New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2555646 | 66 (1.100) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 5.4% | coding (1627/1881 nt) | PP_2240 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | = 2555690 | 76 (1.300) | coding (1671/1881 nt) | PP_2240 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
ACTTGCGTACCGTCATTGCCTACCCGGCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCGGAGATGCCGAGTGCATTGCT > NC_002947/2555503‑2555791 | aCTTGCGTACCGTCATTGCCTACCCGGCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACCTCCTCTCGGTGGGCGag > 3:336284/1‑149 (MQ=255) tGCGTACCGTCATTGCCTACCCGGCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGc < 8:342470/143‑1 (MQ=255) tGCGTACCGTCATTGCCTACCCGGCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGc > 7:342470/1‑143 (MQ=255) tACCGTCATTGCCTACCCGGCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCGGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGagcagcagc > 8:241077/1‑149 (MQ=255) tACCGTCATTGCCTACCCGGCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGagcagcagc < 1:358893/149‑1 (MQ=255) tACCGTCATTGCCTACCCGGCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGagcagc < 6:28218/146‑1 (MQ=255) tACCGTCATTGCCTACCCGGCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGagcagc > 5:28218/1‑146 (MQ=255) ccGTCATTGCCTACCCGGCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAgcgc > 2:83509/1‑149 (MQ=255) cGTCATTGCCTACCCGGCAGCCAGCAACCCAAAGGATGAAATGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTAAACCTGGCCCATATCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGGGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAgcgac > 1:95499/1‑147 (MQ=255) tGCCTACCCGGCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGt > 5:270011/1‑149 (MQ=255) cTACCCGGCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCg > 5:7870/1‑149 (MQ=255) ggCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCggg < 7:241077/149‑1 (MQ=255) agcgagcTACCCCAAGGATGAACTGGTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATGTCGCAGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTGGGTTGGCGAGCAGCAGCGCCTGGGGTTGGCCCggggg < 4:336284/148‑3 (MQ=255) cagcAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGgcgagcagcagcacccgggcgaacgccaggcgctgc < 5:364277‑M1/149‑37 (MQ=255) cccAAGGATGAACTGCTGATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTAGCCCGGGTGCTGTTCAACCg > 1:139907/1‑149 (MQ=255) aGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGCCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGcca > 1:83509‑M2/1‑146 (MQ=255) gAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGccggttgaacagcacccgggcgaacgccaggcgctgctgctcgcccaccgag < 5:102990‑M1/149‑53 (MQ=255) gAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAggt > 5:319502/1‑149 (MQ=255) aaCTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAggt < 7:79958/148‑1 (MQ=255) aCTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAggtgg > 8:17482/1‑149 (MQ=255) aCTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAggtgg > 1:140812/1‑149 (MQ=255) cTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGGTGTTCAACCGGC‑CACAggtggt > 8:228913/1‑149 (MQ=255) cTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAggtggt > 7:3014/1‑149 (MQ=255) cTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGtt > 5:157049/1‑149 (MQ=255) tCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTc > 1:266348/1‑149 (MQ=255) aTGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACGGGC‑CACAGGTGGTGTTCCt > 2:266885/1‑149 (MQ=255) tGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTc < 7:255686/149‑1 (MQ=255) agcagGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTcgac < 8:43616/149‑1 (MQ=255) agcagGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTcgac < 5:81808/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGt < 2:140812/149‑1 (MQ=255) gggcCAGGTTGACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCt > 6:176825/3‑149 (MQ=255) gcgcCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCt > 6:53902/1‑149 (MQ=255) gcCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCg > 5:83783/1‑149 (MQ=255) gcCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCg < 7:17482/149‑1 (MQ=255) gcCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTACTCGACGAGTCCACCTCg > 4:267452/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCgg < 2:63567/149‑1 (MQ=255) cAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTc < 7:343910/140‑1 (MQ=255) cAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTc > 8:343910/1‑140 (MQ=255) ttgaCCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATg < 5:176825/146‑1 (MQ=255) tCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATg < 8:3014/149‑1 (MQ=255) aaCGTGGCCCATCTCGCCTAGCGGCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGGAGCAGCGGCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACATGTGGTGTTCCTCGAGGAGTCCTCCTCTGCAATGGa < 4:360452/149‑1 (MQ=255) aaCCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGa < 2:266348/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGAt < 1:371306/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGAt > 5:319396/1‑149 (MQ=255) aCCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGAt > 7:45556/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGccggttgaacagcacccgggcgaacgccaggcgctgctgctcgcccaccga > 7:199972‑M1/1‑62 (MQ=255) ccTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGccggttgaacagcacccgggcgaacgccaggcgctgctgctcgcccaccga < 8:199972‑M1/113‑52 (MQ=255) ccTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACGGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATg < 1:266885/149‑1 (MQ=255) gCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAg < 4:170821/148‑1 (MQ=255) cATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCt > 3:185732/1‑149 (MQ=255) ggACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATg > 3:192157/1‑149 (MQ=255) gACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCAcc > 7:96963/1‑111 (MQ=255) gACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCAcc < 8:96963/111‑1 (MQ=255) gACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTAt < 6:7870/147‑1 (MQ=255) gTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGCTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCgtt > 3:173618/1‑149 (MQ=255) aGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCgttgtt > 3:141130/1‑149 (MQ=255) tgtgACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCg > 5:363594/1‑149 (MQ=255) tgtgACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGAATGGCGTTCGCCGGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGGCCTGTATGCGTTGTTGCg > 4:205702/1‑149 (MQ=255) aCTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAAc > 1:244827/1‑65 (MQ=255) aCTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAAc < 2:244827/65‑1 (MQ=255) aCTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCg < 6:319396/149‑1 (MQ=255) tGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGCACGCAGGTGGTGTTCCACGACGAGACCACATCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCg > 1:307863/1‑148 (MQ=255) gTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCg > 6:246627/1‑145 (MQ=255) tCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGaa > 3:191383/1‑108 (MQ=255) tCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGaa < 4:191383/108‑1 (MQ=255) acacaTCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCGGAGATGc > 3:116117/1‑149 (MQ=255) acaTCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCGGAGATGc > 4:167774/1‑147 (MQ=255) acaTCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCGGAGATGc < 3:167774/147‑1 (MQ=255) acaTCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGCGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCGGAGATGcc > 5:174838/1‑148 (MQ=255) ttctctctCGGTGGGCGAGGAGGAGCGGCTTGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTTGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTTGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCGGAGATGCCGa < 2:138085/145‑1 (MQ=255) caTCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCGGAGATGCCGa < 6:319502/149‑1 (MQ=255) aTCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCGGAGATGCCGAg > 2:107525/1‑149 (MQ=255) tctcGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTTGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCGGAGATGCCGa > 1:138085/1‑144 (MQ=255) tctcGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCGGAGATGCCGAGTGCa > 6:129147/1‑149 (MQ=255) ctcGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGccaccgagaggatgtgtgaccagtcacagctgacgtccagacgctcggcgagatgggccaggttgacctggcgcaacgcctgctgcatgagcagttc < 5:102990‑M2/149‑98 (MQ=255) tcGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGccaccgagaggatgtgtgaccagtcacagctgacgtccagacgctcggcgagatgggccagg > 7:199972‑M2/1‑51 (MQ=255) tcGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGccaccgagaggatgtgtgaccagtcacagctgacgtccagacgctcggcgagatgggccagg < 8:199972‑M2/113‑63 (MQ=255) ggTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCGGAGATGCCGAGTGCATTg < 4:192157/148‑1 (MQ=255) tGGccggttgaacagcacccgggcgaacgccaggcgctgctgctcggccaccgagaggatgtgtgaccagtcacagctgacgtccagacgctcggcgagatgggccaggttgacctggcgcaacgcctgctgcatgagcagttcatcct > 1:83509‑M1/1‑3 (MQ=255) | ACTTGCGTACCGTCATTGCCTACCCGGCAGCCAGCAACCCCAAGGATGAACTGCTCATGCAGCAGGCGTTGCGCCAGGTCAACCTGGCCCATCTCGCCGAGCGTCTGGACGTCAGCTGTGACTGGTCACACATCCTCTCGGTGGGCGAGCAGCAGCGCCTGGCGTTCGCCCGGGTGCTGTTCAACCGGC‑CACAGGTGGTGTTCCTCGACGAGTCCACCTCGGCAATGGATGAAGGGCTCGAGCATGCCCTGTATGCGTTGTTGCGTTCGGAGATGCCGAGTGCATTGCT > NC_002947/2555503‑2555791 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |