New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2360109 = | 62 (1.030) | 5 (0.090) | 4/254 | NT | 7.2% | coding (1048/1134 nt) | PP_2075 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 3840158 | 70 (1.210) | coding (1081/1158 nt) | PP_3389 | membrane protein |
GATGGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTGGGC > NC_002947/2359965‑2360256 | gaccgagctggccgaaggtcatccgcgaggccggcctgcccggcaagccagtcccacccgtgacaaccctgagcgactaccctcccgcaatccaggcacgcctgctcgccaacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggccg > 4:118304‑M1/148‑149 (MQ=255) tgGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑tt < 3:209792/149‑1 (MQ=255) gATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTg < 3:69845/148‑1 (MQ=255) tttGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGc > 2:186836/1‑148 (MQ=255) cATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAg > 6:163156/1‑147 (MQ=255) cATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGc < 6:137017/148‑1 (MQ=255) aTCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAg < 1:114754/149‑1 (MQ=255) cGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGc > 2:61951/1‑149 (MQ=255) tgctgcAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGt > 5:96796/1‑149 (MQ=255) tgcAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGcc > 2:198618/1‑149 (MQ=255) cAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTg > 3:159236/1‑149 (MQ=255) atccgcgaggccggcctgcccggcaagccagtcccacccgtgacaaccctgagcgactaccctcccgcaatccaggcacgcctgctcgccaacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggccgg > 6:246101‑M1/128‑130 (MQ=255) atccgcgaggccggcctgcccggcaagccagtcccacccgtgacaaccctgagcgactaccctcccgcaatccaggcacgcctgctcgccaacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggccgg < 5:246101‑M1/3‑1 (MQ=255) gCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGc < 5:163156/149‑1 (MQ=255) gCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGATGGTTCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGCGCGCTTGAGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTCCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGAGCCTGGATTGc > 6:279407/1‑149 (MQ=25) tGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCgg > 7:213978/1‑149 (MQ=255) ccGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCgggt < 8:329532/149‑1 (MQ=255) ccGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCggg < 6:96796/148‑1 (MQ=255) ccGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCgg < 5:40733/147‑1 (MQ=255) gATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCgggtgg > 1:222584/1‑149 (MQ=255) gATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCgggtgg < 3:278941/149‑1 (MQ=255) gATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCgggtgg < 3:325008/149‑1 (MQ=255) gATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCgggtgg < 3:351650/149‑1 (MQ=255) gAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCgggtggg > 6:301141/1‑147 (MQ=255) tGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTGGTGTACCCCGCCCGGTTCCGGGGATTGAGAAGCCAGCGGTCGGAT‑‑‑‑‑‑‑AAGGAGACCAGGATTCCCTGATTTGCGGGTGGTTAg > 1:307219/1‑149 (MQ=255) gggTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTg > 1:250005/1‑124 (MQ=255) gggTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTg < 2:250005/124‑1 (MQ=255) gggTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAgg < 2:328702/149‑1 (MQ=255) gTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGt < 8:52688/149‑1 (MQ=255) tGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGtt > 4:113113/1‑149 (MQ=255) aGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGt > 5:249937/1‑148 (MQ=255) ttGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCAc < 8:213978/149‑1 (MQ=255) ggATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACgg > 6:376423/1‑149 (MQ=255) aGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTgg < 1:198618/148‑1 (MQ=255) gTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGTTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTggg > 6:225615/1‑148 (MQ=255) aCTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTg > 3:192747/1‑149 (MQ=255) aCTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTg > 7:2994/1‑149 (MQ=255) tttCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGt > 4:167818/1‑140 (MQ=255) tttCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGt < 3:167818/140‑1 (MQ=255) tttCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTgg < 7:65788/142‑1 (MQ=255) tttCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTgg > 8:65788/1‑142 (MQ=255) ttCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCt > 8:164939/1‑149 (MQ=255) tCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGc < 4:192747/147‑1 (MQ=255) ggCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCg < 5:301141/148‑1 (MQ=255) gTTGAGGATTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCGTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGTGTGGGTAGTCGATCAGGGTTGGCCCGGGTGGGACGGGCTTGCCGGGCAgg > 8:276162/1‑149 (MQ=14) aggagTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCGGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCTGGG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGTGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCa < 5:246552/143‑1 (MQ=255) aggagTAGAGCGCTATCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCAGGCCGCTTGCCCGGCTTCAGCTGCCAGCGGACTGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGCTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCGGGGCa > 6:246552/1‑143 (MQ=14) gagTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGTCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCCTGCCCGGCAagccagtc < 5:41287/149‑5 (MQ=14) gagTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCCTGCCCGGCAagccagtc < 4:159236/149‑5 (MQ=255) tAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCTGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCACTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAggccggccac < 6:292847/148‑3 (MQ=255) gagCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTcgcg > 1:180328/1‑149 (MQ=39) gagCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGCCTgcccggcaagcca < 3:100647/149‑7 (MQ=14) aggggttGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGGTTGCCGGGGTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCTGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGGTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTcgcg < 8:20005/143‑1 (MQ=11) agCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTc > 5:48987/1‑97 (MQ=255) agCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTc < 6:48987/97‑1 (MQ=255) cgcTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGAt > 4:79948/1‑149 (MQ=37) cTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGa < 3:113113/149‑1 (MQ=35) gCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCTGCCTCGCGGATGACCt > 7:286534/1‑149 (MQ=21) tGGGTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCg < 5:279460/149‑1 (MQ=17) ggTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCgg < 1:150923/149‑1 (MQ=34) tcgccaacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggcCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGc < 3:131279‑M1/107‑1 (MQ=255) caacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggcCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGAGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAgc < 7:40647‑M1/111‑1 (MQ=255) aacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggcCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAgcg < 8:200703‑M1/112‑1 (MQ=255) cgggctcTTGCCGGGGTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGTGCAGGCTTGCATTGATTGCTGGTGGTTAGTCGCTCTGGGTTGTCACGTGTGGGTCTGGCTTGCCGGGGAGTCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTc < 8:286534/143‑1 (MQ=11) cgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggcCGGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGAGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAg < 6:35444‑M1/117‑1 (MQ=255) cgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggcCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGAGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTc < 7:354338‑M1/117‑1 (MQ=255) gggCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTAGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCcagcacagca < 1:186836/149‑1 (MQ=17) gCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCt > 3:243041/1‑148 (MQ=32) tGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAg > 5:170432/1‑149 (MQ=32) ccAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGc > 5:296047/1‑148 (MQ=32) ggcCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTgg > 7:200703‑M1/4‑149 (MQ=255) tCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCAcagcagca > 3:295947/1‑133 (MQ=32) tCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCAcagcagca < 4:295947/133‑1 (MQ=32) tCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTGGGc > 2:325395/1‑149 (MQ=33) tCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTGGGc < 2:180328/149‑1 (MQ=33) | GATGGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTT‑‑T‑TTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCG‑‑‑‑‑‑‑TTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTGGGC > NC_002947/2359965‑2360256 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |