| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1451149 | 62 (1.030) | 6 (0.110) | 6/250 | NT | 8.7% | coding (333/906 nt) | PP_1270 | LysR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 1451175 | 67 (1.180) | coding (359/906 nt) | PP_1270 | LysR family transcriptional regulator | |||||
CCCGTGCGTTGGCCCTGCGCGAGCAGGTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTGAACTGGGCCCGGAAATCAAGG > NC_002947/1451001‑1451297 | cccGTGCGTTGGCCCTGCGCGAGCAGGTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCC > 6:333056‑M1/1‑149 (MQ=255) ccGTGCGTTGGCCCTGCGCGAGCAGGTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACATGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCC > 6:72909‑M1/1‑148 (MQ=255) gTGCGTTGGCCCTGCGCGAGCAGGTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAg > 4:257304/1‑149 (MQ=255) gCGTTGGCCCTGCGCGAGCAGGTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAgct > 6:639/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCCTGCGCGAGCAGGTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAgctgc < 4:185609/149‑1 (MQ=255) gCCCTGCGCGAGCAGGTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTgcg < 5:639/149‑1 (MQ=255) tGCGCGAGCAGGTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCat > 3:93649/1‑148 (MQ=255) gcgAGCAGGTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCatgatg < 3:257304/149‑1 (MQ=255) aGCAGGTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTg < 8:76511/149‑1 (MQ=255) gCAGGTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGCGAGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTAGACCTGGTGAACATGGCCCGTGACTTCAACATCCGCACCAATGATTTCTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTCCTGCGCATGATGCTg > 1:236439/1‑149 (MQ=255) ggTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCtgggccagcatcatgcgcagcagct > 8:8321‑M1/1‑124 (MQ=255) gCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCtgggccagcatcatgcgcagcagctggg > 2:318887‑M1/1‑121 (MQ=255) cATGGCCTGGTTGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAgg > 5:155258‑M2/1‑146 (MQ=255) ccTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCtgggccagcatcatgcgcagcagctgggcgccg > 4:206481‑M1/1‑115 (MQ=255) ccTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCtgggccagcatcatgcgcagcagctgggcgccg < 3:206481‑M1/148‑34 (MQ=255) gtggAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCtgggccagcatcatgcgcagcagctgggcgccgtaaag < 1:318887‑M1/149‑39 (MQ=255) gAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCtgggccagcatcatgcgcagcagctgggcgccgtaaaggg < 7:8321‑M1/148‑41 (MQ=255) aGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGgtg < 5:252696/149‑1 (MQ=255) gCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCg < 7:268781/149‑1 (MQ=255) gC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTTGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACTGTGTTGCGGTTTg > 4:228446/1‑149 (MQ=255) gtgtTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTg < 7:214194/114‑1 (MQ=255) gtgtTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTg > 8:214194/1‑114 (MQ=255) ttCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGt > 3:103032/1‑139 (MQ=255) ttCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGt < 4:103032/139‑1 (MQ=255) ttCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGa < 3:26880/149‑1 (MQ=255) cGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAgtgg > 2:236831/1‑149 (MQ=255) gATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACga > 2:166029/1‑149 (MQ=255) tCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACgatga < 4:343436/148‑1 (MQ=255) cGACCTGGGGAACCTGGACGTTGCCTTCTAGATCCGCACCAATGTGTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGAACAGCTGCTGCGCTTGAGTGTGGCCGATGCGCC‑‑TCGTACTGTGTTGCCGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGAAgatgat < 2:236439/148‑1 (MQ=255) gACCTTGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCTGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACTatgatg < 3:228446/148‑1 (MQ=255) aCCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCTGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCa < 5:72909/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCa < 6:364200/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAg > 7:342201/1‑149 (MQ=255) gTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGtgct < 4:192427/149‑1 (MQ=255) aaCCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTgcg > 5:341619/1‑149 (MQ=255) cTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAgg > 5:61815/1‑118 (MQ=255) cTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAgg < 6:61815/118‑1 (MQ=255) cTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCaa > 7:193060/1‑149 (MQ=255) ccGAGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGc < 6:312351/149‑1 (MQ=255) cGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCa < 1:166029/149‑1 (MQ=255) ccTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATc < 6:181629/149‑1 (MQ=255) ttCTACATCCGCACCTATGATTTGTTCATTGCGCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTGTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCgc > 5:5797/1‑148 (MQ=255) ttCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGGAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGa > 3:145597/1‑149 (MQ=255) ttCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACgatgat < 7:193586/123‑1 (MQ=255) ttCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACgatgat > 8:193586/1‑123 (MQ=255) tCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCata > 4:44859/1‑144 (MQ=255) tCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCata < 3:44859/144‑1 (MQ=255) aCATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCt > 6:377464/1‑148 (MQ=255) cATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGa < 5:333056/149‑1 (MQ=255) tCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGatc < 2:77933/149‑1 (MQ=255) tCCGCACCAATGATTAGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGat > 5:315217/1‑148 (MQ=255) cGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGatca < 1:236831/148‑1 (MQ=255) cACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGatcat > 8:292761/1‑147 (MQ=255) cACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGAtcatca < 7:292761/149‑1 (MQ=255) cAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCg > 7:85967/1‑134 (MQ=255) cAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCg < 8:85967/134‑1 (MQ=255) cAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCt > 8:214309/1‑149 (MQ=255) aaTGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGATGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTCCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGAAGCAGTCATGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTc > 2:106739/1‑149 (MQ=255) tGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCgg > 5:255969/1‑149 (MQ=255) gATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGc > 4:231279/1‑149 (MQ=255) aTTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGc > 4:159981/1‑148 (MQ=255) tttGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCCGAGGGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGc > 1:108424/1‑149 (MQ=255) ttCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTg > 4:39900/1‑148 (MQ=255) ttCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTg < 8:342201/148‑1 (MQ=255) ttCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTg > 5:242403/1‑148 (MQ=255) aTTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTGAACt > 4:152378/1‑149 (MQ=255) aTTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTGAACt < 3:152378/149‑1 (MQ=255) cccTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAggcgccgtaaagggcaatgaacaaatcattggtgcggatgttgaaggcacggtccaggttcaccaggtcgacatcgtcacggctgcggaacacctgcccggcctgctc < 7:8321‑M2/148‑109 (MQ=255) ccTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTGAACTGGGcc > 8:138239/1‑149 (MQ=255) cTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAggcgccgtaaagggcaatgaacaaatcattggtgcggatgttgaaggcacggtccaggttcaccaggtcgacatcgtcacggctgcggaacacctgcccggcctgctccac < 1:318887‑M2/149‑112 (MQ=255) cTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTGACCTGGGccc > 3:253721/1‑149 (MQ=255) cGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAggcgccgtaaagggcaatgaacaaatcattggtgcggatgttgaaggcacggtccaggttcaccaggtcgacatcgtcacggctgcggaacacctgcccggcctgctccaccagg > 4:206481‑M2/1‑33 (MQ=255) cGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAggcgccgtaaagggcaatgaacaaatcattggtgcggatgttgaaggcacggtccaggttcaccaggtcgacatcgtcacggctgcggaacacctgcccggcctgctccaccagg < 3:206481‑M2/148‑116 (MQ=255) ggCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGTCCCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGtg < 1:231562/91‑1 (MQ=255) ggCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGCTGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTGAACTGGGCCCGGaaa > 5:312200/1‑148 (MQ=255) ggCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGtg > 2:231562/1‑90 (MQ=255) ggCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTGAACTGGGCCCGGaaa > 4:145392/1‑148 (MQ=255) gcgcCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTGAACTGGGCCCGGAAATc < 3:145392/149‑1 (MQ=255) cctgggccagcatcatgcgcagcagctgggcgccgtaaagggcaatgaacaaatcattggtgcggatgttgaaggcacggtccaggttcaccaggtcgacatcgtcacggctgcggaacacctgcccggcctgctcaaccaggccatg > 5:155258‑M1/1‑2 (MQ=255) cccAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAggcgccgtaaagggcaatgaacaaatcattggtgcggatgttgaaggcacggtccaggttcaccaggtcgacatcgtcacggctgcggaacacctgcccggcctgctccaccaggccatgc > 2:318887‑M2/1‑28 (MQ=255) cccAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGTGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTGAACTGTGCCCGGAAATCAAg < 2:108424/149‑1 (MQ=255) cccAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTGAACTGGGCCCGGAAATCAAg < 3:39900/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTGAACTGGGCCCGGAAATCAAgg < 6:315217/149‑1 (MQ=255) | CCCGTGCGTTGGCCCTGCGCGAGCAGGTGCATGGCCTGGTGGAGCAGGCCGGGC‑AGGTGTTCCGCAGCCGTGACGATGTCGACCTGGTGAACCTGGACCGTGCCTTCAACATCCGCACCAATGATTTGTTCATTGCCCTTTACGGCGCCCAGCTGCTGCGCATGATGCTGGCCCAGGCGCC‑‑GCGTACGGTGTTGCGGTTTGT‑CCCGGAGGGCAGTGGTGACGATGATGCAGTGCTGCGCAACGGGCATATCGACCTGATCATCAGCTCGGCCATTGAACTGGGCCCGGAAATCAAGG > NC_002947/1451001‑1451297 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |