New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 628581 = | 88 (1.460) | 5 (0.090) | 3/248 | NT | 5.9% | coding (214/819 nt) | eutC | ethanolamine ammonia‑lyase subunit beta |
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AGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCG > NC_002947/628490‑628785 | atcgccctgggccgcaccggcaccagcctgccgaccggggcgcagctggacttccagttcgcccatgcccaggcacgagatgccgtgcacctGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCa > 8:314395‑M1/93‑149 (MQ=255) tcgccctgggccgcaccggcacgagcctgccgaccggggcgcagctggacttccagttcgcccatgcccaggcacgagatgccgtgcaccaGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAg > 8:163934‑M1/92‑149 (MQ=255) tcgccctgggccgcaccggcaccagcctgtcgaccggggcgcagctggacttccagttcgcccatgcccaggcacgagatgccgtgcacctGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAg > 7:249194‑M1/92‑149 (MQ=255) tcgccctgggccgcaccggcaccagcctgccgaccggggcgcagctggacttccagttcgcccatgcccaggcacgagatgccgtgcacctGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAg > 5:341192‑M1/92‑149 (MQ=255) ggTCGCAATCGTTGCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGGCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGTTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGt < 8:236206/149‑1 (MQ=255) tCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTg > 6:358662/1‑148 (MQ=255) cAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACg > 5:39542/1‑149 (MQ=255) gAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCAtc > 8:174882/1‑149 (MQ=255) gTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCAtctc < 4:334008/149‑1 (MQ=255) gTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCAtctc < 5:153086/149‑1 (MQ=255) tCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGc < 4:63832/143‑1 (MQ=255) tCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGc > 3:63832/1‑143 (MQ=255) ttCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTg > 8:204887/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCt < 5:358662/149‑1 (MQ=255) ttCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTg > 1:26059/1‑149 (MQ=255) ttCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTg > 4:220990/1‑149 (MQ=255) ttCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGA‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTg > 3:228669/1‑149 (MQ=255) gccagcacgccCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTgg < 5:104749/141‑1 (MQ=255) 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gTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTgg > 3:195774/1‑148 (MQ=255) gTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTgg > 1:219228/1‑148 (MQ=255) gTCCGGGCGCTGCAGGGACTGGTGGCGGGCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGa < 7:264291/149‑1 (MQ=255) tCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCTC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGaa < 1:63686/149‑1 (MQ=255) tCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGaa < 7:204887/149‑1 (MQ=255) 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TTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGc < 4:88843‑M1/126‑1 (MQ=255) TTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATgcgc < 3:49099‑M1/149‑1 (MQ=255) TTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATgcgc < 8:211450‑M1/149‑1 (MQ=255) gcCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCggg < 8:191241/149‑1 (MQ=255) ccGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGt > 5:124546/1‑149 (MQ=255) acgccggcctggccagccagctgagtgaccgcgggcgcgaaagccAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGt < 6:341192‑M2/104‑1 (MQ=255) gTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGt > 1:164498/1‑149 (MQ=255) gTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGt > 5:109370/1‑149 (MQ=255) gTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGt < 8:325476/149‑1 (MQ=255) tCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTgcg > 8:225788/1‑148 (MQ=255) aGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAg > 6:356418/1‑149 (MQ=255) gctggctgGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAgg < 6:142295/149‑1 (MQ=255) aGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACCGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTCCGCACGGCCAGACAAgg > 1:125456/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAgg > 7:286761/1‑147 (MQ=255) gCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAgg < 8:286761/147‑1 (MQ=255) ccGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGtt < 7:211450/149‑1 (MQ=255) cGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTg > 2:376563/1‑149 (MQ=255) gCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTc < 7:236679/149‑1 (MQ=255) tGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCggg < 5:356418/149‑1 (MQ=255) gTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGATTGTCgggg < 3:220990/148‑1 (MQ=255) gaaagccAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAg < 4:93207‑M2/142‑1 (MQ=255) gaaagccAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAg < 7:84950‑M2/142‑1 (MQ=255) aGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCg < 4:49099/149‑1 (MQ=255) | AGGGTCGCAATCGAGTCTTCGTTCAGCCGCCGCCCAAGGTCCGGGCGCTGCAGGTACTGGTGGCGGTCGC‑TGGCAGCGCTGTGCAACACCAGGCTTTCGCGCCCGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCG > NC_002947/628490‑628785 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |