAATAGCAGTCGC‑TGGCAGCGATGTGCAACACCAGGCTTTCCCGCCCCCGGACACACAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTAGAAAGCCAGGTGCACGGCATCGCGAGCCGGGGAAt > 8:236679/1‑149 (MQ=255) gccgccCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATgg > 5:142295/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAAc > 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tggtggCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGccc > 2:159039/1‑145 (MQ=255) ggtggCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTc > 3:100021/1‑149 (MQ=255) gCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGc < 6:138320/148‑1 (MQ=255) gCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGc < 2:246997/148‑1 (MQ=255) ggTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAgg > 3:93207/1‑149 (MQ=255) tCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGAGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGTGCGGCAGTCt > 4:281655/1‑149 (MQ=255) cGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTg < 5:16310/149‑1 (MQ=255) gC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTgg < 3:102414/149‑1 (MQ=255) c‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGt < 2:336432/149‑1 (MQ=255) c‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGt < 4:259612/149‑1 (MQ=255) aGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCgg < 7:191440/149‑1 (MQ=255) tgtgCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCgg > 8:165786/1‑149 (MQ=255) gtgCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCgg < 8:279155/148‑1 (MQ=255) gtgCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGc > 7:279155/1‑149 (MQ=255) tgCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCgg < 7:174882/147‑1 (MQ=255) gCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGCCAGGCTGGTGCCGGTGCGGccc < 7:237541/149‑1 (MQ=255) cAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGcc > 5:198683/1‑147 (MQ=255) aaCACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGTTGGTGCCGGTGCGGCCCAg < 4:300816/149‑1 (MQ=255) acacCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAgg < 4:100021/149‑1 (MQ=255) acacCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAgg > 2:209399/1‑149 (MQ=255) acacCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAgg > 5:121820/1‑149 (MQ=255) acCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGc > 3:159884/1‑149 (MQ=255) cAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGa > 1:1876/1‑149 (MQ=255) GGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGaa > 5:267774‑M1/1‑97 (MQ=255) GGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGaa < 6:267774‑M1/97‑1 (MQ=255) | CCACCACGATGGCCAGATCGACGCCGCCGGGGTTGGCCTGGGCGTGCTGGCGAAGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGA > NC_002947/628437‑628727 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |